198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2362 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2362  major facilitator transporter  100 
 
 		 392 aa  722    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.951882  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0994  major facilitator transporter  57.1 
 
 		 392 aa  364  1e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.198268  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2437  major facilitator superfamily MFS_1  32.98 
 
 		 396 aa  136  8e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4326  major facilitator superfamily MFS_1  31.5 
 
 		 393 aa  135  9e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0817  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 		 401 aa  134  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0645  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080187  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2924  major facilitator superfamily MFS_1  33.57 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.755065  normal  0.842149 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0724  XRE family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0248517  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1478  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 		 402 aa  109  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1794  Xaa-Pro dipeptidase  28.25 
 
 		 389 aa  109  7.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0216  hypothetical protein  30.73 
 
 		 393 aa  107  4e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1519  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.496216 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2341  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0102  major facilitator superfamily MFS_1  31.43 
 
 		 382 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.346364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2819  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 		 389 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1844  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 389 aa  95.1  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0720  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 403 aa  95.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588429 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2963  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 		 380 aa  93.6  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1617  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 		 396 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000010959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3527  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 390 aa  91.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1226  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 391 aa  90.9  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.184807  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4112  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 397 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0806371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2458  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 410 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1115  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 415 aa  88.6  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 410 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 		 402 aa  87.4  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0656  fosmidomycin resistance protein  25.07 
 
 		 403 aa  86.3  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.231636  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2084  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 		 395 aa  86.3  9e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.942608 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6429  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 403 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2972  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 422 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5829  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 422 aa  81.3  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50804  normal  0.878008 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1610  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2676  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.149282  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2632  major facilitator transporter  24.28 
 
 		 403 aa  79.3  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224364  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1603  major facilitator superfamily MFS_1  28.44 
 
 		 399 aa  79.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0711095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3329  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 410 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.707628 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4797  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 		 421 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.292232  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0649  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1437  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2630  fosmidomycin resistance protein  27.79 
 
 		 420 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 		 408 aa  77.8  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3507  fosmidomycin resistance protein  24.15 
 
 		 403 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1696  fosmidomycin resistance protein  24.93 
 
 		 403 aa  77  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00774427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1677  fosmidomycin resistance protein  24.93 
 
 		 403 aa  77  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0817289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1652  fosmidomycin resistance protein  24.93 
 
 		 403 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000459515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1830  fosmidomycin resistance protein  24.93 
 
 		 403 aa  77  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2852  major facilitator superfamily MFS_1  30.16 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0477779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1918  fosmidomycin resistance protein  25.2 
 
 		 403 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.243949  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3837  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3577  hypothetical protein  26.46 
 
 		 421 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.972735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1953  fosmidomycin resistance protein  24.93 
 
 		 403 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3913  major facilitator transporter  25.08 
 
 		 421 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1320  major facilitator superfamily MFS_1  30.2 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296335  hitchhiker  0.000000456317 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1874  fosmidomycin resistance protein  25 
 
 		 403 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194019 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6092  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1836  fosmidomycin resistance protein  24.41 
 
 		 403 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1690  major facilitator transporter  24.04 
 
 		 403 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6505  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127279  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3799  fosmidomycin resistance protein  25.24 
 
 		 402 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.319996  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2366  antibiotic MFS transporter, putative  27.97 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4025  major facilitator superfamily fosmidomycin resistant protein  26.25 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.164373  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1308  major facilitator transporter  23.74 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120753  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2594  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 395 aa  73.2  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0930  fosmidomycin resistance protein  28.46 
 
 		 416 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1849  fosmidomycin resistance protein  28.46 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1645  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 403 aa  72.8  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.849012  hitchhiker  0.000565509 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1463  fosmidomycin resistance protein  28.46 
 
 		 416 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3640  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1672  fosmidomycin resistance protein  28.46 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1694  fosmidomycin resistance protein  28.46 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511968  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4717  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521537 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1977  fosmidomycin resistance protein, putative  28.46 
 
 		 403 aa  72.8  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85297  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3923  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 418 aa  72.4  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3431  major facilitator superfamily MFS_1  29.75 
 
 		 404 aa  72.4  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00698685  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1681  major facilitator transporter  24.92 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1166  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 421 aa  72  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0419  fosmidomycin resistance protein  27.32 
 
 		 416 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.423949  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0744  fosmidomycin resistance protein  27.32 
 
 		 416 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944019  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0412  putative fosmidomycin resistance antibiotic resistance transmembrane protein  30.9 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  normal  0.519743 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2794  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572754  normal  0.513078 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0474  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0282  major facilitator superfamily MFS_1  31.47 
 
 		 421 aa  70.1  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0137  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0222229  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1340  major facilitator superfamily multidrug (fosmidomycin) efflux transporter  28.22 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  29.03 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1116  major facilitator superfamily MFS_1  24.36 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.298595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4757  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54337  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2104  major facilitator transporter  31.35 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.314279 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0213  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 		 398 aa  67.8  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4483  major facilitator transporter  26.69 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.706987 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1355  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2336  major facilitator transporter  31.89 
 
 		 368 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2162  major facilitator superfamily MFS_1  31.6 
 
 		 411 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1871  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 413 aa  67  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.565485  hitchhiker  0.00660368 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4588  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4107  major facilitator transporter  21.79 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266046  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1146  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155488  unclonable  0.000000029988 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1587  major facilitator transporter  26.99 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>