More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2289 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2289  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 483 aa  956    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1541  major facilitator transporter  43.6 
 
 		 491 aa  379  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0291069  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2827  major facilitator superfamily MFS_1  44.8 
 
 		 500 aa  355  1e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.158214  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8106  major facilitator superfamily MFS_1  42.51 
 
 		 502 aa  345  8e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  26.71 
 
 		 428 aa  96.7  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 		 407 aa  92.8  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  25.79 
 
 		 426 aa  91.7  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  26.21 
 
 		 456 aa  90.1  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  24.75 
 
 		 453 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 430 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 423 aa  87  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 423 aa  87  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 440 aa  86.7  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0582  major facilitator superfamily MFS_1  32.47 
 
 		 432 aa  85.9  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3215  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 430 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  24.68 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  26 
 
 		 461 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  24.38 
 
 		 463 aa  83.6  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  26.37 
 
 		 461 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  24.71 
 
 		 454 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  23.59 
 
 		 460 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  23.94 
 
 		 454 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  23.94 
 
 		 454 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0899  d-galactonate transporter  22.98 
 
 		 450 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  24.49 
 
 		 429 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3084  glucarate permease  22.98 
 
 		 440 aa  80.9  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567935  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02634  predicted D-glucarate transporter  22.98 
 
 		 450 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02596  hypothetical protein  22.98 
 
 		 450 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2927  glucarate permease  22.98 
 
 		 450 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0923  d-galactonate transporter  22.98 
 
 		 450 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3093  glucarate permease  22.98 
 
 		 450 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.110237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2933  glucarate permease  22.98 
 
 		 450 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1401  major facilitator superfamily MFS_1  22.02 
 
 		 434 aa  80.5  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270057  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5075  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 430 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4050  glucarate permease  22.98 
 
 		 450 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  24.63 
 
 		 430 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  24.16 
 
 		 429 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  23.52 
 
 		 422 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3184  glucarate permease  23.72 
 
 		 452 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.513823 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3283  glucarate permease  23.91 
 
 		 452 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129198  normal  0.747059 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3121  glucarate permease  23.72 
 
 		 452 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  23.57 
 
 		 460 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0231  major facilitator transporter  24.22 
 
 		 409 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3103  glucarate permease  23.72 
 
 		 452 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3168  glucarate permease  23.72 
 
 		 452 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.101605 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  23.73 
 
 		 435 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  23.94 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  23.49 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  24.78 
 
 		 448 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  31.89 
 
 		 443 aa  77  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 479 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  23.71 
 
 		 433 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4570  major facilitator superfamily MFS_1  24.67 
 
 		 458 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  23.75 
 
 		 451 aa  76.3  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49260  major facilitator family transporter  25.93 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  23.14 
 
 		 460 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  24.58 
 
 		 439 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 454 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0567  major facilitator family transporter  22.57 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  23.94 
 
 		 432 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3525  major facilitator transporter  24.67 
 
 		 428 aa  74.3  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.653507  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3235  major facilitator superfamily MFS_1  33.58 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  23.94 
 
 		 432 aa  74.7  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  23.94 
 
 		 432 aa  74.7  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  24.05 
 
 		 454 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  24.05 
 
 		 454 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  23.95 
 
 		 447 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  23.25 
 
 		 437 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  23.8 
 
 		 430 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  23.95 
 
 		 464 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0628  major facilitator family transporter  22.36 
 
 		 415 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0569  major facilitator family transporter  22.36 
 
 		 415 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.676652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0574  major facilitator family transporter  22.36 
 
 		 415 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.84757 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4628  d-galactonate transporter  25.28 
 
 		 447 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.563971  hitchhiker  0.000103132 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  22.53 
 
 		 448 aa  72  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6214  major facilitator superfamily MFS_1  24.23 
 
 		 433 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  21.72 
 
 		 442 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3565  major facilitator transporter  22.48 
 
 		 429 aa  72  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  23.49 
 
 		 447 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  23.61 
 
 		 454 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1094  d-galactonate transporter  23.81 
 
 		 430 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  23.89 
 
 		 469 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0894  anion:cation symporter (ACS) family protein  24.72 
 
 		 448 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0815494  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0851  putative D-galactonate transporter  24.72 
 
 		 448 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.997536  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  24.79 
 
 		 450 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0267254 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2209  anion:cation symporter (ACS) family protein  24.72 
 
 		 448 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  24.42 
 
 		 463 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503182 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1898  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  24.72 
 
 		 448 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2475  d-galactonate transporter  22.71 
 
 		 438 aa  71.2  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.812559  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0484  anion:cation symporter (ACS) family protein  24.72 
 
 		 448 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0581  glucarate transporter  24.72 
 
 		 448 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6596  d-galactonate transporter  25 
 
 		 457 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.143418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1755  anion:cation symporter (ACS) family protein  24.72 
 
 		 448 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0350233  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1217  d-galactonate transporter  24.64 
 
 		 446 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26743  normal  0.06903 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0068  major facilitator transporter  22.31 
 
 		 447 aa  70.5  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0012  d-galactonate transporter  23.23 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  23.77 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3395  major facilitator transporter  24.42 
 
 		 463 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>