53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0038 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0038  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
355 aa  671    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0741  major facilitator transporter  49.16 
 
 
355 aa  322  9.000000000000001e-87  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.662794  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1153  major facilitator transporter  34.65 
 
 
367 aa  163  4.0000000000000004e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0530  major facilitator transporter  29.71 
 
 
360 aa  122  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0660  major facilitator transporter  27.75 
 
 
361 aa  107  4e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0644  major facilitator transporter  31.43 
 
 
362 aa  100  4e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.592278  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  37.74 
 
 
406 aa  67  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  37.74 
 
 
406 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  32.68 
 
 
387 aa  55.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5220  multidrug resistance protein  28.7 
 
 
387 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5052  multidrug resistance protein; permease  28.7 
 
 
387 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5463  putative multidrug resistance protein  28.7 
 
 
387 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5620  multidrug resistance protein  28.7 
 
 
387 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5493  putative multidrug resistance protein  27.83 
 
 
387 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5501  multidrug resistance protein, putative  27.83 
 
 
387 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5549  putative multidrug resistance protein  27.83 
 
 
387 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5068  multidrug resistance protein; permease  27.83 
 
 
387 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5457  putative multidrug resistance protein  26.96 
 
 
387 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3885  major facilitator transporter  26.96 
 
 
381 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5165  major facilitator transporter  26.96 
 
 
387 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0563  major facilitator transporter  34.88 
 
 
425 aa  52.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  30.13 
 
 
406 aa  49.3  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0648  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 
402 aa  48.1  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2877  major facilitator transporter  27.66 
 
 
397 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  32.86 
 
 
456 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05310  arabinose efflux permease family protein  28.26 
 
 
400 aa  46.6  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1255  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 
385 aa  46.6  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4000  major facilitator transporter  27.14 
 
 
408 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  31.76 
 
 
395 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2822  major facilitator superfamily MFS_1  39.71 
 
 
415 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3444  major facilitator transporter  30.08 
 
 
403 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.39865 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2329  major facilitator transporter  30.7 
 
 
479 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371241  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2611  major facilitator transporter  28.8 
 
 
400 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3496  major facilitator superfamily transporter  30.08 
 
 
403 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.950594  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3433  major facilitator transporter  30.08 
 
 
403 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0912154  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1507  major facilitator transporter  33.33 
 
 
411 aa  44.7  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0877  major facilitator superfamily MFS_1  24.16 
 
 
458 aa  43.9  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  22.77 
 
 
435 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  26.9 
 
 
466 aa  43.5  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 
418 aa  43.9  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  22.96 
 
 
427 aa  43.5  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4329  major facilitator superfamily MFS_1  32.76 
 
 
420 aa  43.5  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  26.95 
 
 
437 aa  43.1  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2435  major facilitator transporter  30.17 
 
 
431 aa  43.1  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  23.53 
 
 
440 aa  43.1  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40779  predicted protein  28.97 
 
 
685 aa  43.1  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  23.33 
 
 
391 aa  42.7  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 
417 aa  42.7  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1329  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 
394 aa  42.7  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3781  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 
407 aa  42.7  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  21.77 
 
 
439 aa  42.7  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  23.39 
 
 
435 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15670  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.83 
 
 
396 aa  42.7  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.789382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>