83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1983 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01660  predicted transporter  85.16 
 
 		 421 aa  719    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1491  major facilitator family transporter  99.51 
 
 		 411 aa  812    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0164303 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1472  major facilitator family protein  99.27 
 
 		 411 aa  810    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286209 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1456  transporter major facilitator family  99.51 
 
 		 411 aa  812    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0765913  normal  0.139077 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1505  major facilitator transporter  85.16 
 
 		 421 aa  719    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.890529  hitchhiker  0.000754157 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1940  major facilitator transporter  85.16 
 
 		 421 aa  719    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090025 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1812  transporter, major facilitator family  99.51 
 
 		 411 aa  812    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1907  major facilitator transporter  85.4 
 
 		 423 aa  721    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1772  major facilitator transporter  85.16 
 
 		 423 aa  719    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1983  major facilitator family transporter  100 
 
 		 411 aa  816    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000795412 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2407  transporter, major facilitator family  85.4 
 
 		 421 aa  721    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.197436 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1384  major facilitator superfamily MFS_1  74.94 
 
 		 422 aa  638    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01649  hypothetical protein  85.16 
 
 		 421 aa  719    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1951  major facilitator superfamily MFS_1  85.37 
 
 		 421 aa  719    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.214686  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2184  permease  39.32 
 
 		 422 aa  298  9e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.23848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2189  putative transport system permease protein  39.36 
 
 		 408 aa  285  9e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1506  major facilitator family transporter  38.4 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340818  hitchhiker  0.000395679 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1941  major facilitator transporter  38.14 
 
 		 404 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.923029  hitchhiker  0.000874845 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1906  major facilitator family transporter  38.12 
 
 		 404 aa  266  4e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1952  major facilitator superfamily MFS_1  37.89 
 
 		 404 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.17424  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1457  inner membrane transport protein YdiM  36.29 
 
 		 413 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0786899  normal  0.351467 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1771  major facilitator family transporter  38.42 
 
 		 393 aa  263  3e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1492  inner membrane transport protein YdiM  36.92 
 
 		 403 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.915768  normal  0.0211513 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1473  inner membrane transport protein YdiM  36.92 
 
 		 402 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179045 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1811  inner membrane transport protein YdiM  36.92 
 
 		 403 aa  262  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2406  major facilitator family transporter  37.47 
 
 		 384 aa  248  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.114813 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1382  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 413 aa  246  4e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1982  inner membrane transport protein YdiM  35.42 
 
 		 380 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218358 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1894  transporter, major facilitator family  87.8 
 
 		 139 aa  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1891  transporter, major facilitator family  87.96 
 
 		 112 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0066  major facilitator superfamily permease  28.5 
 
 		 401 aa  160  3e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.110022  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0148  major facilitator superfamily permease  29.28 
 
 		 395 aa  154  2e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09330  arabinose efflux permease family protein  26.82 
 
 		 440 aa  110  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000513104  normal  0.568099 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08740  Major Facilitator Superfamily transporter  25.43 
 
 		 452 aa  96.3  9e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.240638 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0509  hypothetical protein  24.29 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0551  hypothetical protein  23.37 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3954  hypothetical protein  24.63 
 
 		 394 aa  57  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0238  hypothetical protein  24.63 
 
 		 394 aa  57  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2271  hypothetical protein  25 
 
 		 393 aa  55.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.223417  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3713  hypothetical protein  24.44 
 
 		 380 aa  54.3  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4593  hypothetical protein  24.67 
 
 		 394 aa  53.9  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 425 aa  53.1  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 400 aa  52.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0680  major facilitator superfamily MFS_1  23.24 
 
 		 384 aa  51.6  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.668541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2281  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.47 
 
 		 412 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  24.83 
 
 		 406 aa  50.4  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3740  hypothetical protein  23.02 
 
 		 393 aa  49.7  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4675  hypothetical protein  23.02 
 
 		 393 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.398829 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03215  hypothetical protein  23.02 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03167  hypothetical protein  23.02 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3646  hypothetical protein  22.64 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.865659  hitchhiker  0.000149858 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0348  hypothetical protein  23.02 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3833  hypothetical protein  23.02 
 
 		 393 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3560  hypothetical protein  23.02 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0348  major facilitator superfamily MFS_1  23.02 
 
 		 393 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1698  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 407 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1941  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.47 
 
 		 426 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3964  transporter, putative  28.12 
 
 		 407 aa  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000523123  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2151  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 426 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  25.11 
 
 		 405 aa  45.8  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  27.45 
 
 		 466 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0855  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.19 
 
 		 435 aa  45.1  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000185611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2509  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.36 
 
 		 389 aa  45.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1438  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.17 
 
 		 412 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.61616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.5 
 
 		 461 aa  44.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 		 518 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  27.17 
 
 		 468 aa  43.9  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  24.64 
 
 		 474 aa  43.9  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4040  major facilitator transporter  19.9 
 
 		 435 aa  44.3  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248694  decreased coverage  0.0016848 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0685  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25 
 
 		 386 aa  43.9  0.005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0211006  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2303  protein of unknown function DUF894 DitE  27.78 
 
 		 536 aa  43.5  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3670  hypothetical protein  23.33 
 
 		 393 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 		 520 aa  43.1  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1274  major facilitator family transporter  25.53 
 
 		 406 aa  42.7  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116564  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 		 403 aa  43.1  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1032  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  25.53 
 
 		 408 aa  43.1  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1806  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  25.53 
 
 		 408 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1761  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  25.53 
 
 		 408 aa  43.1  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5470  major facilitator transporter  22.64 
 
 		 461 aa  43.1  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1959  major facilitator family transporter  25.53 
 
 		 408 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1785  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  25.53 
 
 		 408 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.669865  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0134  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  25.53 
 
 		 408 aa  43.1  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1232  major facilitator transporter  23.4 
 
 		 421 aa  43.1  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>