92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6287 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6287  major facilitator superfamily permease  100 
 
 		 397 aa  778    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1181  MFS family transporter  45.88 
 
 		 393 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13070  MFS family transporter  45.56 
 
 		 393 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0751  major facilitator superfamily MFS_1  42.54 
 
 		 398 aa  256  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207207  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3645  major facilitator transporter  41.33 
 
 		 398 aa  256  5e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.212684 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2766  major facilitator transporter  24.4 
 
 		 429 aa  98.6  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0566  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2522  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 		 440 aa  75.1  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.636456  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3928  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 		 420 aa  74.7  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0358  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3531  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 399 aa  69.3  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2568  major facilitator superfamily MFS_1  23.75 
 
 		 427 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3306  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 		 423 aa  64.7  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2216  major facilitator superfamily transporter  27.92 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.167097 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2474  hypothetical protein  30.81 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2623  hypothetical protein  30.81 
 
 		 455 aa  58.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0290  major facilitator superfamily MFS_1  29.28 
 
 		 420 aa  55.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.338306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2702  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 445 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206654  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3959  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.177015  normal  0.0110236 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3845  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0254807  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 395 aa  52.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1175  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 419 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0759672  normal  0.955018 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1794  Xaa-Pro dipeptidase  22.41 
 
 		 389 aa  50.8  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 441 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 		 503 aa  50.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0005  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 		 396 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  25.31 
 
 		 480 aa  47.8  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2519  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 414 aa  47.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3858  major facilitator superfamily MFS_1  23.5 
 
 		 439 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2824  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 420 aa  47.4  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4209  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 		 435 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  23.47 
 
 		 391 aa  47.4  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.91 
 
 		 474 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05543  hypothetical protein  32.54 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  24.54 
 
 		 418 aa  46.2  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  29.45 
 
 		 498 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  22.87 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0410  multidrug-efflux transporter  31.25 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0715  general substrate transporter  24 
 
 		 442 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.345459  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 432 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 432 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1320  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 503 aa  45.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0395  major facilitator superfamily MFS_1  32 
 
 		 472 aa  45.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.90687 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  27.47 
 
 		 432 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  22.31 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5160  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  27.31 
 
 		 416 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3797  major facilitator superfamily MFS_1  24.17 
 
 		 444 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.653013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  24.1 
 
 		 417 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4393  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 403 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  28.12 
 
 		 462 aa  45.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2329  major facilitator superfamily MFS_1  26.08 
 
 		 452 aa  44.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126091  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3900  major facilitator superfamily MFS_1  23.22 
 
 		 444 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.416802  normal  0.649925 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1556  putative transmembrane transport protein  30.43 
 
 		 422 aa  44.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.233072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3731  major facilitator superfamily MFS_1  24.17 
 
 		 444 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3839  major facilitator superfamily transporter  23.22 
 
 		 443 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.993033  normal  0.150303 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1703  hypothetical protein  24.62 
 
 		 391 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  25.74 
 
 		 416 aa  44.3  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0005  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 		 396 aa  44.3  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 		 397 aa  43.9  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30600  putative permease  29.6 
 
 		 404 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166806 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1551  major facilitator transporter  29.76 
 
 		 500 aa  43.9  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504372 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0134  regulatory protein UhpC  25 
 
 		 443 aa  43.9  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  35.85 
 
 		 399 aa  43.9  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  23.43 
 
 		 468 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  23.43 
 
 		 468 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1561  major facilitator superfamily MFS_1  36.63 
 
 		 420 aa  43.9  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  23.43 
 
 		 468 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  23.43 
 
 		 468 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  23.43 
 
 		 468 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 430 aa  43.5  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  26.29 
 
 		 452 aa  43.1  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 		 391 aa  43.5  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  22.79 
 
 		 411 aa  43.5  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0278  major facilitator transporter  33.12 
 
 		 441 aa  43.5  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.672912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1882  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 		 393 aa  43.5  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.36796  normal  0.170219 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1103  major facilitator family transporter  30.86 
 
 		 464 aa  43.5  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.338347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 450 aa  43.5  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2083  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.05 
 
 		 529 aa  43.1  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.438087  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 467 aa  43.1  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 410 aa  43.1  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  33.04 
 
 		 400 aa  43.1  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22661 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01681  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G00130)  26.38 
 
 		 519 aa  43.1  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.235626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01764  MFS transporter  27.42 
 
 		 403 aa  43.1  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315697  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  41.94 
 
 		 432 aa  43.1  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1968  major facilitator superfamily MFS_1  24.82 
 
 		 438 aa  43.1  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.878316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2333  major facilitator family transporter  24.82 
 
 		 438 aa  43.1  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1955  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 393 aa  43.1  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135687  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3502  regulatory protein UhpC  27.91 
 
 		 447 aa  43.1  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 390 aa  42.7  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>