More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4797 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1308  major facilitator transporter  90.5 
 
 		 420 aa  685    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120753  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3913  major facilitator transporter  91.69 
 
 		 421 aa  669    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4797  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 421 aa  827    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.292232  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2972  major facilitator transporter  71.97 
 
 		 422 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4112  major facilitator transporter  75.32 
 
 		 397 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0806371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1115  major facilitator transporter  74.62 
 
 		 415 aa  560  1e-158  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4588  major facilitator transporter  62.66 
 
 		 412 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0649  major facilitator transporter  56.57 
 
 		 403 aa  454  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1463  fosmidomycin resistance protein  61.21 
 
 		 416 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0656  fosmidomycin resistance protein  56.57 
 
 		 403 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.231636  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0930  fosmidomycin resistance protein  61.21 
 
 		 416 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1849  fosmidomycin resistance protein  61.21 
 
 		 417 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1672  fosmidomycin resistance protein  61.21 
 
 		 417 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2630  fosmidomycin resistance protein  61.48 
 
 		 420 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1694  fosmidomycin resistance protein  61.21 
 
 		 417 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511968  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0744  fosmidomycin resistance protein  60.95 
 
 		 416 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944019  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2632  major facilitator transporter  55.44 
 
 		 403 aa  449  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224364  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0419  fosmidomycin resistance protein  60.95 
 
 		 416 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.423949  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1422  major facilitator transporter  63.06 
 
 		 412 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0962  major facilitator transporter  63.06 
 
 		 412 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1326  major facilitator transporter  62.27 
 
 		 412 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686197  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1444  major facilitator transporter  63.06 
 
 		 412 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1116  major facilitator superfamily MFS_1  55.67 
 
 		 410 aa  443  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.298595 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1587  major facilitator transporter  61.62 
 
 		 412 aa  442  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1871  major facilitator transporter  62.53 
 
 		 413 aa  444  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.565485  hitchhiker  0.00660368 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2794  major facilitator superfamily MFS_1  62.8 
 
 		 419 aa  444  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572754  normal  0.513078 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1365  major facilitator transporter  61.74 
 
 		 412 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.399503 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1340  major facilitator superfamily multidrug (fosmidomycin) efflux transporter  61.74 
 
 		 420 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3837  major facilitator transporter  54.09 
 
 		 415 aa  431  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4717  major facilitator superfamily MFS_1  59.14 
 
 		 410 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521537 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3640  major facilitator superfamily MFS_1  59.14 
 
 		 410 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1146  major facilitator transporter  57.42 
 
 		 406 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155488  unclonable  0.000000029988 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3033  fosmidomycin resistance protein  57.54 
 
 		 404 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00068897  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0023  major facilitator transporter  59.55 
 
 		 409 aa  419  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  55.33 
 
 		 408 aa  418  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2104  major facilitator transporter  59.53 
 
 		 391 aa  420  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.314279 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1260  fosmidomycin resistance protein  57.4 
 
 		 404 aa  421  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0237353  hitchhiker  0.0000222003 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1977  fosmidomycin resistance protein, putative  60.05 
 
 		 403 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85297  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2458  major facilitator transporter  57.51 
 
 		 410 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1645  major facilitator superfamily MFS_1  60.05 
 
 		 403 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.849012  hitchhiker  0.000565509 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2007  major facilitator transporter  57.28 
 
 		 423 aa  416  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.28785 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0958  major facilitator transporter  57.39 
 
 		 406 aa  412  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6092  major facilitator superfamily MFS_1  57.68 
 
 		 400 aa  411  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0412  putative fosmidomycin resistance antibiotic resistance transmembrane protein  59.27 
 
 		 411 aa  410  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  normal  0.519743 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6505  major facilitator superfamily MFS_1  57.58 
 
 		 400 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0720  major facilitator transporter  54.27 
 
 		 403 aa  409  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588429 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00430  predicted fosmidomycin efflux system  56.16 
 
 		 406 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3131  major facilitator superfamily MFS_1  56.16 
 
 		 406 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3137  major facilitator transporter  56.16 
 
