81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3645 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3645  major facilitator transporter  100 
 
 		 398 aa  767    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.212684 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0751  major facilitator superfamily MFS_1  74.46 
 
 		 398 aa  528  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207207  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6287  major facilitator superfamily permease  41.94 
 
 		 397 aa  252  7e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1181  MFS family transporter  41.11 
 
 		 393 aa  242  9e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13070  MFS family transporter  41.11 
 
 		 393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2766  major facilitator transporter  25 
 
 		 429 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3928  major facilitator superfamily MFS_1  26.93 
 
 		 420 aa  84  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2522  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 		 440 aa  79.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.636456  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3306  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1556  putative transmembrane transport protein  36.48 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.233072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2568  major facilitator superfamily MFS_1  26.16 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0358  major facilitator superfamily MFS_1  32 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 420 aa  61.6  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2824  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3531  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 418 aa  60.5  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0689  major facilitator superfamily permease  32.93 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2216  major facilitator superfamily transporter  32.34 
 
 		 411 aa  59.7  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.167097 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0290  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 		 420 aa  59.7  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.338306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0005  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1964  major facilitator transporter  32.34 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0566  major facilitator superfamily MFS_1  28.74 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 		 449 aa  56.6  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6132  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 403 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0005  major facilitator superfamily MFS_1  33.53 
 
 		 394 aa  56.2  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.32076  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0613  major facilitator superfamily transporter  29.65 
 
 		 422 aa  55.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  32.44 
 
 		 423 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  32.44 
 
 		 423 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0005  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 		 396 aa  53.9  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0005  major facilitator superfamily MFS_1  31.93 
 
 		 394 aa  53.1  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.695547  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0039  major facilitator superfamily transporter  32.91 
 
 		 420 aa  53.1  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.19043 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6420  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 383 aa  53.1  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4393  major facilitator transporter  32.93 
 
 		 403 aa  53.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  25.5 
 
 		 420 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0059  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 417 aa  51.2  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 		 390 aa  50.8  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0083  major facilitator superfamily transporter  29.07 
 
 		 423 aa  50.4  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2962  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 462 aa  49.7  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  25.5 
 
 		 420 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1507  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 411 aa  48.5  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1970  major facilitator superfamily MFS_1  31.87 
 
 		 396 aa  48.9  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0055  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.628299  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0609  major facilitator superfamily transporter  25.9 
 
 		 420 aa  47.8  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0117  nitrate/nitrite transporter  29.36 
 
 		 424 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1540  major facilitator family transporter  29.36 
 
 		 424 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2964  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 464 aa  47.4  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.413021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1625  major facilitator family transporter  29.36 
 
 		 424 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339331  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  29.33 
 
 		 400 aa  47  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1649  major facilitator superfamily MFS_1  37.65 
 
 		 425 aa  47  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  31.29 
 
 		 440 aa  47  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0185  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 401 aa  46.2  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.73097 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2971  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 445 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1848  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 447 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276958 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2012  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 421 aa  45.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.147119 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1885  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3215  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 430 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 443 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2665  major facilitator superfamily MFS_1  32.5 
 
 		 421 aa  44.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6609  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  27.91 
 
 		 459 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3502  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 		 409 aa  44.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  31.31 
 
 		 457 aa  44.3  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 422 aa  44.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 		 443 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 		 433 aa  44.3  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 450 aa  44.3  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1329  major facilitator superfamily MFS_1  24.78 
 
 		 394 aa  44.3  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4478  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 398 aa  44.3  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43382  predicted protein  30.77 
 
 		 555 aa  44.3  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 433 aa  43.9  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  28.57 
 
 		 461 aa  43.9  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  40.87 
 
 		 409 aa  43.9  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0189  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 		 390 aa  43.1  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 575 aa  43.5  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  34.03 
 
 		 439 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 421 aa  43.1  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 439 aa  43.1  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4906  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 422 aa  42.7  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380995  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>