More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4717 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4717  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 410 aa  811    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521537 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3640  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 410 aa  811    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0412  putative fosmidomycin resistance antibiotic resistance transmembrane protein  88.18 
 
 		 411 aa  617  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  normal  0.519743 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1340  major facilitator superfamily multidrug (fosmidomycin) efflux transporter  74.17 
 
 		 420 aa  554  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0930  fosmidomycin resistance protein  71.17 
 
 		 416 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1672  fosmidomycin resistance protein  71.17 
 
 		 417 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1849  fosmidomycin resistance protein  71.17 
 
 		 417 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1463  fosmidomycin resistance protein  71.17 
 
 		 416 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1694  fosmidomycin resistance protein  71.17 
 
 		 417 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511968  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1587  major facilitator transporter  74.74 
 
 		 412 aa  546  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0744  fosmidomycin resistance protein  70.92 
 
 		 416 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944019  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0419  fosmidomycin resistance protein  70.92 
 
 		 416 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.423949  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2630  fosmidomycin resistance protein  70.66 
 
 		 420 aa  547  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2794  major facilitator superfamily MFS_1  74.48 
 
 		 419 aa  546  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572754  normal  0.513078 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0023  major facilitator transporter  71.67 
 
 		 409 aa  537  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1422  major facilitator transporter  72.56 
 
 		 412 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1365  major facilitator transporter  72.56 
 
 		 412 aa  531  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.399503 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0962  major facilitator transporter  72.56 
 
 		 412 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1326  major facilitator transporter  72.56 
 
 		 412 aa  531  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686197  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1444  major facilitator transporter  72.56 
 
 		 412 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4588  major facilitator transporter  70.65 
 
 		 412 aa  529  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1871  major facilitator transporter  72.82 
 
 		 413 aa  529  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.565485  hitchhiker  0.00660368 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1116  major facilitator superfamily MFS_1  62.4 
 
 		 410 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.298595 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1146  major facilitator transporter  66.42 
 
 		 406 aa  498  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155488  unclonable  0.000000029988 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0053  major facilitator transporter  70.97 
 
 		 419 aa  496  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1260  fosmidomycin resistance protein  66.84 
 
 		 404 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0237353  hitchhiker  0.0000222003 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3033  fosmidomycin resistance protein  66.58 
 
 		 404 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00068897  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0571  fosmidomycin resistance protein  64.76 
 
 		 406 aa  488  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.652835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0523  fosmidomycin resistance protein  64.76 
 
 		 406 aa  488  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00430  predicted fosmidomycin efflux system  65.4 
 
 		 406 aa  485  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3131  major facilitator superfamily MFS_1  65.4 
 
 		 406 aa  486  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0656  fosmidomycin resistance protein  61.93 
 
 		 403 aa  486  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.231636  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0649  major facilitator transporter  61.93 
 
 		 403 aa  486  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00435  hypothetical protein  65.4 
 
 		 406 aa  485  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0556  fosmidomycin resistance protein  65.4 
 
 		 406 aa  486  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3137  major facilitator transporter  65.4 
 
 		 406 aa  486  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.546423  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0518  fosmidomycin resistance protein  65.15 
 
 		 406 aa  485  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0958  major facilitator transporter  64.02 
 
 		 406 aa  483  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2632  major facilitator transporter  61.99 
 
 		 403 aa  484  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224364  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1603  major facilitator superfamily MFS_1  62.9 
 
 		 408 aa  480  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3837  major facilitator transporter  59.15 
 
 		 415 aa  472  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0546  fosmidomycin resistance protein  66.67 
 
 		 406 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.268965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0556  fosmidomycin resistance protein  66.67 
 
 		 406 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.809506 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0541  fosmidomycin resistance protein  66.41 
 
 		 406 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.404971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3923  major facilitator superfamily MFS_1  62.11 
 
 		 418 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0539  fosmidomycin resistance protein  66.67 
 
 		 406 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0600  fosmidomycin resistance protein  66.67 
 
 		 406 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4107  major facilitator transporter  60.2 
 
 		 404 aa  466  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266046  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1977  fosmidomycin resistance protein, putative  63.09 
 
