276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1320 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1320  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
397 aa  758    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296335  hitchhiker  0.000000456317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1066  major facilitator transporter  57.03 
 
 
391 aa  326  6e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2484  major facilitator transporter  59.22 
 
 
394 aa  322  5e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1696  fosmidomycin resistance protein  29.22 
 
 
403 aa  126  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00774427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1677  fosmidomycin resistance protein  29.22 
 
 
403 aa  126  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0817289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1652  fosmidomycin resistance protein  29.22 
 
 
403 aa  126  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000459515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1830  fosmidomycin resistance protein  29.22 
 
 
403 aa  126  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2924  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 
388 aa  126  7e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.755065  normal  0.842149 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1690  major facilitator transporter  29.35 
 
 
403 aa  126  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1918  fosmidomycin resistance protein  29.22 
 
 
403 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.243949  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1953  fosmidomycin resistance protein  29.22 
 
 
403 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1437  major facilitator transporter  29.22 
 
 
402 aa  125  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3507  fosmidomycin resistance protein  29.22 
 
 
403 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1874  fosmidomycin resistance protein  29.22 
 
 
403 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194019 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1836  fosmidomycin resistance protein  28.95 
 
 
403 aa  123  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 
402 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0645  major facilitator transporter  28.3 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080187  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 
408 aa  110  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0367  permease  28.03 
 
 
412 aa  106  9e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.32941  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1519  major facilitator transporter  29.62 
 
 
404 aa  105  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.496216 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0720  major facilitator transporter  29.29 
 
 
403 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00588429 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2341  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 
417 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1116  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 
410 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.298595 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0724  XRE family transcriptional regulator  26.2 
 
 
406 aa  99  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0248517  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2437  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 
396 aa  98.2  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905943  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3837  major facilitator transporter  28.22 
 
 
415 aa  97.4  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4025  major facilitator superfamily fosmidomycin resistant protein  27.62 
 
 
401 aa  96.3  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.164373  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  26.7 
 
 
410 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 
408 aa  94.7  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3577  hypothetical protein  27.65 
 
 
421 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.972735  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1610  major facilitator transporter  29.58 
 
 
388 aa  94.7  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0649  major facilitator transporter  25.68 
 
 
403 aa  92.8  9e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1977  fosmidomycin resistance protein, putative  28.03 
 
 
403 aa  92.4  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85297  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2632  major facilitator transporter  26.27 
 
 
403 aa  92  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224364  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1645  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 
403 aa  92.4  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.849012  hitchhiker  0.000565509 
 
 
-
 
NC_004310  BR0656  fosmidomycin resistance protein  26.08 
 
 
403 aa  92  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.231636  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2007  major facilitator transporter  28.96 
 
 
423 aa  91.7  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.28785 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2084  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 
395 aa  91.7  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.942608 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4835  major facilitator transporter  29.23 
 
 
403 aa  91.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241713  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6429  major facilitator transporter  27.72 
 
 
403 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2104  major facilitator transporter  29.23 
 
 
391 aa  91.3  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.314279 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0023  major facilitator transporter  28.65 
 
 
409 aa  90.5  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1844  major facilitator transporter  28.22 
 
 
389 aa  89.4  9e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0817  major facilitator superfamily MFS_1  28.98 
 
 
401 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4107  major facilitator transporter  29.04 
 
 
404 aa  89  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266046  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2630  fosmidomycin resistance protein  26.8 
 
 
420 aa  89.4  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2676  major facilitator transporter  28.57 
 
 
396 aa  89.4  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.149282  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2458  major facilitator transporter  27.99 
 
 
410 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0744  fosmidomycin resistance protein  27.35 
 
 
416 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944019  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1226  major facilitator transporter  27.05 
 
 
391 aa  88.6  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.184807  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1166  major facilitator transporter  27.75 
 
 
421 aa  88.2  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0419  fosmidomycin resistance protein  27.35 
 
 
416 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.423949  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0930  fosmidomycin resistance protein  27.35 
 
 
416 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1849  fosmidomycin resistance protein  27.35 
 
 
417 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1694  fosmidomycin resistance protein  27.35 
 
 
417 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511968  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1115  major facilitator transporter  28.81 
 
 
415 aa  87.8  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1672  fosmidomycin resistance protein  27.35 
 
 
417 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3329  major facilitator transporter  26.65 
 
 
410 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.707628 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1617  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 
396 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000010959  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1463  fosmidomycin resistance protein  27.35 
 
 
416 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1794  Xaa-Pro dipeptidase  26.1 
 
 
389 aa  87.4  4e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2366  antibiotic MFS transporter, putative  27.16 
 
 
420 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6092  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 
400 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0053  major facilitator transporter  28.46 
 
 
419 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3640  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 
410 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2963  major facilitator superfamily MFS_1  30.09 
 
 
380 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4717  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 
410 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521537 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1552  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 
413 aa  84.7  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00281859  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3431  major facilitator superfamily MFS_1  31.96 
 
 
404 aa  84.7  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00698685  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0994  major facilitator transporter  29.57 
 
 
392 aa  84.3  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.198268  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  29.29 
 
 
431 aa  84  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0102  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 
382 aa  83.6  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.346364  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1603  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 
399 aa  83.6  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0711095  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  24.49 
 
 
401 aa  83.6  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2594  major facilitator transporter  26.27 
 
 
395 aa  82.8  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0474  major facilitator transporter  29.4 
 
 
398 aa  82.8  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812694  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2972  major facilitator transporter  27.9 
 
 
422 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1587  major facilitator transporter  29.05 
 
 
412 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6505  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 
400 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127279  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1340  major facilitator superfamily multidrug (fosmidomycin) efflux transporter  26.87 
 
 
420 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2794  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 
419 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572754  normal  0.513078 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0213  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 
398 aa  79.7  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0137  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 
420 aa  79  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0222229  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3033  fosmidomycin resistance protein  27.57 
 
 
404 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00068897  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0412  putative fosmidomycin resistance antibiotic resistance transmembrane protein  27.17 
 
 
411 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  normal  0.519743 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4112  major facilitator transporter  27.17 
 
 
397 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0806371  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1260  fosmidomycin resistance protein  27.3 
 
 
404 aa  76.6  0.0000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0237353  hitchhiker  0.0000222003 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1871  major facilitator transporter  27.22 
 
 
413 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.565485  hitchhiker  0.00660368 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3923  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
418 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1603  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 
408 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0670  ProP protein  27.79 
 
 
386 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1146  major facilitator transporter  25.67 
 
 
406 aa  75.5  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155488  unclonable  0.000000029988 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5829  major facilitator transporter  28.14 
 
 
422 aa  74.7  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50804  normal  0.878008 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1422  major facilitator transporter  26.12 
 
 
412 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0962  major facilitator transporter  26.12 
 
 
412 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1444  major facilitator transporter  26.12 
 
 
412 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1365  major facilitator transporter  26.61 
 
 
412 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.399503 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3527  major facilitator transporter  26.91 
 
 
390 aa  73.2  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2162  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 
411 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0518  fosmidomycin resistance protein  26.26 
 
 
406 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>