More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_13070 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1181  MFS family transporter  98.21 
 
 		 393 aa  753    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13070  MFS family transporter  100 
 
 		 393 aa  768    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6287  major facilitator superfamily permease  45.03 
 
 		 397 aa  277  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0751  major facilitator superfamily MFS_1  42.78 
 
 		 398 aa  250  4e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207207  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3645  major facilitator transporter  39.8 
 
 		 398 aa  237  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.212684 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2766  major facilitator transporter  23.67 
 
 		 429 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3928  major facilitator superfamily MFS_1  26.23 
 
 		 420 aa  94  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2522  major facilitator superfamily MFS_1  23.75 
 
 		 440 aa  90.5  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.636456  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2568  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 427 aa  83.6  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3306  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0290  major facilitator superfamily MFS_1  26.08 
 
 		 420 aa  77.8  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.338306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3531  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 		 399 aa  73.6  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0566  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 418 aa  71.2  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0358  major facilitator superfamily MFS_1  31.14 
 
 		 423 aa  66.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0005  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 		 396 aa  64.3  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0005  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 390 aa  63.2  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.17 
 
 		 478 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 434 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.06 
 
 		 524 aa  60.1  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1908  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.08 
 
 		 509 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3301  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.88 
 
 		 512 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.970656 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4127  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.08 
 
 		 512 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.648562  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3392  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.08 
 
 		 512 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.661215 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0658  major facilitator superfamily drug efflux transporter  27.88 
 
 		 534 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.1 
 
 		 508 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0456997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  27.83 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.87 
 
 		 493 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 483 aa  56.6  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  26.52 
 
 		 443 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1705  major facilitator superfamily MFS_1  33.56 
 
 		 733 aa  56.2  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3218  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 402 aa  55.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 426 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 		 391 aa  54.7  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1329  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 		 394 aa  54.3  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0134  regulatory protein UhpC  26.95 
 
 		 443 aa  54.7  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0582  major facilitator superfamily MFS_1  26.57 
 
 		 432 aa  54.7  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0114  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.47 
 
 		 463 aa  54.3  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.512098  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2598  major facilitator superfamily MFS_1  23.01 
 
 		 420 aa  53.9  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1292  major facilitator transporter  25.31 
 
 		 416 aa  53.9  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0269507 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 452 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000089  hexose phosphate uptake regulatory protein UhpC  28.97 
 
 		 446 aa  53.1  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4063  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 452 aa  53.5  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3829  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 429 aa  53.1  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47900  putative MFS transporter  35.76 
 
 		 480 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00274323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3247  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.03 
 
 		 511 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  37.1 
 
 		 497 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.49 
 
 		 511 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1284  major facilitator superfamily transporter  37.39 
 
 		 444 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537207  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 441 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1527  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 426 aa  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0610688  normal  0.832565 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  25.34 
 
 		 451 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2277  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 431 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  29.75 
 
 		 582 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5920  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 435 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0977977  normal  0.252353 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  35.58 
 
 		 510 aa  51.6  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3415  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 390 aa  51.2  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.800917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0168  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 426 aa  51.2  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 427 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5028  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 426 aa  50.8  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.212016 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.35 
 
 		 520 aa  50.8  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 427 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3897  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.83 
 
 		 518 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429353 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 430 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 416 aa  50.4  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1035  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 456 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.46638  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1704  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.85 
 
 		 757 aa  50.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 456 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0393  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 553 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.61 
 
 		 490 aa  50.4  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1355  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 		 390 aa  50.4  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 		 503 aa  50.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  23.89 
 
 		 449 aa  50.4  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 437 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.21 
 
 		 475 aa  50.1  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  35.66 
 
 		 515 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2510  major facilitator superfamily MFS_1  33.94 
 
 		 480 aa  50.1  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.563077 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 		 392 aa  50.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0528  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.68 
 
 		 469 aa  50.1  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.402464  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2484  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 437 aa  50.1  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.44 
 
 		 516 aa  49.7  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2586  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 		 435 aa  49.7  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.900551  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 462 aa  49.7  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_002620  TC0831  GlpT/PgpT/UhpT family protein  27.71 
 
 		 456 aa  49.3  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.571145  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1059  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.59 
 
 		 513 aa  49.7  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186181  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.44 
 
 		 514 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2344  regulatory protein UhpC  28.68 
 
 		 440 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.209168  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2389  regulatory protein UhpC  28.68 
 
 		 440 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.365654 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1653  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 426 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297588  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2433  regulatory protein UhpC  28.68 
 
 		 440 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.186527 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2437  regulatory protein UhpC  28.68 
 
 		 440 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2353  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 529 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0323  major facilitator transporter  33.03 
 
 		 472 aa  49.3  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0515  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.13 
 
 		 520 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2547  regulatory protein UhpC  28.68 
 
 		 440 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0466951 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.62 
 
 		 500 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2256  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.39 
 
 		 507 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0484017  normal  0.408162 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>