More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4326 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_4326  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
393 aa  768    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0817  major facilitator superfamily MFS_1  50.52 
 
 
401 aa  335  7e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2819  major facilitator superfamily MFS_1  49.34 
 
 
389 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401462  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0645  major facilitator transporter  32.39 
 
 
382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080187  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1519  major facilitator transporter  33.42 
 
 
404 aa  162  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.496216 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  29.23 
 
 
401 aa  158  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2437  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 
396 aa  157  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905943  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1226  major facilitator transporter  32.01 
 
 
391 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.184807  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2924  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 
388 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.755065  normal  0.842149 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1617  major facilitator superfamily MFS_1  32.8 
 
 
396 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000010959  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3527  major facilitator transporter  32.61 
 
 
390 aa  150  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2632  major facilitator transporter  29.46 
 
 
403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224364  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0724  XRE family transcriptional regulator  30.13 
 
 
406 aa  140  3e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0248517  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1844  major facilitator transporter  34.02 
 
 
389 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0649  major facilitator transporter  30.03 
 
 
403 aa  139  8.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0656  fosmidomycin resistance protein  30.03 
 
 
403 aa  138  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.231636  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3837  major facilitator transporter  31.27 
 
 
415 aa  139  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0282  major facilitator superfamily MFS_1  29.75 
 
 
421 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1116  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 
410 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.298595 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2458  major facilitator transporter  34.24 
 
 
410 aa  137  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1794  Xaa-Pro dipeptidase  29.52 
 
 
389 aa  137  4e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  29.86 
 
 
410 aa  136  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0102  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 
382 aa  134  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.346364  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2084  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 
395 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.942608 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3329  major facilitator transporter  29.4 
 
 
410 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.707628 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 
402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0994  major facilitator transporter  28.78 
 
 
392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.198268  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2594  major facilitator transporter  30.31 
 
 
395 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2630  fosmidomycin resistance protein  29.28 
 
 
420 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0213  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 
398 aa  130  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 
408 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3799  fosmidomycin resistance protein  32.97 
 
 
402 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.319996  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4112  major facilitator transporter  30.77 
 
 
397 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0806371  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2963  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 
380 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0930  fosmidomycin resistance protein  28.45 
 
 
416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1681  major facilitator transporter  32.97 
 
 
402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1849  fosmidomycin resistance protein  28.45 
 
 
417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0523  fosmidomycin resistance protein  31.04 
 
 
406 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1694  fosmidomycin resistance protein  28.45 
 
 
417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511968  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1672  fosmidomycin resistance protein  28.45 
 
 
417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0518  fosmidomycin resistance protein  31.04 
 
 
406 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1463  fosmidomycin resistance protein  28.45 
 
 
416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0571  fosmidomycin resistance protein  31.04 
 
 
406 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.652835  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3131  major facilitator superfamily MFS_1  31.04 
 
 
406 aa  127  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0744  fosmidomycin resistance protein  29.56 
 
 
416 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944019  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0556  fosmidomycin resistance protein  31.04 
 
 
406 aa  127  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3137  major facilitator transporter  31.04 
 
 
406 aa  127  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.546423  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0419  fosmidomycin resistance protein  29.56 
 
 
416 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.423949  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5829  major facilitator transporter  29.86 
 
 
422 aa  127  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50804  normal  0.878008 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3923  major facilitator superfamily MFS_1  30.16 
 
 
418 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4757  major facilitator transporter  32.51 
 
 
405 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54337  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1146  major facilitator transporter  29.94 
 
 
406 aa  127  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155488  unclonable  0.000000029988 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0958  major facilitator transporter  31.04 
 
 
406 aa  126  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1603  major facilitator superfamily MFS_1  31.75 
 
 
399 aa  126  6e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0711095  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00430  predicted fosmidomycin efflux system  31.04 
 
 
406 aa  126  7e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00435  hypothetical protein  31.04 
 
 
406 aa  126  7e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0367  permease  29.54 
 
 
412 aa  125  9e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.32941  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2972  major facilitator transporter  31.72 
 
 
422 aa  125  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2366  antibiotic MFS transporter, putative  29.4 
 
 
420 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1115  major facilitator transporter  31.21 
 
 
415 aa  124  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0670  ProP protein  29.43 
 
 
386 aa  125  2e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0720  major facilitator transporter  29.2 
 
 
403 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00588429 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1308  major facilitator transporter  34.5 
 
 
420 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120753  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4025  major facilitator superfamily fosmidomycin resistant protein  29 
 
 
401 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.164373  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3431  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 
404 aa  123  7e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00698685  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0600  fosmidomycin resistance protein  31.87 
 
 
406 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184073  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2362  major facilitator transporter  32.17 
 
 
392 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.951882  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0556  fosmidomycin resistance protein  31.87 
 
 
406 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.809506 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0546  fosmidomycin resistance protein  31.87 
 
 
406 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.268965  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0539  fosmidomycin resistance protein  31.87 
 
 
406 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0216  hypothetical protein  26.29 
 
 
393 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3640  major facilitator superfamily MFS_1  32 
 
 
410 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0541  fosmidomycin resistance protein  31.59 
 
 
406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.404971  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4483  major facilitator transporter  31.27 
 
 
403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.706987 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4717  major facilitator superfamily MFS_1  32 
 
 
410 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1478  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
402 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0701  MFS efflux transporter, putative  31.71 
 
 
404 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0735  major facilitator transporter  31.71 
 
 
404 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4107  major facilitator transporter  29.38 
 
 
404 aa  120  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266046  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0734  major facilitator transporter  31.71 
 
 
404 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  31.42 
 
 
431 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 
408 aa  120  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1422  major facilitator transporter  30.96 
 
 
412 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0962  major facilitator transporter  30.96 
 
 
412 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1444  major facilitator transporter  30.96 
 
 
412 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3033  fosmidomycin resistance protein  31.03 
 
 
404 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00068897  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2341  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 
417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1260  fosmidomycin resistance protein  30.48 
 
 
404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0237353  hitchhiker  0.0000222003 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1365  major facilitator transporter  30.41 
 
 
412 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.399503 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1918  fosmidomycin resistance protein  29.02 
 
 
403 aa  117  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.243949  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1874  fosmidomycin resistance protein  29.02 
 
 
403 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194019 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1871  major facilitator transporter  31.44 
 
 
413 aa  116  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.565485  hitchhiker  0.00660368 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4588  major facilitator transporter  30.41 
 
 
412 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1610  major facilitator transporter  30.77 
 
 
388 aa  116  7.999999999999999e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1603  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 
408 aa  116  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1696  fosmidomycin resistance protein  28.76 
 
 
403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00774427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1677  fosmidomycin resistance protein  28.76 
 
 
403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0817289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1652  fosmidomycin resistance protein  28.76 
 
 
403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000459515  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1437  major facilitator transporter  29.4 
 
 
402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1830  fosmidomycin resistance protein  28.76 
 
 
403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>