139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0530 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0530  major facilitator transporter  100 
 
 		 360 aa  688    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0660  major facilitator transporter  59.55 
 
 		 361 aa  387  1e-106  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0644  major facilitator transporter  61.71 
 
 		 362 aa  370  1e-101  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.592278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1153  major facilitator transporter  33.43 
 
 		 367 aa  159  9e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0741  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 355 aa  145  1e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.662794  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0038  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 		 355 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  32.74 
 
 		 440 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1729  major facilitator transporter  36.07 
 
 		 423 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1776  major facilitator superfamily transporter  36.07 
 
 		 423 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1708  major facilitator transporter  36.07 
 
 		 423 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841617  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  32.62 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2555  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 434 aa  58.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0238485  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2729  drug resistance transporter, putative  30.71 
 
 		 469 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  25.19 
 
 		 388 aa  57  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  25.19 
 
 		 388 aa  57  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  26.39 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 487 aa  56.6  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2233  major facilitator superfamily MFS_1  35.25 
 
 		 422 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000391707 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7319  major facilitator transporter  29.7 
 
 		 452 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  25.24 
 
 		 418 aa  54.3  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  29.94 
 
 		 403 aa  53.9  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1452  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 475 aa  53.9  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1421  major facilitator superfamily MFS_1  31.06 
 
 		 462 aa  53.1  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.756224  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  32.76 
 
 		 390 aa  52.8  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1778  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 474 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000929318  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5165  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 387 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0891  major facilitator transporter  28 
 
 		 470 aa  51.6  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 432 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  26.18 
 
 		 387 aa  51.2  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2493  major facilitator transporter  31.85 
 
 		 420 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.995351  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1772  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 456 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 407 aa  50.4  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  26.82 
 
 		 453 aa  50.8  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  33.08 
 
 		 465 aa  50.4  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5501  multidrug resistance protein, putative  27.35 
 
 		 387 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 387 aa  50.1  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5493  putative multidrug resistance protein  27.35 
 
 		 387 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5457  putative multidrug resistance protein  27.35 
 
 		 387 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5068  multidrug resistance protein; permease  27.35 
 
 		 387 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  33.83 
 
 		 465 aa  50.1  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1035  major facilitator transporter  29.86 
 
 		 456 aa  50.1  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.46638  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5549  putative multidrug resistance protein  27.35 
 
 		 387 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5220  multidrug resistance protein  27.35 
 
 		 387 aa  49.7  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5052  multidrug resistance protein; permease  27.35 
 
 		 387 aa  49.7  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0582  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 		 432 aa  49.7  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5620  multidrug resistance protein  27.35 
 
 		 387 aa  49.7  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5463  putative multidrug resistance protein  27.35 
 
 		 387 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 466 aa  49.7  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 456 aa  49.7  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1157  major facilitator family transporter  26.85 
 
 		 459 aa  49.7  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 		 395 aa  49.7  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  29.45 
 
 		 445 aa  49.3  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1255  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 385 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 385 aa  48.9  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3885  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 381 aa  49.3  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.89 
 
 		 534 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2783  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 409 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 466 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  34.21 
 
 		 434 aa  48.5  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 406 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  28.03 
 
 		 426 aa  47.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1312  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 388 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.69 
 
 		 474 aa  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1765  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 471 aa  47.4  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.719018  decreased coverage  0.000452829 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  28.03 
 
 		 426 aa  47.4  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.3 
 
 		 474 aa  47.4  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0834  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 433 aa  47.4  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.789702 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2289  major facilitator superfamily MFS_1  26.35 
 
 		 483 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2216  major facilitator superfamily transporter  29.28 
 
 		 411 aa  47  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.167097 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2645  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 		 474 aa  47  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000155318  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 438 aa  46.6  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1367  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 		 446 aa  46.6  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2484  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 		 437 aa  46.6  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8983  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.08 
 
 		 495 aa  46.2  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49086  MFS family transporter: sugar (sialic acid)  30.2 
 
 		 506 aa  46.2  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0133076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2612  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 433 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.209857  normal  0.81136 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 417 aa  46.2  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 454 aa  46.2  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 425 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1017  major facilitator superfamily MFS_1  28.82 
 
 		 525 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 		 439 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0354  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-2 (14 Spanner) (DHA2) family protein  23.96 
 
 		 542 aa  45.8  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3964  transporter, putative  27.47 
 
 		 407 aa  45.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000523123  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.03 
 
 		 472 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05310  arabinose efflux permease family protein  29.2 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1329  major facilitator superfamily MFS_1  29.45 
 
 		 394 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1767  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 473 aa  44.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.81 
 
 		 521 aa  44.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0791  major facilitator superfamily MFS_1  31.21 
 
 		 434 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.039054  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.71 
 
 		 478 aa  45.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1773  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 		 441 aa  45.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3222  major facilitator superfamily MFS_1  31.54 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.40917  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0795  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.65 
 
 		 499 aa  45.4  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000774883  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  26.19 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  25.76 
 
 		 492 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1541  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 491 aa  44.3  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0291069  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 440 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2429  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00087995  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>