153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0282 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0282  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 421 aa  800    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3431  major facilitator superfamily MFS_1  48.43 
 
 		 404 aa  253  6e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00698685  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0670  ProP protein  36.36 
 
 		 386 aa  216  4e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2852  major facilitator superfamily MFS_1  41.62 
 
 		 371 aa  210  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0477779  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1478  major facilitator superfamily MFS_1  38.64 
 
 		 402 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0137  major facilitator superfamily MFS_1  36.77 
 
 		 420 aa  202  6e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0222229  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2341  major facilitator superfamily MFS_1  35.68 
 
 		 417 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1794  Xaa-Pro dipeptidase  33.42 
 
 		 389 aa  197  4.0000000000000005e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2336  major facilitator transporter  40.87 
 
 		 368 aa  189  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1226  major facilitator transporter  40.5 
 
 		 391 aa  187  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.184807  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2804  major facilitator superfamily MFS_1  38.17 
 
 		 403 aa  185  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0158758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1519  major facilitator transporter  35.98 
 
 		 404 aa  175  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.496216 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3527  major facilitator transporter  33.94 
 
 		 390 aa  170  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1617  major facilitator superfamily MFS_1  32.57 
 
 		 396 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000010959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  31.17 
 
 		 410 aa  130  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  29.75 
 
 		 408 aa  129  7.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2437  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0367  permease  27.61 
 
 		 412 aa  124  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.32941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3329  major facilitator transporter  31.17 
 
 		 410 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.707628 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4326  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 393 aa  123  8e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2924  major facilitator superfamily MFS_1  29.58 
 
 		 388 aa  123  8e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.755065  normal  0.842149 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2630  fosmidomycin resistance protein  29.46 
 
 		 420 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0645  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 382 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080187  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5829  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50804  normal  0.878008 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3131  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1918  fosmidomycin resistance protein  28.54 
 
 		 403 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.243949  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0556  fosmidomycin resistance protein  28.53 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3137  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.546423  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0571  fosmidomycin resistance protein  28.53 
 
 		 406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.652835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0523  fosmidomycin resistance protein  28.53 
 
 		 406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1874  fosmidomycin resistance protein  28.4 
 
 		 403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194019 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  27.74 
 
 		 402 aa  117  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0419  fosmidomycin resistance protein  28.53 
 
 		 416 aa  117  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.423949  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0744  fosmidomycin resistance protein  28.53 
 
 		 416 aa  117  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944019  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0930  fosmidomycin resistance protein  28.53 
 
 		 416 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1849  fosmidomycin resistance protein  28.53 
 
 		 417 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1463  fosmidomycin resistance protein  28.53 
 
 		 416 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1672  fosmidomycin resistance protein  28.53 
 
 		 417 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1694  fosmidomycin resistance protein  28.53 
 
 		 417 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511968  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1953  fosmidomycin resistance protein  28.29 
 
 		 403 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0213  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 398 aa  116  7.999999999999999e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0556  fosmidomycin resistance protein  29.22 
 
 		 406 aa  116  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.809506 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1437  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 402 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0546  fosmidomycin resistance protein  29.22 
 
 		 406 aa  116  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.268965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0539  fosmidomycin resistance protein  29.22 
 
 		 406 aa  116  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0600  fosmidomycin resistance protein  29.22 
 
 		 406 aa  116  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184073  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1696  fosmidomycin resistance protein  28.29 
 
 		 403 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00774427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1677  fosmidomycin resistance protein  28.29 
 
 		 403 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0817289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1652  fosmidomycin resistance protein  28.29 
 
 		 403 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000459515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1830  fosmidomycin resistance protein  28.29 
 
 		 403 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0518  fosmidomycin resistance protein  28.27 
 
 		 406 aa  116  8.999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00430  predicted fosmidomycin efflux system  28.53 
 
 		 406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0541  fosmidomycin resistance protein  28.95 
 
 		 406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.404971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3033  fosmidomycin resistance protein  29.92 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00068897  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00435  hypothetical protein  28.53 
 
 		 406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2366  antibiotic MFS transporter, putative  30.35 
 
 		 420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0958  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1260  fosmidomycin resistance protein  29.38 
 
 		 404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0237353  hitchhiker  0.0000222003 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3507  fosmidomycin resistance protein  28.37 
 
 		 403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0817  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 		 401 aa  114  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2104  major facilitator transporter  32.01 
 
 		 391 aa  114  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.314279 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1116  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.298595 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1836  fosmidomycin resistance protein  27.54 
 
 		 403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0720  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588429 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1690  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6505  major facilitator superfamily MFS_1  30.12 
 
 		 400 aa  110  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0724  XRE family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 406 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0248517  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0734  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 404 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2084  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.942608 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4588  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0701  MFS efflux transporter, putative  30.36 
 
 		 404 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2794  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 		 419 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572754  normal  0.513078 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0735  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 404 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2676  major facilitator transporter  29.28 
 
 		 396 aa  107  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.149282  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1603  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 		 399 aa  107  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0711095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6092  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 		 400 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1587  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 412 aa  107  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1645  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 403 aa  106  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.849012  hitchhiker  0.000565509 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1977  fosmidomycin resistance protein, putative  28.95 
 
 		 403 aa  106  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85297  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1871  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 413 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.565485  hitchhiker  0.00660368 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  30.08 
 
 		 431 aa  105  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2632  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 403 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224364  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1365  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 412 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.399503 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1326  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 412 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686197  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1340  major facilitator superfamily multidrug (fosmidomycin) efflux transporter  28.65 
 
 		 420 aa  103  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4835  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 403 aa  103  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 		 408 aa  103  8e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1146  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 406 aa  102  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155488  unclonable  0.000000029988 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1422  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2819  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 389 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0962  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 412 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1444  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 412 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0216  hypothetical protein  28.13 
 
 		 393 aa  100  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3837  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 415 aa  100  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0474  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 398 aa  100  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3923  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 		 418 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0649  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 403 aa  99.8  8e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3640  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 410 aa  99.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4483  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 403 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.706987 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>