117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1292 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1292  major facilitator transporter  100 
 
 		 416 aa  806    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0269507 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1970  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 396 aa  247  3e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0419  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.42011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6132  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 403 aa  67  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4112  major facilitator transporter  22.06 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0806371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6420  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 383 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2437  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1115  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 415 aa  59.7  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2676  major facilitator transporter  22.99 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.149282  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  24.12 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1181  MFS family transporter  24.77 
 
 		 393 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1116  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.298595 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0645  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080187  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2972  major facilitator transporter  23.18 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3033  fosmidomycin resistance protein  23.44 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00068897  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1260  fosmidomycin resistance protein  23.44 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0237353  hitchhiker  0.0000222003 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13070  MFS family transporter  26.14 
 
 		 393 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1308  major facilitator transporter  22.85 
 
 		 420 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120753  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3913  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 421 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1836  fosmidomycin resistance protein  23.13 
 
 		 403 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0962  major facilitator transporter  24.21 
 
 		 412 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1444  major facilitator transporter  24.21 
 
 		 412 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1422  major facilitator transporter  24.21 
 
 		 412 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2341  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 		 417 aa  53.9  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1953  fosmidomycin resistance protein  23.4 
 
 		 403 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1874  fosmidomycin resistance protein  23.4 
 
 		 403 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194019 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3507  fosmidomycin resistance protein  23.13 
 
 		 403 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1696  fosmidomycin resistance protein  23.13 
 
 		 403 aa  53.1  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00774427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1677  fosmidomycin resistance protein  23.13 
 
 		 403 aa  53.1  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0817289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1652  fosmidomycin resistance protein  23.13 
 
 		 403 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000459515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1830  fosmidomycin resistance protein  23.13 
 
 		 403 aa  53.1  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1437  major facilitator transporter  24.03 
 
 		 402 aa  53.1  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1918  fosmidomycin resistance protein  23.4 
 
 		 403 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.243949  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1519  major facilitator transporter  24.36 
 
 		 404 aa  53.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.496216 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1690  major facilitator transporter  23.13 
 
 		 403 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0834  hexuronate transporter transmembrane protein  29.7 
 
 		 435 aa  52.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00560856 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4025  major facilitator superfamily fosmidomycin resistant protein  24.57 
 
 		 401 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.164373  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 398 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2104  major facilitator superfamily MFS_1  32.03 
 
 		 404 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965781  normal  0.443718 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4797  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 		 421 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.292232  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2707  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 472 aa  51.2  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2673  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 403 aa  51.6  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1146  major facilitator transporter  22.18 
 
 		 406 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155488  unclonable  0.000000029988 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2144  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 400 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  30.63 
 
 		 407 aa  51.2  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1095  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 477 aa  50.4  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6429  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 403 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4326  major facilitator superfamily MFS_1  24.83 
 
 		 393 aa  50.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1587  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 412 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2421  major facilitator superfamily MFS_1  30.06 
 
 		 400 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.107516 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1982  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 		 434 aa  49.7  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130406  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0656  fosmidomycin resistance protein  27.5 
 
 		 403 aa  49.3  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.231636  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  26.24 
 
 		 401 aa  49.7  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0649  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 403 aa  49.3  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.93 
 
 		 508 aa  49.3  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0518  fosmidomycin resistance protein  23.26 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1320  major facilitator superfamily MFS_1  23.66 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296335  hitchhiker  0.000000456317 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2083  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.71 
 
 		 529 aa  48.5  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.438087  normal  0.890804 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3131  major facilitator superfamily MFS_1  22.92 
 
 		 406 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 		 423 aa  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4588  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 412 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1326  major facilitator transporter  22.81 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686197  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0556  fosmidomycin resistance protein  22.92 
 
 		 406 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3137  major facilitator transporter  22.92 
 
 		 406 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.546423  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0523  fosmidomycin resistance protein  22.92 
 
 		 406 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1427  major facilitator transporter  24.33 
 
 		 445 aa  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.08987  normal  0.773865 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0571  fosmidomycin resistance protein  22.92 
 
 		 406 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.652835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  20.49 
 
 		 431 aa  47.4  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1871  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 413 aa  47.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.565485  hitchhiker  0.00660368 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1552  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 413 aa  47.8  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00281859  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6449  major facilitator transporter  22.65 
 
 		 406 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0185  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 		 401 aa  47.8  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.73097 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0930  fosmidomycin resistance protein  28.03 
 
 		 416 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1849  fosmidomycin resistance protein  28.03 
 
 		 417 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1463  fosmidomycin resistance protein  28.03 
 
 		 416 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0419  fosmidomycin resistance protein  28.03 
 
 		 416 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.423949  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1672  fosmidomycin resistance protein  28.03 
 
 		 417 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1694  fosmidomycin resistance protein  28.03 
 
 		 417 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511968  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0744  fosmidomycin resistance protein  28.03 
 
 		 416 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944019  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2630  fosmidomycin resistance protein  28.03 
 
 		 420 aa  47  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  23.87 
 
 		 408 aa  47  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2007  major facilitator transporter  22.95 
 
 		 423 aa  46.6  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.28785 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0734  major facilitator transporter  18.86 
 
 		 404 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1365  major facilitator transporter  22.11 
 
 		 412 aa  46.6  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.399503 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00430  predicted fosmidomycin efflux system  22.92 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00435  hypothetical protein  22.92 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2104  major facilitator transporter  21.58 
 
 		 391 aa  46.2  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.314279 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4835  major facilitator transporter  23.45 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1603  major facilitator superfamily MFS_1  22.04 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2632  major facilitator transporter  23.84 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224364  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5584  major facilitator transporter  23.02 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5948  major facilitator transporter  23.02 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.291144 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0958  major facilitator transporter  20.69 
 
 		 406 aa  45.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  24.48 
 
 		 410 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  32.48 
 
 		 411 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0724  XRE family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 406 aa  44.7  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0248517  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  30 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0735  major facilitator transporter  18.51 
 
 		 404 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>