211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1617 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1617  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
396 aa  776    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000010959  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1519  major facilitator transporter  45.64 
 
 
404 aa  308  1.0000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.496216 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1226  major facilitator transporter  40.58 
 
 
391 aa  246  4e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.184807  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3527  major facilitator transporter  41.58 
 
 
390 aa  238  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2341  major facilitator superfamily MFS_1  36.83 
 
 
417 aa  230  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1794  Xaa-Pro dipeptidase  36.9 
 
 
389 aa  220  3.9999999999999997e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0213  major facilitator superfamily MFS_1  39.43 
 
 
398 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  32.22 
 
 
402 aa  190  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1437  major facilitator transporter  33.77 
 
 
402 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00430  predicted fosmidomycin efflux system  34.03 
 
 
406 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00435  hypothetical protein  34.03 
 
 
406 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3507  fosmidomycin resistance protein  33.33 
 
 
403 aa  179  8e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1836  fosmidomycin resistance protein  33.51 
 
 
403 aa  179  8e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0518  fosmidomycin resistance protein  34.03 
 
 
406 aa  179  8e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3131  major facilitator superfamily MFS_1  34.03 
 
 
406 aa  178  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0571  fosmidomycin resistance protein  34.03 
 
 
406 aa  178  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.652835  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0523  fosmidomycin resistance protein  34.03 
 
 
406 aa  178  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3137  major facilitator transporter  34.03 
 
 
406 aa  178  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.546423  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0556  fosmidomycin resistance protein  34.03 
 
 
406 aa  178  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1696  fosmidomycin resistance protein  33.33 
 
 
403 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00774427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1677  fosmidomycin resistance protein  33.33 
 
 
403 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0817289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1652  fosmidomycin resistance protein  33.33 
 
 
403 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000459515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1830  fosmidomycin resistance protein  33.33 
 
 
403 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1690  major facilitator transporter  33.07 
 
 
403 aa  176  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1953  fosmidomycin resistance protein  33.07 
 
 
403 aa  176  7e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1918  fosmidomycin resistance protein  32.81 
 
 
403 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.243949  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2924  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 
388 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.755065  normal  0.842149 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1874  fosmidomycin resistance protein  33.07 
 
 
403 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194019 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0367  permease  29.35 
 
 
412 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.32941  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0670  ProP protein  32.83 
 
 
386 aa  173  5e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 
408 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2632  major facilitator transporter  32.9 
 
 
403 aa  169  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224364  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0137  major facilitator superfamily MFS_1  31.36 
 
 
420 aa  166  6.9999999999999995e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0222229  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0817  major facilitator superfamily MFS_1  34.02 
 
 
401 aa  166  8e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  31.32 
 
 
410 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_004310  BR0656  fosmidomycin resistance protein  30.73 
 
 
403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.231636  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0649  major facilitator transporter  32.38 
 
 
403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0720  major facilitator transporter  32.46 
 
 
403 aa  162  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00588429 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0958  major facilitator transporter  32.72 
 
 
406 aa  162  8.000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0546  fosmidomycin resistance protein  32.72 
 
 
406 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.268965  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0600  fosmidomycin resistance protein  32.72 
 
 
406 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184073  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0539  fosmidomycin resistance protein  32.72 
 
 
406 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0541  fosmidomycin resistance protein  32.72 
 
 
406 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.404971  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0556  fosmidomycin resistance protein  32.72 
 
 
406 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.809506 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1116  major facilitator superfamily MFS_1  31.77 
 
 
410 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.298595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3329  major facilitator transporter  31.58 
 
 
410 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.707628 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5829  major facilitator transporter  31.25 
 
 
422 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50804  normal  0.878008 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2458  major facilitator transporter  32.01 
 
 
410 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3837  major facilitator transporter  30.47 
 
 
415 aa  159  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4025  major facilitator superfamily fosmidomycin resistant protein  30.05 
 
 
401 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.164373  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2804  major facilitator superfamily MFS_1  34.84 
 
 
403 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0158758  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1260  fosmidomycin resistance protein  32.41 
 
 
404 aa  157  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0237353  hitchhiker  0.0000222003 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0930  fosmidomycin resistance protein  29.77 
 
 
416 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1849  fosmidomycin resistance protein  29.77 
 
 
417 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2630  fosmidomycin resistance protein  29.71 
 
 
420 aa  157  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1463  fosmidomycin resistance protein  29.77 
 
 
416 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1672  fosmidomycin resistance protein  29.77 
 
 
417 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1694  fosmidomycin resistance protein  29.77 
 
 
417 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511968  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0282  major facilitator superfamily MFS_1  32.33 
 
 
421 aa  157  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  31.58 
 
 
401 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0419  fosmidomycin resistance protein  29.77 
 
 
416 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.423949  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0744  fosmidomycin resistance protein  29.77 
 
 
416 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944019  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3033  fosmidomycin resistance protein  32.41 
 
 
404 aa  157  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00068897  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2852  major facilitator superfamily MFS_1  32.72 
 
 
371 aa  156  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0477779  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1146  major facilitator transporter  33.16 
 
 
406 aa  156  7e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155488  unclonable  0.000000029988 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1478  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 
402 aa  156  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1422  major facilitator transporter  33.16 
 
 
412 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0962  major facilitator transporter  33.16 
 
 
412 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1444  major facilitator transporter  33.16 
 
 
412 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1166  major facilitator transporter  30.38 
 
 
421 aa  152  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4588  major facilitator transporter  33.16 
 
 
412 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1977  fosmidomycin resistance protein, putative  31.5 
 
 
403 aa  151  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85297  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1326  major facilitator transporter  32.63 
 
 
412 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686197  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1645  major facilitator superfamily MFS_1  31.5 
 
 
403 aa  151  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.849012  hitchhiker  0.000565509 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1365  major facilitator transporter  32.63 
 
 
412 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.399503 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1871  major facilitator transporter  32.89 
 
 
413 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.565485  hitchhiker  0.00660368 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0023  major facilitator transporter  32.47 
 
 
409 aa  150  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4107  major facilitator transporter  31.02 
 
 
404 aa  150  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266046  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4112  major facilitator transporter  32.11 
 
 
397 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0806371  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2366  antibiotic MFS transporter, putative  31.23 
 
 
420 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4483  major facilitator transporter  32.39 
 
 
403 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.706987 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3577  hypothetical protein  28.87 
 
 
421 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.972735  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2676  major facilitator transporter  29.89 
 
 
396 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.149282  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4717  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 
410 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521537 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3640  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 
410 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1587  major facilitator transporter  30.77 
 
 
412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3799  fosmidomycin resistance protein  33.06 
 
 
402 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.319996  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  32.2 
 
 
431 aa  147  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0412  putative fosmidomycin resistance antibiotic resistance transmembrane protein  32.64 
 
 
411 aa  146  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  normal  0.519743 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1681  major facilitator transporter  33.33 
 
 
402 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1603  major facilitator superfamily MFS_1  31.46 
 
 
399 aa  146  7.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0711095  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 
408 aa  145  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4757  major facilitator transporter  32.72 
 
 
405 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54337  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0645  major facilitator transporter  31.7 
 
 
382 aa  144  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080187  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0734  major facilitator transporter  32.04 
 
 
404 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1340  major facilitator superfamily multidrug (fosmidomycin) efflux transporter  30.53 
 
 
420 aa  143  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0701  MFS efflux transporter, putative  31.76 
 
 
404 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0735  major facilitator transporter  32.61 
 
 
404 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0474  major facilitator transporter  33.33 
 
 
398 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812694  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3431  major facilitator superfamily MFS_1  35.07 
 
 
404 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00698685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>