15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0250 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0250  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 367 aa  701    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.651007  normal  0.954901 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0483  major facilitator superfamily MFS_1  42.2 
 
 		 354 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1174  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.394628  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1163  hypothetical protein  31.35 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 395 aa  53.5  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01506  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G05090)  24.86 
 
 		 417 aa  50.8  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0010  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 376 aa  47.4  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000260757 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0723  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 404 aa  46.6  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475957 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  31.05 
 
 		 431 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0275  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 		 371 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3643  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 398 aa  43.5  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0314134  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1293  major facilitator superfamily MFS_1  28.98 
 
 		 407 aa  43.1  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.234354 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0901  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 376 aa  43.1  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03315  MFS permease  24.69 
 
 		 367 aa  42.7  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3646  hypothetical protein  23.82 
 
 		 393 aa  42.7  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.865659  hitchhiker  0.000149858 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>