More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8106 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8106  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
502 aa  976    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2827  major facilitator superfamily MFS_1  59.96 
 
 
500 aa  518  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.158214  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2289  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 
483 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1541  major facilitator transporter  43.96 
 
 
491 aa  347  4e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0291069  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 
407 aa  114  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0582  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 
432 aa  95.1  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  26.67 
 
 
430 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  24.54 
 
 
422 aa  89  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 
427 aa  88.2  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  25.98 
 
 
428 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  25.4 
 
 
456 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 
443 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  24.3 
 
 
440 aa  79  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  22.71 
 
 
453 aa  77  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4570  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
458 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  22.47 
 
 
448 aa  74.7  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  26.4 
 
 
434 aa  72.4  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  24.77 
 
 
430 aa  72  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  23.06 
 
 
435 aa  72  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0992  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  28.34 
 
 
429 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0509881  normal  0.749387 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  24.03 
 
 
448 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  26.73 
 
 
460 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  21 
 
 
453 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7272  major facilitator transporter  25.95 
 
 
437 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  26.78 
 
 
431 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
426 aa  67.8  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.05 
 
 
437 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  23.15 
 
 
444 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0851  putative D-galactonate transporter  25 
 
 
448 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.997536  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1898  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  25 
 
 
448 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2209  anion:cation symporter (ACS) family protein  25 
 
 
448 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0581  glucarate transporter  25 
 
 
448 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1755  anion:cation symporter (ACS) family protein  25 
 
 
448 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0350233  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0894  anion:cation symporter (ACS) family protein  25 
 
 
448 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0815494  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0484  anion:cation symporter (ACS) family protein  25 
 
 
448 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 
460 aa  67  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6034  major facilitator transporter  35.51 
 
 
458 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2240  putative permease  24.49 
 
 
411 aa  66.6  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  23.99 
 
 
447 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  24.03 
 
 
428 aa  65.1  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2068  major facilitator transporter  20.82 
 
 
432 aa  65.1  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  24.74 
 
 
426 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  24.03 
 
 
428 aa  65.1  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2702  major facilitator superfamily MFS_1  35.4 
 
 
445 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206654  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  24.03 
 
 
428 aa  65.1  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  24.18 
 
 
428 aa  65.1  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  22.92 
 
 
447 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.93 
 
 
460 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  22.05 
 
 
431 aa  64.3  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4166  putative permease  25.38 
 
 
420 aa  63.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.74612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  22.96 
 
 
442 aa  63.9  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  23.43 
 
 
447 aa  63.9  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5069  major facilitator transporter  25.05 
 
 
430 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  23.19 
 
 
447 aa  63.9  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4044  putative permease  25.77 
 
 
420 aa  63.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2523  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  28.08 
 
 
461 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.108392 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5057  major facilitator transporter  24.4 
 
 
430 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195392  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2158  major facilitator transporter  23.23 
 
 
447 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5803  major facilitator transporter  24.4 
 
 
430 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  24.2 
 
 
454 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4381  major facilitator transporter  22.15 
 
 
428 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0579635 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4376  major facilitator transporter  24.4 
 
 
430 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  24.57 
 
 
426 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  23.75 
 
 
428 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  24.57 
 
 
426 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4117  putative permease  25.26 
 
 
420 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3058  major facilitator transporter  24.01 
 
 
430 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4224  putative permease  25.26 
 
 
420 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  22.69 
 
 
447 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  24.37 
 
 
454 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3510  major facilitator transporter  21.41 
 
 
427 aa  62  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  24.37 
 
 
454 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  22.69 
 
 
447 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  26.4 
 
 
425 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0346  major facilitator transporter  21.99 
 
 
450 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258915  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7483  major facilitator transporter  24.51 
 
 
428 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  23.49 
 
 
425 aa  60.1  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6712  major facilitator transporter  26.29 
 
 
449 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  22.51 
 
 
449 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3525  major facilitator transporter  24.03 
 
 
428 aa  59.7  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.653507  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  24.02 
 
 
434 aa  60.1  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4100  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.51 
 
 
427 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.41549  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  29.35 
 
 
417 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  23.27 
 
 
850 aa  59.3  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6215  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 
427 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 
441 aa  59.3  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  23.98 
 
 
419 aa  59.3  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3774  major facilitator transporter  33.59 
 
 
428 aa  58.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0884  major facilitator transporter  38.53 
 
 
394 aa  58.2  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  26.28 
 
 
441 aa  58.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  24.23 
 
 
446 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3235  major facilitator superfamily MFS_1  31.5 
 
 
404 aa  57.8  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3209  major facilitator transporter  23.75 
 
 
430 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  32.05 
 
 
459 aa  57.8  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  25.99 
 
 
423 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5722  major facilitator superfamily MFS_1  36.73 
 
 
433 aa  58.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731406  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  25.99 
 
 
423 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49260  major facilitator family transporter  24.57 
 
 
433 aa  57.8  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2964  hypothetical protein  27.02 
 
 
446 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.83907  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5094  major facilitator transporter  28.74 
 
 
436 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0811378  normal  0.190217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>