53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1940 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B1812  transporter, major facilitator family  85.4 
 
 		 411 aa  709    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1907  major facilitator transporter  99.52 
 
 		 423 aa  835    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1940  major facilitator transporter  100 
 
 		 421 aa  838    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090025 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1772  major facilitator transporter  100 
 
 		 423 aa  838    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1505  major facilitator transporter  98.81 
 
 		 421 aa  829    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.890529  hitchhiker  0.000754157 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01660  predicted transporter  100 
 
 		 421 aa  838    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1472  major facilitator family protein  85.4 
 
 		 411 aa  709    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286209 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1491  major facilitator family transporter  85.4 
 
 		 411 aa  709    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0164303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1456  transporter major facilitator family  85.4 
 
 		 411 aa  709    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0765913  normal  0.139077 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1983  major facilitator family transporter  85.16 
 
 		 411 aa  705    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000795412 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2407  transporter, major facilitator family  99.76 
 
 		 421 aa  836    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.197436 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1384  major facilitator superfamily MFS_1  75.79 
 
 		 422 aa  651    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01649  hypothetical protein  100 
 
 		 421 aa  838    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1951  major facilitator superfamily MFS_1  99.76 
 
 		 421 aa  835    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.214686  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2184  permease  39.51 
 
 		 422 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.23848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2189  putative transport system permease protein  38.62 
 
 		 408 aa  279  5e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1894  transporter, major facilitator family  100 
 
 		 139 aa  268  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1457  inner membrane transport protein YdiM  35.79 
 
 		 413 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0786899  normal  0.351467 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1492  inner membrane transport protein YdiM  36.48 
 
 		 403 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.915768  normal  0.0211513 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1811  inner membrane transport protein YdiM  36.48 
 
 		 403 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1473  inner membrane transport protein YdiM  36.22 
 
 		 402 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179045 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1506  major facilitator family transporter  36.88 
 
 		 404 aa  258  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340818  hitchhiker  0.000395679 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1906  major facilitator family transporter  36.62 
 
 		 404 aa  256  4e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1941  major facilitator transporter  36.62 
 
 		 404 aa  256  4e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.923029  hitchhiker  0.000874845 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1952  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 404 aa  256  6e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.17424  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1771  major facilitator family transporter  37.07 
 
 		 393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1382  major facilitator superfamily MFS_1  36.27 
 
 		 413 aa  245  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2406  major facilitator family transporter  36.07 
 
 		 384 aa  238  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.114813 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1982  inner membrane transport protein YdiM  34.18 
 
 		 380 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218358 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1891  transporter, major facilitator family  96.3 
 
 		 112 aa  212  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0148  major facilitator superfamily permease  31.25 
 
 		 395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0066  major facilitator superfamily permease  30.17 
 
 		 401 aa  162  8.000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.110022  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09330  arabinose efflux permease family protein  25.26 
 
 		 440 aa  107  5e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000513104  normal  0.568099 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08740  Major Facilitator Superfamily transporter  23.11 
 
 		 452 aa  87.4  4e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.240638 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0551  hypothetical protein  24.66 
 
 		 398 aa  50.4  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 		 400 aa  49.3  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4040  major facilitator transporter  22.39 
 
 		 435 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248694  decreased coverage  0.0016848 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  21.59 
 
 		 425 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4593  hypothetical protein  23.97 
 
 		 394 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5470  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 461 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2281  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  24.53 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1438  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.62 
 
 		 412 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.61616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3954  hypothetical protein  24.44 
 
 		 394 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0509  hypothetical protein  22.43 
 
 		 397 aa  45.8  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  30.53 
 
 		 466 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0238  hypothetical protein  24.44 
 
 		 394 aa  45.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  23.89 
 
 		 406 aa  44.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03799  MFS transporter  30 
 
 		 524 aa  44.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1698  major facilitator transporter  29.36 
 
 		 407 aa  43.5  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2477  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 416 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0680  major facilitator superfamily MFS_1  22.65 
 
 		 384 aa  43.1  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.668541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  23.97 
 
 		 381 aa  43.1  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3713  hypothetical protein  24.25 
 
 		 380 aa  43.1  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>