290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0644 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0644  major facilitator transporter  100 
 
 
362 aa  675    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.592278  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0660  major facilitator transporter  67.13 
 
 
361 aa  432  1e-120  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0530  major facilitator transporter  61.58 
 
 
360 aa  388  1e-107  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1153  major facilitator transporter  33.24 
 
 
367 aa  161  1e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0741  major facilitator transporter  31.82 
 
 
355 aa  137  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.662794  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0038  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 
355 aa  113  5e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1421  major facilitator superfamily MFS_1  37.88 
 
 
462 aa  73.6  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.756224  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 
407 aa  64.3  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  30.3 
 
 
465 aa  63.9  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  30.3 
 
 
465 aa  63.5  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  32.58 
 
 
487 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  33.55 
 
 
400 aa  60.1  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  30.3 
 
 
492 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0323  major facilitator transporter  32.58 
 
 
472 aa  58.5  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1862  multidrug resistance protein  25.41 
 
 
391 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1832  multidrug resistance protein  25.41 
 
 
391 aa  57.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.71931  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2004  multidrug resistance protein  25.41 
 
 
391 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.627866  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  30.3 
 
 
466 aa  57.8  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2555  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 
434 aa  57.4  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0238485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2038  putative multidrug resistance protein  25.41 
 
 
391 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3423e-17 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1778  major facilitator transporter  33.12 
 
 
474 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000929318  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2257  major facilitator transporter  32.86 
 
 
589 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0355972 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  26.84 
 
 
421 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2132  major facilitator transporter  26.4 
 
 
463 aa  57  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5165  major facilitator transporter  29.91 
 
 
387 aa  57  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2006  putative multidrug resistance protein  25.61 
 
 
391 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5501  multidrug resistance protein, putative  29.91 
 
 
387 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5549  putative multidrug resistance protein  29.91 
 
 
387 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5068  multidrug resistance protein; permease  29.91 
 
 
387 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5493  putative multidrug resistance protein  29.91 
 
 
387 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5220  multidrug resistance protein  29.06 
 
 
387 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5052  multidrug resistance protein; permease  29.06 
 
 
387 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5463  putative multidrug resistance protein  29.06 
 
 
387 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5620  multidrug resistance protein  29.06 
 
 
387 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5457  putative multidrug resistance protein  29.91 
 
 
387 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2117  putative multidrug resistance protein  25 
 
 
391 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.521892  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1452  major facilitator transporter  30.41 
 
 
475 aa  55.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.67 
 
 
474 aa  55.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3885  major facilitator transporter  29.91 
 
 
381 aa  55.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
403 aa  55.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.6 
 
 
478 aa  54.7  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4430  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.5 
 
 
454 aa  54.3  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0528088  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 
408 aa  54.7  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  29.79 
 
 
440 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7319  major facilitator transporter  28.37 
 
 
452 aa  54.3  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0607  major facilitator transporter  28.87 
 
 
582 aa  53.9  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0958846  normal  0.0536193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  32.95 
 
 
393 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 
391 aa  53.1  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1017  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 
525 aa  53.1  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3303  putative multidrug resistance protein  29.14 
 
 
391 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  27.53 
 
 
500 aa  52.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1408  major facilitator transporter  36.44 
 
 
484 aa  52  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0000966462  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0084  major facilitator transporter  26.71 
 
 
589 aa  51.6  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0483176  normal  0.0703431 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1816  permease; multidrug resistance protein  24.79 
 
 
391 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.985624  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  31.3 
 
 
383 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  27.27 
 
 
456 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0891  major facilitator transporter  26.67 
 
 
470 aa  52  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1541  major facilitator transporter  32.38 
 
 
491 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0291069  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0992  major facilitator superfamily MFS_1  24.85 
 
 
475 aa  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00829704  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  24.75 
 
 
453 aa  51.6  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.407756 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0869  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 
487 aa  51.2  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  33.74 
 
 
418 aa  50.8  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2478  major facilitator transporter  33.13 
 
 
398 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.405324 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  28.57 
 
 
405 aa  50.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  30.43 
 
 
387 aa  50.8  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2773  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 
434 aa  50.8  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  33.83 
 
 
434 aa  50.4  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 
390 aa  50.1  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2197  major facilitator transporter  34.65 
 
 
596 aa  50.4  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0642  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 
422 aa  50.1  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 
390 aa  50.1  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0287  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 
455 aa  50.1  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.88 
 
 
502 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1284  major facilitator superfamily transporter  31.06 
 
 
444 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537207  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3349  major facilitator superfamily MFS_1  32.65 
 
 
429 aa  49.7  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.735046 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.06 
 
 
474 aa  49.7  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2329  major facilitator transporter  26.32 
 
 
479 aa  50.1  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371241  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 
390 aa  49.7  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.51 
 
 
418 aa  49.7  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  23.08 
 
 
477 aa  49.7  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  30.12 
 
 
476 aa  49.7  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1651  major facilitator transporter  25.5 
 
 
641 aa  49.7  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695517  normal  0.0730929 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  30.77 
 
 
461 aa  49.7  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 
401 aa  49.7  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  24.2 
 
 
387 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1098  major facilitator transporter  31.3 
 
 
385 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2971  major facilitator transporter  28.89 
 
 
445 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  27.05 
 
 
388 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2393  major facilitator transporter  30.88 
 
 
481 aa  48.9  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.74684  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4000  major facilitator transporter  30.16 
 
 
408 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1329  major facilitator superfamily MFS_1  34.55 
 
 
394 aa  49.3  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1255  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 
385 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  27.05 
 
 
388 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1577  major facilitator transporter  30.43 
 
 
383 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0471047  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6200  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 
481 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  30.5 
 
 
478 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1729  major facilitator transporter  30.6 
 
 
423 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  30.5 
 
 
478 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1708  major facilitator transporter  30.6 
 
 
423 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841617  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  30.5 
 
 
478 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>