 		 403 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85297  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1645  major facilitator superfamily MFS_1  63.09 
 
 		 403 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.849012  hitchhiker  0.000565509 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2007  major facilitator transporter  63.31 
 
 		 423 aa  450  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.28785 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0720  major facilitator transporter  59.55 
 
 		 403 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588429 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4112  major facilitator transporter  60.2 
 
 		 397 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0806371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  57.54 
 
 		 408 aa  440  9.999999999999999e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2972  major facilitator transporter  57.99 
 
 		 422 aa  436  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2676  major facilitator transporter  56.78 
 
 		 396 aa  437  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.149282  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1115  major facilitator transporter  59.95 
 
 		 415 aa  436  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  56.27 
 
 		 410 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5829  major facilitator transporter  57.66 
 
 		 422 aa  434  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50804  normal  0.878008 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4757  major facilitator transporter  60.21 
 
 		 405 aa  432  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54337  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1603  major facilitator superfamily MFS_1  59.69 
 
 		 399 aa  434  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0711095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4835  major facilitator transporter  59.8 
 
 		 403 aa  429  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6092  major facilitator superfamily MFS_1  58.84 
 
 		 400 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  57.14 
 
 		 431 aa  429  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1681  major facilitator transporter  58.29 
 
 		 402 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6505  major facilitator superfamily MFS_1  58.79 
 
 		 400 aa  425  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127279  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0701  MFS efflux transporter, putative  59.34 
 
 		 404 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3799  fosmidomycin resistance protein  58.27 
 
 		 402 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.319996  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0734  major facilitator transporter  59.34 
 
 		 404 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0735  major facilitator transporter  59.18 
 
 		 404 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3329  major facilitator transporter  57.92 
 
 		 410 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.707628 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2458  major facilitator transporter  58.55 
 
 		 410 aa  422  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0474  major facilitator transporter  58.17 
 
 		 398 aa  424  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4483  major facilitator transporter  58.57 
 
 		 403 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.706987 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  53.48 
 
 		 408 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0367  permease  52.35 
 
 		 412 aa  412  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.32941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1308  major facilitator transporter  59.95 
 
 		 420 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120753  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2366  antibiotic MFS transporter, putative  57.66 
 
 		 420 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4797  major facilitator superfamily MFS_1  59.95 
 
 		 421 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.292232  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3913  major facilitator transporter  60.47 
 
 		 421 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6429  major facilitator transporter  56.14 
 
 		 403 aa  404  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1166  major facilitator transporter  54.19 
 
 		 421 aa  399  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4025  major facilitator superfamily fosmidomycin resistant protein  53.37 
 
 		 401 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.164373  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2162  major facilitator superfamily MFS_1  62.67 
 
 		 411 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3577  hypothetical protein  51.53 
 
 		 421 aa  395  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.972735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2104  major facilitator transporter  56.44 
 
 		 391 aa  394  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.314279 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1043  major facilitator transporter  59.45 
 
 		 415 aa  385  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605275 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1170  major facilitator superfamily MFS_1  59.45 
 
 		 415 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.147511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0973  major facilitator superfamily MFS_1  59.06 
 
 		 435 aa  374  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1552  major facilitator superfamily MFS_1  47.5 
 
 		 413 aa  370  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00281859  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  43.56 
 
 		 402 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1437  major facilitator transporter  43.3 
 
 		 402 aa  319  5e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1690  major facilitator transporter  43.37 
 
 		 403 aa  319  5e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1918  fosmidomycin resistance protein  43.37 
 
 		 403 aa  319  6e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.243949  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1836  fosmidomycin resistance protein  43.37 
 
 		 403 aa  318  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1696  fosmidomycin resistance protein  43.11 
 
 		 403 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00774427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1677  fosmidomycin resistance protein  43.11 
 
 		 403 aa  317  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0817289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1652  fosmidomycin resistance protein  43.11 
 
 		 403 aa  317  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000459515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1830  fosmidomycin resistance protein  43.11 
 
 		 403 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3507  fosmidomycin resistance protein  43.37 
 
 		 403 aa  318  2e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>