 		 406 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.546423  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00435  hypothetical protein  56.16 
 
 		 406 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0556  fosmidomycin resistance protein  56.16 
 
 		 406 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0571  fosmidomycin resistance protein  56.23 
 
 		 406 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.652835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0474  major facilitator transporter  58.33 
 
 		 398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3923  major facilitator superfamily MFS_1  55.35 
 
 		 418 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0523  fosmidomycin resistance protein  56.23 
 
 		 406 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  55.76 
 
 		 431 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0701  MFS efflux transporter, putative  57.7 
 
 		 404 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1681  major facilitator transporter  54.82 
 
 		 402 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4757  major facilitator transporter  56.2 
 
 		 405 aa  402  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54337  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0518  fosmidomycin resistance protein  55.91 
 
 		 406 aa  405  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0735  major facilitator transporter  57.7 
 
 		 404 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0734  major facilitator transporter  57.7 
 
 		 404 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4107  major facilitator transporter  51.56 
 
 		 404 aa  399  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266046  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3799  fosmidomycin resistance protein  56.38 
 
 		 402 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.319996  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1603  major facilitator superfamily MFS_1  55.79 
 
 		 408 aa  401  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4483  major facilitator transporter  57.33 
 
 		 403 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.706987 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  52.19 
 
 		 410 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0053  major facilitator transporter  60.47 
 
 		 419 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4835  major facilitator transporter  55.29 
 
 		 403 aa  393  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2676  major facilitator transporter  51.41 
 
 		 396 aa  391  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.149282  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2162  major facilitator superfamily MFS_1  60.16 
 
 		 411 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0556  fosmidomycin resistance protein  57.85 
 
 		 406 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.809506 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0546  fosmidomycin resistance protein  57.85 
 
 		 406 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.268965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0541  fosmidomycin resistance protein  58.12 
 
 		 406 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.404971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0539  fosmidomycin resistance protein  57.85 
 
 		 406 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0600  fosmidomycin resistance protein  57.85 
 
 		 406 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3329  major facilitator transporter  53 
 
 		 410 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.707628 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0367  permease  49.35 
 
 		 412 aa  379  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.32941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1603  major facilitator superfamily MFS_1  53.62 
 
 		 399 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0711095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4025  major facilitator superfamily fosmidomycin resistant protein  51.57 
 
 		 401 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.164373  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  49.21 
 
 		 408 aa  376  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3577  hypothetical protein  51.57 
 
 		 421 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.972735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0973  major facilitator superfamily MFS_1  60.2 
 
 		 435 aa  373  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1166  major facilitator transporter  50.73 
 
 		 421 aa  372  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1170  major facilitator superfamily MFS_1  58.05 
 
 		 415 aa  365  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.147511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1043  major facilitator transporter  58.15 
 
 		 415 aa  366  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605275 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5829  major facilitator transporter  50.8 
 
 		 422 aa  362  6e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50804  normal  0.878008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2366  antibiotic MFS transporter, putative  51.82 
 
 		 420 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6429  major facilitator transporter  52.21 
 
 		 403 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1552  major facilitator superfamily MFS_1  46.7 
 
 		 413 aa  352  5.9999999999999994e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00281859  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  42.78 
 
 		 402 aa  322  5e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1918  fosmidomycin resistance protein  43.12 
 
 		 403 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.243949  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1690  major facilitator transporter  43.12 
 
 		 403 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3507  fosmidomycin resistance protein  43.12 
 
 		 403 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1696  fosmidomycin resistance protein  42.86 
 
 		 403 aa  305  7e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00774427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1677  fosmidomycin resistance protein  42.86 
 
 		 403 aa  305  7e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0817289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1652  fosmidomycin resistance protein  42.86 
 
 		 403 aa  305  7e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000459515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1830  fosmidomycin resistance protein  42.86 
 
 		 403 aa  305  7e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1836  fosmidomycin resistance protein  42.86 
 
 		 403 aa  305  7e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1437  major facilitator transporter  42.75 
 
 		 402 aa  305  7e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>