37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1839 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_2718  hypothetical protein  92.67 
 
 
384 aa  686    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2502  hypothetical protein  90.79 
 
 
394 aa  713    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.156303  hitchhiker  0.000706101 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1839  hypothetical protein  100 
 
 
391 aa  775    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157174  normal  0.968592 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1658  hypothetical protein  91.1 
 
 
384 aa  681    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0600351  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3272  hypothetical protein  76.7 
 
 
392 aa  608  1e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.388567  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3423  hypothetical protein  76.64 
 
 
392 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3785  hypothetical protein  77.32 
 
 
390 aa  578  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2271  hypothetical protein  25.96 
 
 
393 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.223417  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2681  hypothetical protein  25.46 
 
 
405 aa  145  8.000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.433082  hitchhiker  0.00146512 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0238  hypothetical protein  24.4 
 
 
394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3954  hypothetical protein  24.4 
 
 
394 aa  140  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4593  hypothetical protein  24.74 
 
 
394 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3713  hypothetical protein  24.07 
 
 
380 aa  132  9e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0509  hypothetical protein  22.91 
 
 
397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0348  major facilitator superfamily MFS_1  23.47 
 
 
393 aa  127  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3833  hypothetical protein  23.47 
 
 
393 aa  127  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3560  hypothetical protein  23.21 
 
 
393 aa  126  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0348  hypothetical protein  23.21 
 
 
393 aa  126  7e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3646  hypothetical protein  23.72 
 
 
393 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.865659  hitchhiker  0.000149858 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3740  hypothetical protein  23.21 
 
 
393 aa  126  9e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4675  hypothetical protein  23.47 
 
 
393 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.398829 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03215  hypothetical protein  23.21 
 
 
393 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03167  hypothetical protein  23.21 
 
 
393 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0551  hypothetical protein  24.25 
 
 
398 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3670  hypothetical protein  23.33 
 
 
393 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3841  hypothetical protein  23.72 
 
 
393 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933183  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3743  hypothetical protein  23.47 
 
 
393 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0396479 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3670  hypothetical protein  23.47 
 
 
393 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.279689  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3778  hypothetical protein  23.47 
 
 
393 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.974681 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3791  hypothetical protein  23.32 
 
 
394 aa  115  8.999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09450  major facilitator superfamily MFS_1  22.34 
 
 
422 aa  68.9  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00253075  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  25.6 
 
 
395 aa  66.6  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 
433 aa  51.6  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  20.96 
 
 
397 aa  47.4  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0351  major facilitator superfamily permease  24.84 
 
 
415 aa  46.2  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.642789  hitchhiker  0.00154369 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3527  major facilitator transporter  28 
 
 
428 aa  43.5  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0989887 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  28.1 
 
 
425 aa  43.1  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>