135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1384 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01660  predicted transporter  75.79 
 
 		 421 aa  651    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1951  major facilitator superfamily MFS_1  75.54 
 
 		 421 aa  649    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.214686  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1384  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 422 aa  829    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1772  major facilitator transporter  75.79 
 
 		 423 aa  651    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1907  major facilitator transporter  75.79 
 
 		 423 aa  651    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01649  hypothetical protein  75.79 
 
 		 421 aa  651    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1940  major facilitator transporter  75.79 
 
 		 421 aa  651    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090025 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1505  major facilitator transporter  75.79 
 
 		 421 aa  652    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.890529  hitchhiker  0.000754157 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2407  transporter, major facilitator family  75.79 
 
 		 421 aa  650    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.197436 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1472  major facilitator family protein  75.18 
 
 		 411 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286209 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1491  major facilitator family transporter  75.18 
 
 		 411 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0164303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1456  transporter major facilitator family  75.18 
 
 		 411 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0765913  normal  0.139077 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1812  transporter, major facilitator family  75.18 
 
 		 411 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1983  major facilitator family transporter  74.94 
 
 		 411 aa  631  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000795412 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2184  permease  41.09 
 
 		 422 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.23848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2189  putative transport system permease protein  37.12 
 
 		 408 aa  271  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1457  inner membrane transport protein YdiM  35.77 
 
 		 413 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0786899  normal  0.351467 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1473  inner membrane transport protein YdiM  37.43 
 
 		 402 aa  269  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179045 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1492  inner membrane transport protein YdiM  37.17 
 
 		 403 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.915768  normal  0.0211513 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1811  inner membrane transport protein YdiM  37.17 
 
 		 403 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1906  major facilitator family transporter  35.32 
 
 		 404 aa  264  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1941  major facilitator transporter  35.32 
 
 		 404 aa  264  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.923029  hitchhiker  0.000874845 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1952  major facilitator superfamily MFS_1  35.06 
 
 		 404 aa  263  3e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.17424  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1506  major facilitator family transporter  35.06 
 
 		 404 aa  263  3e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340818  hitchhiker  0.000395679 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1771  major facilitator family transporter  35.73 
 
 		 393 aa  259  6e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1382  major facilitator superfamily MFS_1  35.35 
 
 		 413 aa  249  5e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2406  major facilitator family transporter  34.97 
 
 		 384 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.114813 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1982  inner membrane transport protein YdiM  34.55 
 
 		 380 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218358 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1894  transporter, major facilitator family  73.81 
 
 		 139 aa  189  5.999999999999999e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1891  transporter, major facilitator family  77.48 
 
 		 112 aa  184  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0066  major facilitator superfamily permease  31.59 
 
 		 401 aa  170  3e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.110022  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0148  major facilitator superfamily permease  28.9 
 
 		 395 aa  150  5e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09330  arabinose efflux permease family protein  27.44 
 
 		 440 aa  117  3.9999999999999997e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000513104  normal  0.568099 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08740  Major Facilitator Superfamily transporter  26.3 
 
 		 452 aa  99  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.240638 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  25.5 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.7 
 
 		 461 aa  54.7  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1698  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 407 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1959  major facilitator family transporter  28.33 
 
 		 408 aa  53.5  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1761  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.33 
 
 		 408 aa  53.5  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0134  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.33 
 
 		 408 aa  53.5  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1785  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.33 
 
 		 408 aa  53.1  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.669865  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1806  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.33 
 
 		 408 aa  53.5  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1032  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.33 
 
 		 408 aa  53.5  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1274  major facilitator family transporter  28.33 
 
 		 406 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116564  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4040  major facilitator transporter  24.69 
 
 		 435 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248694  decreased coverage  0.0016848 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  28.15 
 
 		 402 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2527  major facilitator family transporter  29.28 
 
 		 408 aa  51.2  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.039546  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3964  transporter, putative  26.97 
 
 		 407 aa  51.6  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000523123  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 425 aa  50.1  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0509  hypothetical protein  24.66 
 
 		 397 aa  49.7  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1438  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.66 
 
 		 412 aa  49.7  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.61616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0855  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.56 
 
 		 435 aa  49.7  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000185611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  27.41 
 
 		 414 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.31 
 
 		 416 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03084  sialic acid transporter  24.43 
 
 		 496 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0482  sialic acid transporter  24.43 
 
 		 496 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4541  putative sialic acid transporter  24.43 
 
 		 496 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.315393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3963  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 385 aa  48.9  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  24.91 
 
 		 381 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3660  putative sialic acid transporter  23.44 
 
 		 495 aa  48.9  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723795  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03035  hypothetical protein  24.43 
 
 		 496 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3412  putative sialic acid transporter  24.43 
 
 		 496 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.510281  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3706  putative sialic acid transporter  24.43 
 
 		 496 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.322469  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0482  putative sialic acid transporter  24.43 
 
 		 496 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3519  putative sialic acid transporter  24.43 
 
 		 496 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3552  putative sialic acid transporter  24.43 
 
 		 496 aa  48.5  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 		 400 aa  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3670  hypothetical protein  23.05 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1015  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 		 479 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.449105 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  23.51 
 
 		 468 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0551  hypothetical protein  22.87 
 
 		 398 aa  47.8  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.33 
 
 		 401 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4676  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 420 aa  47.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573448  normal  0.215223 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3841  hypothetical protein  23.05 
 
 		 393 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1232  major facilitator transporter  22.7 
 
 		 421 aa  47  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1904  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.09 
 
 		 425 aa  47  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.97 
 
 		 502 aa  47.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3601  putative sialic acid transporter  23.66 
 
 		 496 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3698  putative sialic acid transporter  23.66 
 
 		 496 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4593  hypothetical protein  23.83 
 
 		 394 aa  47  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2780  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.32 
 
 		 399 aa  47  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.118826 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3636  putative sialic acid transporter  23.66 
 
 		 496 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3531  putative sialic acid transporter  23.66 
 
 		 496 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3529  putative sialic acid transporter  24.56 
 
 		 496 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4675  hypothetical protein  24.25 
 
 		 393 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.398829 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1418  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 406 aa  46.6  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0348  major facilitator superfamily MFS_1  24.25 
 
 		 393 aa  46.6  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3833  hypothetical protein  24.25 
 
 		 393 aa  46.6  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.06 
 
 		 409 aa  46.6  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03215  hypothetical protein  24.25 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03167  hypothetical protein  24.25 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0062  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.7183  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3560  hypothetical protein  24.25 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0348  hypothetical protein  24.25 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3646  hypothetical protein  23.88 
 
 		 393 aa  45.8  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.865659  hitchhiker  0.000149858 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1458  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3740  hypothetical protein  24.25 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3743  hypothetical protein  22.73 
 
 		 393 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0396479 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  24.88 
 
 		 405 aa  46.2  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3670  hypothetical protein  22.73 
 
 		 393 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.279689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>