230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0817 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0817  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 401 aa  785    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4326  major facilitator superfamily MFS_1  51.35 
 
 		 393 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2819  major facilitator superfamily MFS_1  49.09 
 
 		 389 aa  292  6e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0645  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 382 aa  179  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080187  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2437  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 		 396 aa  178  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1519  major facilitator transporter  33.84 
 
 		 404 aa  172  6.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.496216 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2924  major facilitator superfamily MFS_1  32.9 
 
 		 388 aa  171  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.755065  normal  0.842149 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 401 aa  168  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1617  major facilitator superfamily MFS_1  34.02 
 
 		 396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000010959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1226  major facilitator transporter  32.32 
 
 		 391 aa  162  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.184807  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0724  XRE family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 406 aa  159  6e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0248517  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1794  Xaa-Pro dipeptidase  31.63 
 
 		 389 aa  150  5e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0670  ProP protein  31.22 
 
 		 386 aa  142  8e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3527  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 390 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0137  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 		 420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0222229  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1844  major facilitator transporter  33.04 
 
 		 389 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2084  major facilitator superfamily MFS_1  32.22 
 
 		 395 aa  137  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.942608 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2341  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 		 417 aa  136  8e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0994  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 392 aa  133  6e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.198268  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0216  hypothetical protein  28.25 
 
 		 393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1478  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3431  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 		 404 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00698685  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0213  major facilitator superfamily MFS_1  31.76 
 
 		 398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3799  fosmidomycin resistance protein  31.3 
 
 		 402 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.319996  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2632  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 403 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224364  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1681  major facilitator transporter  31.84 
 
 		 402 aa  126  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3837  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 415 aa  126  7e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 410 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0656  fosmidomycin resistance protein  28.17 
 
 		 403 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.231636  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1977  fosmidomycin resistance protein, putative  29.85 
 
 		 403 aa  125  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85297  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1645  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 		 403 aa  125  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.849012  hitchhiker  0.000565509 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0649  major facilitator transporter  28.32 
 
 		 403 aa  124  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0734  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 404 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4483  major facilitator transporter  30.31 
 
 		 403 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.706987 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 		 408 aa  123  6e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0102  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 		 382 aa  122  8e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.346364  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0930  fosmidomycin resistance protein  28.39 
 
 		 416 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1849  fosmidomycin resistance protein  28.39 
 
 		 417 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1463  fosmidomycin resistance protein  28.39 
 
 		 416 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1672  fosmidomycin resistance protein  28.39 
 
 		 417 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1694  fosmidomycin resistance protein  28.39 
 
 		 417 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511968  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2676  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 396 aa  120  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.149282  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0701  MFS efflux transporter, putative  30.51 
 
 		 404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0735  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2630  fosmidomycin resistance protein  28.42 
 
 		 420 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0419  fosmidomycin resistance protein  28.14 
 
 		 416 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.423949  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0744  fosmidomycin resistance protein  28.14 
 
 		 416 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944019  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1146  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 406 aa  119  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155488  unclonable  0.000000029988 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4757  major facilitator transporter  30.31 
 
 		 405 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54337  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1116  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 		 410 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.298595 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2594  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 395 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 		 408 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0282  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 		 421 aa  116  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0367  permease  29.38 
 
 		 412 aa  116  7.999999999999999e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.32941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0720  major facilitator transporter  31.08 
 
 		 403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588429 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2852  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 		 371 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0477779  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4835  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1552  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 413 aa  114  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00281859  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3329  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 410 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.707628 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4112  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 397 aa  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0806371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1365  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.399503 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1340  major facilitator superfamily multidrug (fosmidomycin) efflux transporter  30.1 
 
 		 420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  27.79 
 
 		 431 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2362  major facilitator transporter  30.25 
 
 		 392 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.951882  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2366  antibiotic MFS transporter, putative  27.71 
 
 		 420 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1871  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 413 aa  111  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.565485  hitchhiker  0.00660368 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1587  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 412 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2458  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 410 aa  111  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1603  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 		 399 aa  110  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0711095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2963  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 		 380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4588  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 412 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3640  major facilitator superfamily MFS_1  29.11 
 
 		 410 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4717  major facilitator superfamily MFS_1  29.11 
 
 		 410 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521537 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2794  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 		 419 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572754  normal  0.513078 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0958  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 406 aa  109  8.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5829  major facilitator transporter  28.28 
 
 		 422 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50804  normal  0.878008 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2336  major facilitator transporter  32.32 
 
 		 368 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1610  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1326  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0962  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 412 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1444  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 412 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3033  fosmidomycin resistance protein  27.46 
 
 		 404 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00068897  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1260  fosmidomycin resistance protein  27.2 
 
 		 404 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0237353  hitchhiker  0.0000222003 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1422  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 412 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1918  fosmidomycin resistance protein  28.46 
 
 		 403 aa  107  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.243949  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3507  fosmidomycin resistance protein  28.24 
 
 		 403 aa  106  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1874  fosmidomycin resistance protein  28.28 
 
 		 403 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194019 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3131  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 		 406 aa  106  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0523  fosmidomycin resistance protein  27.6 
 
 		 406 aa  106  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0571  fosmidomycin resistance protein  27.6 
 
 		 406 aa  106  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.652835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1115  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 415 aa  106  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0556  fosmidomycin resistance protein  27.6 
 
 		 406 aa  106  8e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0518  fosmidomycin resistance protein  27.6 
 
 		 406 aa  106  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3137  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 406 aa  106  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.546423  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2007  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 423 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.28785 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1677  fosmidomycin resistance protein  28.28 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0817289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1652  fosmidomycin resistance protein  28.28 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000459515  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1953  fosmidomycin resistance protein  28.28 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3577  hypothetical protein  26.74 
 
 		 421 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.972735  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>