More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2827 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2827  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 500 aa  973    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.158214  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8106  major facilitator superfamily MFS_1  62.95 
 
 		 502 aa  556  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1541  major facilitator transporter  48.43 
 
 		 491 aa  396  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0291069  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2289  major facilitator superfamily MFS_1  44.8 
 
 		 483 aa  398  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 430 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 		 427 aa  97.4  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  34.39 
 
 		 407 aa  95.5  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  23.5 
 
 		 432 aa  85.5  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 		 426 aa  84.7  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  23.16 
 
 		 431 aa  84.3  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 		 422 aa  80.9  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 434 aa  79  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0582  major facilitator superfamily MFS_1  35.54 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  24.21 
 
 		 428 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  24.44 
 
 		 430 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2166  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 		 485 aa  77.4  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144549  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 		 429 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  25.46 
 
 		 429 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 		 460 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  22.84 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.27 
 
 		 460 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2158  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 447 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  24.79 
 
 		 447 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  24.79 
 
 		 435 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0992  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  30.67 
 
 		 429 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0509881  normal  0.749387 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4121  major facilitator transporter  24.18 
 
 		 455 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801811 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3525  major facilitator transporter  23 
 
 		 428 aa  72  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.653507  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  24.4 
 
 		 447 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  34.66 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  23.65 
 
 		 433 aa  70.1  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4381  major facilitator transporter  22.55 
 
 		 428 aa  70.1  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0579635 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  23.42 
 
 		 433 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  29.95 
 
 		 456 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 453 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 460 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  23.21 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  23.99 
 
 		 454 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  23.21 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  23.21 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  23.65 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  25.88 
 
 		 453 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4570  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 		 458 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  23.99 
 
 		 454 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1401  major facilitator superfamily MFS_1  23.33 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270057  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 450 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  22.99 
 
 		 428 aa  67  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6712  major facilitator transporter  24.3 
 
 		 449 aa  67  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  22.99 
 
 		 428 aa  67  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0231  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 409 aa  67  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  22.98 
 
 		 441 aa  67  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 453 aa  67  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  22.98 
 
 		 441 aa  67  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  23.74 
 
 		 436 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  23.77 
 
 		 454 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  22.57 
 
 		 442 aa  66.6  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  23.77 
 
 		 454 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0884  major facilitator transporter  40.19 
 
 		 394 aa  66.2  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 452 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 452 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2475  d-galactonate transporter  23.06 
 
 		 438 aa  65.9  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.812559  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  34.08 
 
 		 448 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0652  major facilitator superfamily anion(tartrate)/cation symporter  25.68 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.55035  normal  0.662228 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  23.19 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  22.65 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  21.77 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38823  MFS family transporter: phosphate/sugar  32 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.726317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2852  major facilitator transporter  24.1 
 
 		 438 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 449 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0484  anion:cation symporter (ACS) family protein  34.27 
 
 		 448 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0574  major facilitator family transporter  27.78 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.84757 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0851  putative D-galactonate transporter  34.27 
 
 		 448 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.997536  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0569  major facilitator family transporter  27.78 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.676652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0628  major facilitator family transporter  27.78 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1898  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  34.27 
 
 		 448 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0581  glucarate transporter  34.27 
 
 		 448 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0894  anion:cation symporter (ACS) family protein  34.27 
 
 		 448 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0815494  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1755  anion:cation symporter (ACS) family protein  34.27 
 
 		 448 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0350233  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0567  major facilitator family transporter  27.78 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2209  anion:cation symporter (ACS) family protein  34.27 
 
 		 448 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4663  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 455 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858594  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  23.43 
 
 		 462 aa  63.9  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 447 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 447 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  24.83 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 447 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  23.86 
 
 		 451 aa  63.5  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2702  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 		 445 aa  63.5  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206654  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  22.27 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0346  major facilitator transporter  29.76 
 
 		 450 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258915  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  22.27 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  22.27 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2837  major facilitator family transporter  24.31 
 
 		 436 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00238614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  22.25 
 
 		 432 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1823  major facilitator transporter  24.89 
 
 		 442 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112408  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  22.25 
 
 		 432 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  22.87 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  22.25 
 
 		 432 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  22.77 
 
 		 449 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  23.39 
 
 		 439 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>