15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7075 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7075  major facilitator family transporter  100 
 
 		 370 aa  717    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.240881  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3382  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 398 aa  98.2  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03949  osmolarity sensor protein  26.86 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  23.48 
 
 		 395 aa  57  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0680  major facilitator superfamily MFS_1  23.63 
 
 		 384 aa  56.2  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.668541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2967  major facilitator transporter  24.58 
 
 		 392 aa  53.1  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2340  major facilitator superfamily MFS_1  22.57 
 
 		 417 aa  50.8  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2341  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  23.48 
 
 		 395 aa  47.8  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2115  major facilitator transporter  21.61 
 
 		 386 aa  46.2  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1953  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 411 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1662  major facilitator superfamily MFS_1  21.98 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 457 aa  43.5  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  28.74 
 
 		 391 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>