More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1181 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1181  MFS family transporter  100 
 
 		 393 aa  764    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13070  MFS family transporter  98.21 
 
 		 393 aa  753    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6287  major facilitator superfamily permease  45.86 
 
 		 397 aa  282  6.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0751  major facilitator superfamily MFS_1  42.78 
 
 		 398 aa  251  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207207  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3645  major facilitator transporter  39.8 
 
 		 398 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.212684 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2766  major facilitator transporter  23.19 
 
 		 429 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3928  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 420 aa  92  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2522  major facilitator superfamily MFS_1  24.01 
 
 		 440 aa  89  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.636456  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2568  major facilitator superfamily MFS_1  26.19 
 
 		 427 aa  84  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0290  major facilitator superfamily MFS_1  26.08 
 
 		 420 aa  77.8  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.338306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3306  major facilitator superfamily MFS_1  28.71 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3531  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0566  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0358  major facilitator superfamily MFS_1  30.54 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  23.58 
 
 		 418 aa  63.9  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0005  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0005  major facilitator superfamily MFS_1  31.84 
 
 		 396 aa  62.4  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 434 aa  59.7  0.00000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.76 
 
 		 524 aa  59.7  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  27.83 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1908  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.08 
 
 		 509 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.46 
 
 		 478 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  31.06 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3301  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.88 
 
 		 512 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.970656 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.1 
 
 		 508 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0456997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3392  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.08 
 
 		 512 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.661215 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1292  major facilitator transporter  24.77 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0269507 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4127  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.08 
 
 		 512 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.648562  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0658  major facilitator superfamily drug efflux transporter  28.37 
 
 		 534 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  25.09 
 
 		 443 aa  56.6  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.72 
 
 		 493 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.25 
 
 		 511 aa  55.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708866 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 452 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 426 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000089  hexose phosphate uptake regulatory protein UhpC  30.14 
 
 		 446 aa  54.7  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1329  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 		 394 aa  53.9  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3415  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 390 aa  53.9  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.800917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0134  regulatory protein UhpC  26.95 
 
 		 443 aa  53.9  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0168  major facilitator transporter  29.94 
 
 		 426 aa  53.1  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2598  major facilitator superfamily MFS_1  23.01 
 
 		 420 aa  52.8  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1705  major facilitator superfamily MFS_1  32.88 
 
 		 733 aa  52.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2484  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 		 437 aa  52.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3247  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.03 
 
 		 511 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 483 aa  52.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3829  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 429 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 452 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.35 
 
 		 520 aa  52  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4063  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5920  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 435 aa  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0977977  normal  0.252353 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  25.34 
 
 		 451 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1527  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 426 aa  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0610688  normal  0.832565 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 462 aa  51.2  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2277  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 431 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5028  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 426 aa  51.2  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.212016 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  34.78 
 
 		 416 aa  50.8  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1284  major facilitator superfamily transporter  37.39 
 
 		 444 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537207  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 		 392 aa  50.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 437 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 430 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47900  putative MFS transporter  35.1 
 
 		 480 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00274323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2256  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.58 
 
 		 507 aa  50.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0484017  normal  0.408162 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 		 497 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46740  Major facilitator superfamily protein  27.46 
 
 		 440 aa  49.7  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0528  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.68 
 
 		 469 aa  49.7  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.402464  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 452 aa  49.7  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0831  GlpT/PgpT/UhpT family protein  27.98 
 
 		 456 aa  49.3  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.571145  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1059  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.65 
 
 		 513 aa  49.7  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186181  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0757  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 426 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237029  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1355  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 		 390 aa  49.7  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2238  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  30.92 
 
 		 507 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382837  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 		 510 aa  49.3  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.44 
 
 		 514 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 		 427 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6347  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 426 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1745  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 426 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734469 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1653  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 426 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297588  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1732  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 426 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 		 427 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.44 
 
 		 516 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.65 
 
 		 512 aa  49.7  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 447 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1452  hypothetical protein  28.26 
 
 		 604 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0691  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 426 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0861874  normal  0.321761 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 392 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  27.89 
 
 		 436 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 449 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0515  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.13 
 
 		 520 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4483  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 403 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.706987 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0834  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 433 aa  48.5  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.789702 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2215  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 		 432 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1794  Xaa-Pro dipeptidase  23.93 
 
 		 389 aa  48.9  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3025  major facilitator transporter  25.08 
 
 		 422 aa  48.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0114  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.45 
 
 		 463 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.512098  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0913  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.92 
 
 		 507 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7638  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.3 
 
 		 501 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  23.89 
 
 		 449 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>