15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0483 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0483  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
354 aa  668    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0250  major facilitator superfamily MFS_1  41.33 
 
 
367 aa  188  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.651007  normal  0.954901 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1293  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 
407 aa  60.1  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.234354 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1304  major facilitator transporter  27.37 
 
 
390 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0901  major facilitator transporter  34.88 
 
 
376 aa  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0420  major facilitator superfamily MFS_1  33.08 
 
 
460 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0275  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 
371 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  28.04 
 
 
395 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0838  major facilitator family transporter  34.41 
 
 
397 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1174  major facilitator transporter  26.52 
 
 
379 aa  47  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.394628  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  26.61 
 
 
395 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0309  major facilitator superfamily MFS_1  24.38 
 
 
394 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  0.0116051 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11209  hypothetical protein  25.16 
 
 
440 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1163  hypothetical protein  27.51 
 
 
391 aa  44.3  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38877  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3220  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 
463 aa  43.1  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0542188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>