63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3740 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0348  major facilitator superfamily MFS_1  99.24 
 
 		 393 aa  784    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3833  hypothetical protein  99.24 
 
 		 393 aa  784    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3560  hypothetical protein  99.75 
 
 		 393 aa  788    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0348  hypothetical protein  99.75 
 
 		 393 aa  788    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3791  hypothetical protein  87.24 
 
 		 394 aa  693    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3646  hypothetical protein  98.73 
 
 		 393 aa  781    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.865659  hitchhiker  0.000149858 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03215  hypothetical protein  99.49 
 
 		 393 aa  785    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3740  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  790    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3743  hypothetical protein  90.59 
 
 		 393 aa  722    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0396479 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3778  hypothetical protein  90.84 
 
 		 393 aa  722    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.974681 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3670  hypothetical protein  90.59 
 
 		 393 aa  723    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3670  hypothetical protein  90.59 
 
 		 393 aa  722    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.279689  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3841  hypothetical protein  90.84 
 
 		 393 aa  723    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4675  hypothetical protein  98.98 
 
 		 393 aa  781    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.398829 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03167  hypothetical protein  99.49 
 
 		 393 aa  785    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4593  hypothetical protein  76.08 
 
 		 394 aa  598  1e-170  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3954  hypothetical protein  74.3 
 
 		 394 aa  595  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0238  hypothetical protein  74.3 
 
 		 394 aa  595  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3713  hypothetical protein  73.88 
 
 		 380 aa  569  1e-161  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0509  hypothetical protein  69.57 
 
 		 397 aa  545  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2271  hypothetical protein  67.85 
 
 		 393 aa  537  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.223417  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0551  hypothetical protein  66.75 
 
 		 398 aa  526  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2681  hypothetical protein  26.73 
 
 		 405 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.433082  hitchhiker  0.00146512 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3423  hypothetical protein  24.23 
 
 		 392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3272  hypothetical protein  25.06 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.388567  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2502  hypothetical protein  23.86 
 
 		 394 aa  126  6e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.156303  hitchhiker  0.000706101 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09450  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 		 422 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00253075  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1658  hypothetical protein  24.87 
 
 		 384 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0600351  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3785  hypothetical protein  22.96 
 
 		 390 aa  124  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2718  hypothetical protein  24.34 
 
 		 384 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1839  hypothetical protein  23.21 
 
 		 391 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157174  normal  0.968592 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3368  L-fucose transporter  25 
 
 		 413 aa  53.1  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  26.19 
 
 		 424 aa  53.1  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  22.46 
 
 		 405 aa  52.4  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1472  major facilitator family protein  23.02 
 
 		 411 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286209 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1983  major facilitator family transporter  23.02 
 
 		 411 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000795412 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  20.38 
 
 		 425 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1812  transporter, major facilitator family  23.02 
 
 		 411 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1491  major facilitator family transporter  23.02 
 
 		 411 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0164303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1456  transporter major facilitator family  23.02 
 
 		 411 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0765913  normal  0.139077 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  21.25 
 
 		 415 aa  47.8  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  21.25 
 
 		 415 aa  47.4  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4329  major facilitator superfamily MFS_1  24.02 
 
 		 420 aa  47  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  24.68 
 
 		 405 aa  46.2  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  22.75 
 
 		 449 aa  46.2  0.0009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1384  major facilitator superfamily MFS_1  24.25 
 
 		 422 aa  46.2  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4371  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 368 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1395  glucose/galactose transporter  26.67 
 
 		 431 aa  46.2  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.774597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3437  L-fucose transporter  23.4 
 
 		 412 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697396  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  21.63 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  31.25 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  27.53 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2463  MFS transporter  24.88 
 
 		 431 aa  45.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  27.53 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  23.16 
 
 		 413 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  25.29 
 
 		 428 aa  44.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  25.87 
 
 		 389 aa  44.7  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  25.42 
 
 		 426 aa  43.9  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  24.86 
 
 		 426 aa  43.9  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  24.77 
 
 		 408 aa  43.5  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  24.77 
 
 		 408 aa  43.5  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1494  L-fucose transporter  23.76 
 
 		 414 aa  43.5  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.289824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  22.39 
 
 		 428 aa  43.1  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>