97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0419 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0419  major facilitator transporter  100 
 
 		 396 aa  758    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.42011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1292  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 416 aa  149  9e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0269507 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1970  major facilitator superfamily MFS_1  31.04 
 
 		 396 aa  144  3e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2341  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1696  fosmidomycin resistance protein  25.77 
 
 		 403 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00774427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1677  fosmidomycin resistance protein  25.77 
 
 		 403 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0817289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1652  fosmidomycin resistance protein  25.77 
 
 		 403 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000459515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1830  fosmidomycin resistance protein  25.77 
 
 		 403 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1918  fosmidomycin resistance protein  25.77 
 
 		 403 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.243949  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1874  fosmidomycin resistance protein  25.77 
 
 		 403 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194019 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1953  fosmidomycin resistance protein  25.77 
 
 		 403 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1836  fosmidomycin resistance protein  24.57 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3507  fosmidomycin resistance protein  24.57 
 
 		 403 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1690  major facilitator transporter  24.57 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1437  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1115  major facilitator transporter  24.92 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2084  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.942608 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0735  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0701  MFS efflux transporter, putative  25.17 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0734  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4835  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4107  major facilitator transporter  21.84 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266046  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4112  major facilitator transporter  23.26 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0806371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  23.84 
 
 		 431 aa  57.4  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4483  major facilitator transporter  24.67 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.706987 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1794  Xaa-Pro dipeptidase  25.86 
 
 		 389 aa  55.1  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1146  major facilitator transporter  24.41 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155488  unclonable  0.000000029988 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 		 408 aa  54.3  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0994  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 392 aa  53.9  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.198268  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5829  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 422 aa  53.5  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50804  normal  0.878008 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2673  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 403 aa  53.5  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6132  major facilitator transporter  26.71 
 
 		 403 aa  53.5  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4757  major facilitator transporter  24.18 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54337  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2972  major facilitator transporter  25.08 
 
 		 422 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  22.26 
 
 		 408 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2632  major facilitator transporter  20.98 
 
 		 403 aa  52.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224364  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0656  fosmidomycin resistance protein  21.64 
 
 		 403 aa  52.4  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.231636  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  22.87 
 
 		 410 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3329  major facilitator transporter  23.29 
 
 		 410 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.707628 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0649  major facilitator transporter  21.05 
 
 		 403 aa  52  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6505  major facilitator superfamily MFS_1  23.61 
 
 		 400 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2437  major facilitator superfamily MFS_1  24.3 
 
 		 396 aa  51.2  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6420  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 383 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6092  major facilitator superfamily MFS_1  24.03 
 
 		 400 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2676  major facilitator transporter  22.52 
 
 		 396 aa  50.4  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.149282  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6429  major facilitator transporter  24.12 
 
 		 403 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1603  major facilitator superfamily MFS_1  25.08 
 
 		 408 aa  50.4  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1116  major facilitator superfamily MFS_1  23.38 
 
 		 410 aa  50.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.298595 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0341  major facilitator transporter  23.86 
 
 		 373 aa  50.4  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00915727  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4588  major facilitator transporter  24.34 
 
 		 412 aa  50.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1681  major facilitator transporter  24.02 
 
 		 402 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0645  major facilitator transporter  24.19 
 
 		 382 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080187  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1871  major facilitator transporter  23.93 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.565485  hitchhiker  0.00660368 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1427  major facilitator transporter  24.42 
 
 		 445 aa  48.1  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.08987  normal  0.773865 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1365  major facilitator transporter  24.01 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.399503 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1326  major facilitator transporter  23.68 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686197  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3799  fosmidomycin resistance protein  24.02 
 
 		 402 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.319996  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1260  fosmidomycin resistance protein  23.75 
 
 		 404 aa  47.8  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0237353  hitchhiker  0.0000222003 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1982  major facilitator superfamily MFS_1  25.61 
 
 		 434 aa  48.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130406  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3033  fosmidomycin resistance protein  24.25 
 
 		 404 aa  47.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00068897  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0185  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 		 401 aa  47.4  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.73097 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1320  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 		 397 aa  47  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296335  hitchhiker  0.000000456317 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2366  antibiotic MFS transporter, putative  22.26 
 
 		 420 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0720  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 403 aa  46.6  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588429 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2766  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 429 aa  46.6  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0962  major facilitator transporter  23.03 
 
 		 412 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4717  major facilitator superfamily MFS_1  24.76 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521537 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0689  major facilitator superfamily permease  28.92 
 
 		 407 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1422  major facilitator transporter  23.03 
 
 		 412 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1444  major facilitator transporter  23.03 
 
 		 412 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0367  permease  23.4 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.32941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3640  major facilitator superfamily MFS_1  24.76 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2144  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0412  putative benzoate transport protein  25.33 
 
 		 433 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3913  major facilitator transporter  24.18 
 
 		 421 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6449  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0023  major facilitator transporter  24.05 
 
 		 409 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1308  major facilitator transporter  21.6 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120753  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3527  major facilitator transporter  25.15 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0102  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 382 aa  44.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.346364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3837  major facilitator transporter  23.78 
 
 		 415 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3167  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 		 462 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4906  putative benzoate transport protein  23.56 
 
 		 433 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2630  fosmidomycin resistance protein  22.85 
 
 		 420 aa  44.3  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5584  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 406 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5948  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 406 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.291144 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1603  major facilitator superfamily MFS_1  22.97 
 
 		 399 aa  43.5  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0711095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0344  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 433 aa  43.5  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0927  alpha-ketoglutarate permease  24.46 
 
 		 435 aa  43.5  0.007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.692258  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1694  fosmidomycin resistance protein  24.05 
 
 		 417 aa  43.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511968  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1463  fosmidomycin resistance protein  24.05 
 
 		 416 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0419  fosmidomycin resistance protein  24.05 
 
 		 416 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.423949  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1672  fosmidomycin resistance protein  24.05 
 
 		 417 aa  43.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0744  fosmidomycin resistance protein  24.05 
 
 		 416 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944019  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0930  fosmidomycin resistance protein  24.05 
 
 		 416 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1849  fosmidomycin resistance protein  24.05 
 
 		 417 aa  43.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2104  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 404 aa  43.1  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965781  normal  0.443718 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>