156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0137 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0137  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 420 aa  828    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0222229  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2341  major facilitator superfamily MFS_1  34.71 
 
 		 417 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3431  major facilitator superfamily MFS_1  39.41 
 
 		 404 aa  202  7e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00698685  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1794  Xaa-Pro dipeptidase  33.87 
 
 		 389 aa  196  9e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1478  major facilitator superfamily MFS_1  37.29 
 
 		 402 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2852  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 		 371 aa  186  9e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0477779  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0282  major facilitator superfamily MFS_1  37.03 
 
 		 421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1226  major facilitator transporter  34.96 
 
 		 391 aa  167  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.184807  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2336  major facilitator transporter  38.75 
 
 		 368 aa  166  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0670  ProP protein  30.91 
 
 		 386 aa  162  9e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1519  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 404 aa  162  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.496216 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1617  major facilitator superfamily MFS_1  31.09 
 
 		 396 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000010959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2804  major facilitator superfamily MFS_1  34.77 
 
 		 403 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0158758  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2924  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 		 388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.755065  normal  0.842149 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3527  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 390 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 408 aa  127  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0645  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 382 aa  126  7e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080187  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0817  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 		 401 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 		 402 aa  123  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2632  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 403 aa  122  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224364  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3837  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 415 aa  122  8e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2437  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 		 396 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0724  XRE family transcriptional regulator  24.94 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0248517  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1836  fosmidomycin resistance protein  27.63 
 
 		 403 aa  116  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0656  fosmidomycin resistance protein  28.9 
 
 		 403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.231636  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 401 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3507  fosmidomycin resistance protein  27.14 
 
 		 403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1874  fosmidomycin resistance protein  26.89 
 
 		 403 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194019 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1690  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1696  fosmidomycin resistance protein  26.89 
 
 		 403 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00774427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1677  fosmidomycin resistance protein  26.89 
 
 		 403 aa  114  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0817289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1652  fosmidomycin resistance protein  26.89 
 
 		 403 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000459515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1830  fosmidomycin resistance protein  26.89 
 
 		 403 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1953  fosmidomycin resistance protein  26.89 
 
 		 403 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0649  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 410 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1918  fosmidomycin resistance protein  27.49 
 
 		 403 aa  112  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.243949  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 		 408 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4835  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 403 aa  109  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1437  major facilitator transporter  26.52 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2630  fosmidomycin resistance protein  26.72 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0419  fosmidomycin resistance protein  26.34 
 
 		 416 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.423949  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0744  fosmidomycin resistance protein  26.34 
 
 		 416 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944019  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2676  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 396 aa  104  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.149282  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0930  fosmidomycin resistance protein  26.1 
 
 		 416 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1849  fosmidomycin resistance protein  26.1 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1463  fosmidomycin resistance protein  26.1 
 
 		 416 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1672  fosmidomycin resistance protein  26.1 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1694  fosmidomycin resistance protein  26.1 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511968  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0958  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 406 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0213  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 398 aa  102  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3329  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 410 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.707628 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0216  hypothetical protein  27.14 
 
 		 393 aa  101  3e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1645  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 403 aa  100  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.849012  hitchhiker  0.000565509 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1977  fosmidomycin resistance protein, putative  28.3 
 
 		 403 aa  100  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85297  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4025  major facilitator superfamily fosmidomycin resistant protein  28.27 
 
 		 401 aa  99.8  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.164373  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0571  fosmidomycin resistance protein  26.42 
 
 		 406 aa  99.8  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.652835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0523  fosmidomycin resistance protein  26.42 
 
 		 406 aa  99.8  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3131  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 406 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2366  antibiotic MFS transporter, putative  28.35 
 
 		 420 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0556  fosmidomycin resistance protein  26.42 
 
 		 406 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3137  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 406 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.546423  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2972  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 422 aa  99  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00430  predicted fosmidomycin efflux system  26.42 
 
 		 406 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0367  permease  25.4 
 
 		 412 aa  98.2  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.32941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0518  fosmidomycin resistance protein  26.15 
 
 		 406 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2794  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 419 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572754  normal  0.513078 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1116  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 		 410 aa  98.2  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.298595 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00435  hypothetical protein  26.42 
 
 		 406 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4757  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 405 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54337  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2819  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 		 389 aa  97.4  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5829  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 422 aa  97.1  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50804  normal  0.878008 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0474  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 398 aa  96.3  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1166  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 421 aa  95.9  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1340  major facilitator superfamily multidrug (fosmidomycin) efflux transporter  28.08 
 
 		 420 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0023  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 409 aa  95.1  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2084  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 395 aa  95.1  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.942608 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3799  fosmidomycin resistance protein  28.71 
 
 		 402 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.319996  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3577  hypothetical protein  27.43 
 
 		 421 aa  93.2  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.972735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0546  fosmidomycin resistance protein  25.15 
 
 		 406 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.268965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0539  fosmidomycin resistance protein  25.15 
 
 		 406 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0600  fosmidomycin resistance protein  25.15 
 
 		 406 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0556  fosmidomycin resistance protein  25.15 
 
 		 406 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.809506 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0541  fosmidomycin resistance protein  25.15 
 
 		 406 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.404971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1681  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 402 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6505  major facilitator superfamily MFS_1  26.16 
 
 		 400 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  27.54 
 
 		 431 aa  92  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1146  major facilitator transporter  23.93 
 
 		 406 aa  91.3  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155488  unclonable  0.000000029988 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6092  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 		 400 aa  90.9  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3913  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 421 aa  90.5  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4112  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 397 aa  90.1  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0806371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0720  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 403 aa  90.1  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588429 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4483  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 403 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.706987 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1552  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 413 aa  89.7  8e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00281859  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1603  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 		 399 aa  89.4  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0711095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3640  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 		 410 aa  89  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1587  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 412 aa  89  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4717  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 		 410 aa  89  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521537 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2458  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 410 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1115  major facilitator transporter  26.24 
 
 		 415 aa  87.4  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>