175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1427 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1427  major facilitator transporter  100 
 
 		 445 aa  871    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.08987  normal  0.773865 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2104  major facilitator superfamily MFS_1  61.74 
 
 		 404 aa  392  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965781  normal  0.443718 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2144  major facilitator transporter  59.49 
 
 		 400 aa  360  2e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2421  major facilitator superfamily MFS_1  62.47 
 
 		 400 aa  351  1e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.107516 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2673  major facilitator transporter  50.26 
 
 		 403 aa  346  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6132  major facilitator transporter  50 
 
 		 403 aa  346  4e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6420  major facilitator transporter  50 
 
 		 383 aa  346  5e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5584  major facilitator transporter  49.87 
 
 		 406 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5948  major facilitator transporter  49.87 
 
 		 406 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.291144 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6449  major facilitator transporter  50 
 
 		 406 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0185  major facilitator superfamily MFS_1  49.63 
 
 		 401 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.73097 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4416  major facilitator transporter  49.48 
 
 		 408 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  26.35 
 
 		 443 aa  68.9  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  26.03 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3928  major facilitator superfamily MFS_1  25.61 
 
 		 420 aa  64.7  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  25.7 
 
 		 436 aa  63.9  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0419  major facilitator transporter  24.63 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.42011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 439 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1964  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 440 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 439 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 439 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 440 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1610  major facilitator transporter  28 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  24.63 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1115  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 440 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  25.11 
 
 		 450 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  26.51 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 443 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5829  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 422 aa  55.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50804  normal  0.878008 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2104  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 391 aa  54.3  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.314279 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2522  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 		 440 aa  53.9  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.636456  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2630  fosmidomycin resistance protein  27.03 
 
 		 420 aa  53.5  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2437  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 		 396 aa  53.9  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905943  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0930  fosmidomycin resistance protein  26.72 
 
 		 416 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1849  fosmidomycin resistance protein  26.72 
 
 		 417 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0367  permease  22.69 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.32941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3837  major facilitator superfamily MFS_1  22.82 
 
 		 400 aa  52.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.791856  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1463  fosmidomycin resistance protein  26.72 
 
 		 416 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0419  fosmidomycin resistance protein  26.72 
 
 		 416 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.423949  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1672  fosmidomycin resistance protein  26.72 
 
 		 417 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1694  fosmidomycin resistance protein  26.72 
 
 		 417 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511968  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0744  fosmidomycin resistance protein  26.72 
 
 		 416 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944019  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2341  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 		 417 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  24.72 
 
 		 439 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  22.68 
 
 		 427 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  22.35 
 
 		 449 aa  52  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 423 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 423 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0474  major facilitator transporter  25.55 
 
 		 398 aa  52.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0134  regulatory protein UhpC  20.63 
 
 		 443 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3215  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 430 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 408 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  22.47 
 
 		 429 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  22.32 
 
 		 422 aa  51.6  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 439 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  22.69 
 
 		 449 aa  51.6  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1292  major facilitator transporter  24.63 
 
 		 416 aa  51.2  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0269507 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4112  major facilitator transporter  22.88 
 
 		 397 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0806371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2676  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 396 aa  51.2  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.149282  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 439 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0005  major facilitator superfamily MFS_1  23.16 
 
 		 396 aa  50.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4835  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 403 aa  50.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4078  regulatory protein UhpC  24.81 
 
 		 443 aa  50.4  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  23.48 
 
 		 427 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4130  regulatory protein UhpC  24.81 
 
 		 453 aa  50.8  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.543128  normal  0.246836 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0083  regulatory protein UhpC  24.81 
 
 		 443 aa  50.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.644662  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0414  fosmidomycin resistance protein  27.78 
 
 		 248 aa  50.4  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1478  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 402 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  24.77 
 
 		 430 aa  50.1  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000089  hexose phosphate uptake regulatory protein UhpC  25.45 
 
 		 446 aa  50.1  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  23.39 
 
 		 433 aa  50.1  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0571  fosmidomycin resistance protein  27.78 
 
 		 406 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.652835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0523  fosmidomycin resistance protein  27.78 
 
 		 406 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00430  predicted fosmidomycin efflux system  27.78 
 
 		 406 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3131  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 406 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2366  antibiotic MFS transporter, putative  27.85 
 
 		 420 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  21.85 
 
 		 453 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4757  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 405 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54337  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  23.88 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00435  hypothetical protein  27.78 
 
 		 406 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  22.73 
 
 		 434 aa  49.3  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0556  fosmidomycin resistance protein  27.78 
 
 		 406 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0518  fosmidomycin resistance protein  26.02 
 
 		 406 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3137  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 406 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.546423  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  24.46 
 
 		 430 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3577  hypothetical protein  26.26 
 
 		 421 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.972735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3329  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 410 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.707628 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  21.35 
 
 		 418 aa  49.3  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 410 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3939  major facilitator superfamily MFS_1  23.43 
 
 		 407 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  21.85 
 
 		 453 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  21.85 
 
 		 453 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  23.26 
 
 		 430 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0958  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 406 aa  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  21.85 
 
 		 453 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>