158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1478 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1478  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 402 aa  773    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2852  major facilitator superfamily MFS_1  60.98 
 
 		 371 aa  379  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0477779  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2336  major facilitator transporter  65.06 
 
 		 368 aa  372  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3431  major facilitator superfamily MFS_1  48.97 
 
 		 404 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00698685  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2341  major facilitator superfamily MFS_1  35.78 
 
 		 417 aa  197  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1794  Xaa-Pro dipeptidase  32.64 
 
 		 389 aa  193  4e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0282  major facilitator superfamily MFS_1  39.52 
 
 		 421 aa  192  7e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0137  major facilitator superfamily MFS_1  37.29 
 
 		 420 aa  187  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0222229  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0670  ProP protein  31.56 
 
 		 386 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1226  major facilitator transporter  40.11 
 
 		 391 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.184807  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2804  major facilitator superfamily MFS_1  36.39 
 
 		 403 aa  156  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0158758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1519  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 404 aa  153  5e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.496216 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3527  major facilitator transporter  32.31 
 
 		 390 aa  149  8e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1617  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 		 396 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000010959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2437  major facilitator superfamily MFS_1  29.15 
 
 		 396 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 		 402 aa  122  9e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0817  major facilitator superfamily MFS_1  30.18 
 
 		 401 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0645  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 382 aa  119  9e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080187  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2632  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 403 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224364  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1166  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3577  hypothetical protein  27.34 
 
 		 421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.972735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2630  fosmidomycin resistance protein  29.36 
 
 		 420 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0518  fosmidomycin resistance protein  28.61 
 
 		 406 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0523  fosmidomycin resistance protein  28.61 
 
 		 406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0571  fosmidomycin resistance protein  28.61 
 
 		 406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.652835  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3131  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 406 aa  113  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0556  fosmidomycin resistance protein  28.61 
 
 		 406 aa  113  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3137  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 406 aa  113  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.546423  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 410 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1116  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.298595 
 
 
-
 
NC_004310  BR0656  fosmidomycin resistance protein  26.27 
 
 		 403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.231636  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4025  major facilitator superfamily fosmidomycin resistant protein  27.95 
 
 		 401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.164373  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2104  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.314279 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0958  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00430  predicted fosmidomycin efflux system  28.61 
 
 		 406 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00435  hypothetical protein  28.61 
 
 		 406 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0541  fosmidomycin resistance protein  28.85 
 
 		 406 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.404971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0649  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0539  fosmidomycin resistance protein  29.34 
 
 		 406 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0556  fosmidomycin resistance protein  29.34 
 
 		 406 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.809506 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0546  fosmidomycin resistance protein  29.34 
 
 		 406 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.268965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0600  fosmidomycin resistance protein  29.34 
 
 		 406 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3329  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 410 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.707628 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3837  major facilitator transporter  29.6 
 
 		 415 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0930  fosmidomycin resistance protein  29.46 
 
 		 416 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1849  fosmidomycin resistance protein  29.46 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1463  fosmidomycin resistance protein  29.46 
 
 		 416 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1672  fosmidomycin resistance protein  29.46 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1694  fosmidomycin resistance protein  29.46 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511968  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0213  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 		 398 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0419  fosmidomycin resistance protein  29.11 
 
 		 416 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.423949  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0744  fosmidomycin resistance protein  29.11 
 
 		 416 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944019  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0720  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 403 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588429 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  30.79 
 
 		 431 aa  106  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1603  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 		 399 aa  106  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0711095  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2366  antibiotic MFS transporter, putative  28.88 
 
 		 420 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2676  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 396 aa  104  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.149282  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1146  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 406 aa  104  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155488  unclonable  0.000000029988 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1690  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1918  fosmidomycin resistance protein  28.46 
 
 		 403 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.243949  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 		 408 aa  102  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3640  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 410 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4717  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 410 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521537 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4107  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 404 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266046  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2084  major facilitator superfamily MFS_1  31.02 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.942608 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1836  fosmidomycin resistance protein  28.72 
 
 		 403 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3507  fosmidomycin resistance protein  28.72 
 
 		 403 aa  101  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4588  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 412 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0367  permease  23.76 
 
 		 412 aa  100  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.32941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5829  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 422 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50804  normal  0.878008 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1874  fosmidomycin resistance protein  28.46 
 
 		 403 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194019 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6092  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 400 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1696  fosmidomycin resistance protein  28.46 
 
 		 403 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00774427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1677  fosmidomycin resistance protein  28.46 
 
 		 403 aa  100  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0817289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1652  fosmidomycin resistance protein  28.46 
 
 		 403 aa  100  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000459515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1830  fosmidomycin resistance protein  28.46 
 
 		 403 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1308  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 420 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120753  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1603  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 		 408 aa  99.8  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0994  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 392 aa  99.8  8e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.198268  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3033  fosmidomycin resistance protein  26.55 
 
 		 404 aa  99.8  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00068897  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4835  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 403 aa  99.4  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1953  fosmidomycin resistance protein  28.46 
 
 		 403 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1260  fosmidomycin resistance protein  26.55 
 
 		 404 aa  99.4  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0237353  hitchhiker  0.0000222003 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0023  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 409 aa  98.2  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1326  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 412 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686197  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1437  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 402 aa  98.6  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1365  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 412 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.399503 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1681  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 402 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0962  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 412 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1444  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 412 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1871  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 413 aa  97.4  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.565485  hitchhiker  0.00660368 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6505  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 		 400 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1422  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 412 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2924  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 		 388 aa  97.1  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.755065  normal  0.842149 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0102  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 		 382 aa  97.1  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.346364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6429  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 403 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1340  major facilitator superfamily multidrug (fosmidomycin) efflux transporter  29.05 
 
 		 420 aa  96.7  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 		 408 aa  96.7  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2963  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 		 380 aa  97.1  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2972  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 422 aa  96.3  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>