158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2104 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2104  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 404 aa  756    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965781  normal  0.443718 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2144  major facilitator transporter  86.72 
 
 		 400 aa  530  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2421  major facilitator superfamily MFS_1  86.72 
 
 		 400 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.107516 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1427  major facilitator transporter  60.46 
 
 		 445 aa  413  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.08987  normal  0.773865 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6132  major facilitator transporter  52.6 
 
 		 403 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6420  major facilitator transporter  52.16 
 
 		 383 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2673  major facilitator transporter  50.66 
 
 		 403 aa  325  9e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6449  major facilitator transporter  53.28 
 
 		 406 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5584  major facilitator transporter  53.28 
 
 		 406 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5948  major facilitator transporter  53.28 
 
 		 406 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.291144 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0185  major facilitator superfamily MFS_1  56.33 
 
 		 401 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.73097 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4416  major facilitator transporter  52.93 
 
 		 408 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 400 aa  75.9  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2437  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 		 396 aa  68.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0645  major facilitator transporter  25 
 
 		 382 aa  67  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080187  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3837  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.791856  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2104  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 391 aa  62.8  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.314279 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 420 aa  61.6  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0518  fosmidomycin resistance protein  27.93 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1292  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0269507 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0566  major facilitator superfamily MFS_1  31.94 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0539  fosmidomycin resistance protein  28.05 
 
 		 406 aa  59.7  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0600  fosmidomycin resistance protein  28.05 
 
 		 406 aa  59.7  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0556  fosmidomycin resistance protein  28.05 
 
 		 406 aa  59.7  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.809506 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0546  fosmidomycin resistance protein  28.05 
 
 		 406 aa  59.7  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.268965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0414  fosmidomycin resistance protein  27.37 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0541  fosmidomycin resistance protein  27.44 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.404971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0571  fosmidomycin resistance protein  27.37 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.652835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0523  fosmidomycin resistance protein  27.37 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00430  predicted fosmidomycin efflux system  27.37 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3131  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3306  major facilitator superfamily MFS_1  31.61 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00435  hypothetical protein  27.37 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0556  fosmidomycin resistance protein  27.37 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3137  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.546423  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0958  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2963  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0102  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.346364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2943  major facilitator transporter  30 
 
 		 418 aa  56.2  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0724  XRE family transcriptional regulator  26.41 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0248517  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4835  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 403 aa  54.3  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  26.16 
 
 		 408 aa  53.9  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0419  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 396 aa  53.9  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.42011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  26.36 
 
 		 436 aa  53.5  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 443 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  25.12 
 
 		 449 aa  53.1  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  24.18 
 
 		 443 aa  53.1  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  24.18 
 
 		 443 aa  53.1  0.000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4326  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 393 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1519  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.496216 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3928  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 420 aa  52.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  23.5 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 450 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4588  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 412 aa  51.6  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 430 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1260  fosmidomycin resistance protein  26.01 
 
 		 404 aa  51.2  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0237353  hitchhiker  0.0000222003 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3033  fosmidomycin resistance protein  26.01 
 
 		 404 aa  50.8  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00068897  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 430 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4025  major facilitator superfamily fosmidomycin resistant protein  25.37 
 
 		 401 aa  50.4  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.164373  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  24.79 
 
 		 402 aa  50.4  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2676  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 396 aa  50.4  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.149282  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5829  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 422 aa  49.7  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50804  normal  0.878008 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 430 aa  49.7  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1326  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 412 aa  49.7  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686197  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1365  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 412 aa  49.7  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.399503 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2904  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2630  fosmidomycin resistance protein  26.74 
 
 		 420 aa  49.3  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1610  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 388 aa  49.7  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1844  major facilitator transporter  24.69 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  26.99 
 
 		 440 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0930  fosmidomycin resistance protein  26.74 
 
 		 416 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1964  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 440 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1849  fosmidomycin resistance protein  26.74 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0023  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 409 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0962  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1444  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1478  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 402 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1463  fosmidomycin resistance protein  26.74 
 
 		 416 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0419  fosmidomycin resistance protein  26.74 
 
 		 416 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.423949  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1672  fosmidomycin resistance protein  26.74 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1694  fosmidomycin resistance protein  26.74 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511968  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6505  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0744  fosmidomycin resistance protein  26.74 
 
 		 416 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944019  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0720  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 403 aa  48.9  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588429 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6092  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0474  major facilitator transporter  22.02 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1146  major facilitator transporter  23.71 
 
 		 406 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155488  unclonable  0.000000029988 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1422  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  24.65 
 
 		 430 aa  47.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  24.65 
 
 		 430 aa  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  32.89 
 
 		 439 aa  47.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 423 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  28.48 
 
 		 430 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 423 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1871  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 413 aa  47.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.565485  hitchhiker  0.00660368 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 439 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  28.48 
 
 		 430 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 429 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>