163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1970 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1970  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 396 aa  760    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1292  major facilitator transporter  39.51 
 
 		 416 aa  259  4e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0269507 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0419  major facilitator transporter  31.04 
 
 		 396 aa  153  4e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.42011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2437  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 		 396 aa  79.7  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 		 402 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1836  fosmidomycin resistance protein  25.51 
 
 		 403 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3507  fosmidomycin resistance protein  25.25 
 
 		 403 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1437  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1953  fosmidomycin resistance protein  25 
 
 		 403 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1696  fosmidomycin resistance protein  25 
 
 		 403 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00774427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1677  fosmidomycin resistance protein  25 
 
 		 403 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0817289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1652  fosmidomycin resistance protein  25 
 
 		 403 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000459515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1830  fosmidomycin resistance protein  25 
 
 		 403 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1918  fosmidomycin resistance protein  24.75 
 
 		 403 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.243949  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1874  fosmidomycin resistance protein  25 
 
 		 403 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194019 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1690  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 403 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0645  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 382 aa  69.3  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080187  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2341  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 		 417 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4112  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0806371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1115  major facilitator transporter  23.35 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4025  major facilitator superfamily fosmidomycin resistant protein  25.16 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.164373  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0656  fosmidomycin resistance protein  25.25 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.231636  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0649  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1308  major facilitator transporter  23.24 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120753  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1116  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.298595 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3577  hypothetical protein  23.88 
 
 		 421 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.972735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1146  major facilitator transporter  23.42 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155488  unclonable  0.000000029988 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5381  transporter, MFS superfamily  26.39 
 
 		 432 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269188  normal  0.117501 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2238  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  26.47 
 
 		 507 aa  53.9  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382837  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0913  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.47 
 
 		 507 aa  53.9  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  27.32 
 
 		 432 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3913  major facilitator transporter  23.85 
 
 		 421 aa  53.1  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  27.87 
 
 		 432 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1982  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 		 434 aa  53.1  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130406  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2084  major facilitator superfamily MFS_1  24.27 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.942608 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0994  major facilitator transporter  25.08 
 
 		 392 aa  52.4  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.198268  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0724  XRE family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 406 aa  52.4  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0248517  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2256  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.47 
 
 		 507 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0484017  normal  0.408162 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2632  major facilitator transporter  22.72 
 
 		 403 aa  52.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224364  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  24.89 
 
 		 432 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6132  major facilitator transporter  23.42 
 
 		 403 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  24.47 
 
 		 433 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2972  major facilitator transporter  21.75 
 
 		 422 aa  51.6  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 401 aa  51.6  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 425 aa  51.2  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  24.47 
 
 		 432 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  24.47 
 
 		 432 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  24.47 
 
 		 433 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0962  major facilitator transporter  21.81 
 
 		 412 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1444  major facilitator transporter  21.81 
 
 		 412 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  24.47 
 
 		 433 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3329  major facilitator transporter  21.61 
 
 		 410 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.707628 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1422  major facilitator transporter  23.89 
 
 		 412 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4797  major facilitator superfamily MFS_1  23.77 
 
 		 421 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.292232  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3923  major facilitator superfamily MFS_1  21.76 
 
 		 418 aa  50.4  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3301  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.44 
 
 		 512 aa  50.1  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.970656 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2104  major facilitator transporter  22.69 
 
 		 391 aa  49.7  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.314279 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  25.74 
 
 		 433 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  21.36 
 
 		 410 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4588  major facilitator transporter  21.81 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1519  major facilitator transporter  24.08 
 
 		 404 aa  49.3  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.496216 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2083  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.19 
 
 		 529 aa  49.3  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.438087  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1478  major facilitator superfamily MFS_1  21.41 
 
 		 402 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6420  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 383 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3645  major facilitator transporter  37.4 
 
 		 398 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.212684 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1908  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.99 
 
 		 509 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.99 
 
 		 493 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0817  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4653  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 		 422 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.268151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1871  major facilitator transporter  23.89 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.565485  hitchhiker  0.00660368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0658  major facilitator superfamily drug efflux transporter  34.44 
 
 		 534 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0137  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 427 aa  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0711872  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 		 408 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3392  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.99 
 
 		 512 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.661215 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0349  benzoate transport protein  28.09 
 
 		 436 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0364  benzoate transport protein  28.09 
 
 		 433 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13070  MFS family transporter  28.51 
 
 		 393 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4127  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.69 
 
 		 512 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.648562  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2224  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.09 
 
 		 526 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.264069  normal  0.72348 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0958  major facilitator transporter  22.59 
 
 		 406 aa  47.4  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4107  major facilitator transporter  23.39 
 
 		 404 aa  47.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266046  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2482  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 		 417 aa  47.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0930  fosmidomycin resistance protein  22.11 
 
 		 416 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3247  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.77 
 
 		 511 aa  47.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1849  fosmidomycin resistance protein  22.11 
 
 		 417 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1326  major facilitator transporter  22.06 
 
 		 412 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686197  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.57 
 
 		 516 aa  47.4  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1166  major facilitator transporter  24.4 
 
 		 421 aa  47.4  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1463  fosmidomycin resistance protein  22.11 
 
 		 416 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1672  fosmidomycin resistance protein  22.11 
 
 		 417 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1694  fosmidomycin resistance protein  22.11 
 
 		 417 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511968  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2676  major facilitator transporter  21.94 
 
 		 396 aa  47  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.149282  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.57 
 
 		 514 aa  47.4  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1875  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.09 
 
 		 527 aa  47  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  26.91 
 
 		 413 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2099  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.09 
 
 		 527 aa  46.6  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.710397 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0398  putative benzoate transport protein  28.09 
 
 		 433 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0137  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 		 420 aa  46.6  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0222229  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  25 
 
 		 415 aa  46.6  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1181  MFS family transporter  28.51 
 
 		 393 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>