276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4416 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4416  major facilitator transporter  100 
 
 		 408 aa  768    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6132  major facilitator transporter  55.67 
 
 		 403 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2673  major facilitator transporter  55.27 
 
 		 403 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6420  major facilitator transporter  56.76 
 
 		 383 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0185  major facilitator superfamily MFS_1  61.1 
 
 		 401 aa  376  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.73097 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5584  major facilitator transporter  56.3 
 
 		 406 aa  352  8e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5948  major facilitator transporter  56.3 
 
 		 406 aa  352  8e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.291144 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6449  major facilitator transporter  55.67 
 
 		 406 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1427  major facilitator transporter  47.64 
 
 		 445 aa  312  9e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.08987  normal  0.773865 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2104  major facilitator superfamily MFS_1  53.21 
 
 		 404 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965781  normal  0.443718 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2144  major facilitator transporter  54.66 
 
 		 400 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2421  major facilitator superfamily MFS_1  53.94 
 
 		 400 aa  276  5e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.107516 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1292  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 416 aa  67.8  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0269507 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  27.42 
 
 		 448 aa  67  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  28.26 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1181  MFS family transporter  26.25 
 
 		 393 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2594  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0751  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207207  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  24.16 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  25.15 
 
 		 440 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  28.62 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0569  major facilitator family transporter  27.04 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.676652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0628  major facilitator family transporter  27.04 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0574  major facilitator family transporter  27.04 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.84757 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13070  MFS family transporter  26.25 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3939  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 436 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 417 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1372  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 479 aa  58.9  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1519  major facilitator transporter  24.84 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.496216 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 450 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0005  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8624  major facilitator superfamily MFS_1  22.78 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.860223  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0694  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.794303  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 417 aa  57  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0567  major facilitator family transporter  26.76 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 479 aa  56.6  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0102  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.346364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 414 aa  56.2  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2437  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 		 396 aa  55.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 468 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  25.98 
 
 		 436 aa  56.2  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 468 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 		 418 aa  56.2  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 433 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  23.47 
 
 		 456 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6505  major facilitator superfamily MFS_1  25.37 
 
 		 400 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 397 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 439 aa  55.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  24.32 
 
 		 454 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0231  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 409 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 437 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  23.99 
 
 		 453 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  24.32 
 
 		 454 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  24.32 
 
 		 454 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6092  major facilitator superfamily MFS_1  24.78 
 
 		 400 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 433 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3928  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 420 aa  53.9  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 433 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 429 aa  53.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  27.01 
 
 		 447 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  23.16 
 
 		 435 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  22.92 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0287  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 		 455 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 		 439 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0991  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 416 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00118055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  25.74 
 
 		 492 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1015  major facilitator superfamily MFS_1  30.96 
 
 		 479 aa  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.449105 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2963  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 		 380 aa  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3557  d-galactonate transporter  22.38 
 
 		 450 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0005  major facilitator superfamily MFS_1  25.84 
 
 		 396 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  25.53 
 
 		 434 aa  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  28.49 
 
 		 465 aa  51.2  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3531  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 		 399 aa  51.2  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  25.8 
 
 		 423 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 410 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  25.8 
 
 		 423 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 434 aa  51.2  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  22.85 
 
 		 468 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0645  major facilitator transporter  22.87 
 
 		 382 aa  50.8  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080187  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0005  major facilitator superfamily MFS_1  24.14 
 
 		 394 aa  50.8  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.695547  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2084  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 		 395 aa  50.8  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.942608 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1610  major facilitator transporter  26.24 
 
 		 388 aa  50.8  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  23.43 
 
 		 445 aa  50.8  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1982  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 434 aa  50.8  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130406  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 465 aa  50.4  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2824  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 420 aa  50.4  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0134  regulatory protein UhpC  25.35 
 
 		 443 aa  50.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2216  major facilitator superfamily transporter  27.62 
 
 		 411 aa  50.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.167097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>