More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1780 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1780  major facilitator transporter  100 
 
 		 379 aa  730    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2162  major facilitator transporter  57.52 
 
 		 370 aa  426  1e-118  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000505649 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2076  major facilitator superfamily MFS_1  46.58 
 
 		 378 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.284167  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 		 430 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  24.02 
 
 		 432 aa  69.3  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  24.48 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  24.48 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  27.01 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 445 aa  63.5  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  23.15 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  23.15 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  23.15 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  23.15 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2623  hypothetical protein  28.87 
 
 		 455 aa  60.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2474  hypothetical protein  29.71 
 
 		 455 aa  60.8  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  28.33 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2092  membrane transport protein  28.33 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3710  major facilitator superfamily MFS_1  23.32 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.010262 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0231  major facilitator transporter  24.06 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  27.78 
 
 		 458 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  23.02 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1644  major facilitator family transporter  27.78 
 
 		 446 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0691  major facilitator family transporter  27.78 
 
 		 458 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.358679  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0579  major facilitator family transporter  27.78 
 
 		 446 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.801725  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  22.56 
 
 		 428 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0769  putative sugar transporter  27.78 
 
 		 441 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  23.02 
 
 		 427 aa  59.7  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5135  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  21.81 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4602  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0544774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3474  major facilitator superfamily MFS_1  22.13 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00256717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  26.24 
 
 		 456 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  22.92 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2852  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 438 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1401  major facilitator superfamily MFS_1  23.33 
 
 		 434 aa  56.2  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270057  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0831  GlpT/PgpT/UhpT family protein  30.86 
 
 		 456 aa  55.5  0.000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.571145  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  23.04 
 
 		 460 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1355  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 390 aa  54.7  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2837  major facilitator family transporter  22.69 
 
 		 436 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00238614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 417 aa  54.7  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0134  regulatory protein UhpC  27.43 
 
 		 443 aa  54.7  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2715  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  24.92 
 
 		 429 aa  54.3  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.618209 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3797  major facilitator superfamily MFS_1  21.62 
 
 		 444 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.653013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3731  major facilitator superfamily MFS_1  21.62 
 
 		 444 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3900  major facilitator superfamily MFS_1  21.62 
 
 		 444 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.416802  normal  0.649925 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 		 390 aa  54.3  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2054  major facilitator superfamily MFS_1  26.19 
 
 		 445 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00125626 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  22.11 
 
 		 460 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2068  major facilitator transporter  22.8 
 
 		 432 aa  53.9  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2945  major facilitator transporter  23.4 
 
 		 436 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11349  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02062  putative transporter transmembrane protein  22.52 
 
 		 441 aa  53.5  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000104941  normal  0.781434 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 428 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5945  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 		 363 aa  53.5  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3239  major facilitator transporter  22.94 
 
 		 441 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.935103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3839  major facilitator superfamily transporter  22.38 
 
 		 443 aa  53.1  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.993033  normal  0.150303 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  21.67 
 
 		 443 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0859  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 366 aa  53.1  0.000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 440 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 440 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 464 aa  52.8  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3902  major facilitator superfamily MFS_1  23.15 
 
 		 386 aa  52.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.088151  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4313  major facilitator transporter  23.39 
 
 		 431 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 		 390 aa  52.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2392  major facilitator superfamily MFS_1  22.28 
 
 		 416 aa  52.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  26.64 
 
 		 413 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0993  2-ketogluconate/H(+) major facilitator transporter  27.22 
 
 		 440 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051326  normal  0.375991 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 418 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 		 453 aa  51.6  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  22.91 
 
 		 446 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  22.71 
 
 		 426 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2438  hypothetical protein  26.92 
 
 		 410 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0477  major facilitator transporter  25.5 
 
 		 441 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2645  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 466 aa  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8658  major facilitator superfamily MFS_1  21.13 
 
 		 434 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  22.61 
 
 		 451 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0582  major facilitator superfamily MFS_1  24.84 
 
 		 432 aa  51.6  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 480 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  23.44 
 
 		 442 aa  51.2  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2584  hypothetical protein  26.92 
 
 		 410 aa  51.2  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  23.94 
 
 		 426 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  26.9 
 
 		 443 aa  50.8  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  25.4 
 
 		 504 aa  51.6  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  24.7 
 
 		 432 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  23.47 
 
 		 426 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  26.9 
 
 		 443 aa  50.8  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  22.6 
 
 		 446 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  23.47 
 
 		 426 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  20.26 
 
 		 450 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1500  major facilitator superfamily protein  25.12 
 
 		 513 aa  50.8  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.096158  normal  0.892962 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  23.44 
 
 		 460 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3121  major facilitator transporter  22.02 
 
 		 441 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  24.28 
 
 		 430 aa  50.4  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  21.18 
 
 		 445 aa  50.4  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  26.58 
 
 		 436 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4381  major facilitator transporter  23.6 
 
 		 428 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0579635 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2604  major facilitator family transporter  22.17 
 
 		 480 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  25.95 
 
 		 478 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2498  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 435 aa  50.1  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.761213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3962  major facilitator transporter  21.82 
 
 		 420 aa  50.1  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>