More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4906 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4906  major facilitator transporter  100 
 
 		 422 aa  844    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2739  major facilitator transporter  43.41 
 
 		 459 aa  361  1e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3936  major facilitator transporter  41.76 
 
 		 446 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257794  normal  0.0126559 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4202  major facilitator family transporter  42.66 
 
 		 446 aa  312  9e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.730831  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2503  major facilitator transporter  38.48 
 
 		 446 aa  289  7e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.793406  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2406  major facilitator transporter  38.48 
 
 		 446 aa  289  7e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0106642  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1693  major facilitator transporter  38.48 
 
 		 446 aa  289  7e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0151709  normal  0.216508 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2091  major facilitator transporter  39.29 
 
 		 481 aa  279  5e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0452274 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2261  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 438 aa  136  9e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 428 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0496  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 441 aa  104  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64750  putative MFS transporter  26.49 
 
 		 446 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5623  MFS family transporter  25.59 
 
 		 446 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2126  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 		 444 aa  100  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647931  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  25.72 
 
 		 411 aa  99.4  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0412  putative benzoate transport protein  23.02 
 
 		 433 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0464  benzoate transport protein, putative  23.02 
 
 		 433 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0460  putative benzoate transport protein  23.02 
 
 		 433 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 427 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2477  major facilitator superfamily MFS_1  27.02 
 
 		 416 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 435 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3587  major facilitator transporter  24 
 
 		 445 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 451 aa  97.1  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2187  major facilitator superfamily MFS_1  27.02 
 
 		 416 aa  96.7  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0329536  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4906  putative benzoate transport protein  23.1 
 
 		 433 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1295  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 424 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0174718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0398  putative benzoate transport protein  23.1 
 
 		 433 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0364  benzoate transport protein  22.85 
 
 		 433 aa  94.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0349  benzoate transport protein  22.85 
 
 		 436 aa  94.4  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 409 aa  94  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3769  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 433 aa  94  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4022  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 424 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0335  sugar transporter; benzoate transport protein  22.85 
 
 		 436 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0344  major facilitator transporter  22.85 
 
 		 433 aa  93.6  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  26.54 
 
 		 429 aa  93.6  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1698  major facilitator family transporter  25.84 
 
 		 424 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  normal  0.154444 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  25.46 
 
 		 409 aa  93.6  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 434 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  24.44 
 
 		 399 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 		 398 aa  92  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 415 aa  92  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 415 aa  92  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 		 404 aa  90.9  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  24.1 
 
 		 399 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 415 aa  90.5  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  23.82 
 
 		 399 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  23.78 
 
 		 399 aa  90.1  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 		 436 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 415 aa  90.1  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 432 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 434 aa  89.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2798  general substrate transporter  26.91 
 
 		 429 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 432 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 432 aa  88.6  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2316  major facilitator superfamily MFS_1  22.15 
 
 		 446 aa  88.2  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 432 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 420 aa  88.2  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1823  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 442 aa  87.8  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112408  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 423 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0451  major facilitator superfamily transporter  25.56 
 
 		 417 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.82484e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0409  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 417 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000062799 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0340  major facilitator transporter  23.01 
 
 		 436 aa  87.8  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0388  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 417 aa  87.8  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000620465 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0391  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 417 aa  87.8  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21713  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0396  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 417 aa  87.8  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.786385  decreased coverage  4.1004499999999995e-20 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1274  major facilitator family transporter  25.07 
 
 		 406 aa  87.4  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116564  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0134  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  25.07 
 
 		 408 aa  87  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1959  major facilitator family transporter  25.07 
 
 		 408 aa  87  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1761  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  25.07 
 
 		 408 aa  87  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1806  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  25.07 
 
 		 408 aa  87  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  24.94 
 
 		 455 aa  87  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  24.31 
 
 		 447 aa  87  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1032  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  25.07 
 
 		 408 aa  87  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  25.64 
 
 		 450 aa  87  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1785  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  25.07 
 
 		 408 aa  87  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.669865  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  22.87 
 
 		 399 aa  87  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 420 aa  87  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 420 aa  86.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3774  major facilitator transporter  24.39 
 
 		 428 aa  86.7  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 420 aa  86.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 420 aa  86.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  23.27 
 
 		 399 aa  86.3  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  23.27 
 
 		 399 aa  86.3  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  23.27 
 
 		 399 aa  86.3  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  23.27 
 
 		 399 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 409 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  25.31 
 
 		 480 aa  86.3  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  26.08 
 
 		 474 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  23.06 
 
 		 399 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4356  major facilitator transporter  24.33 
 
 		 447 aa  85.5  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  22.68 
 
 		 451 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  23.32 
 
 		 399 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  26.08 
 
 		 474 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 473 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  26.08 
 
 		 474 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1418  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 406 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1254  major facilitator superfamily MFS_1  23.76 
 
 		 444 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.01739 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 428 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3932  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 		 415 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.643989 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4045  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 		 415 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>