295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2076 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2076  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 378 aa  717    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.284167  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2162  major facilitator transporter  48.9 
 
 		 370 aa  330  2e-89  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000505649 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1780  major facilitator transporter  46.68 
 
 		 379 aa  317  2e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  31.36 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  32.47 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0529  transporter, MFS superfamily  29.84 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.027512  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1663  major facilitator family transporter  29.84 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.106817  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2763  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.640372  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2475  d-galactonate transporter  23.61 
 
 		 438 aa  63.5  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.812559  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1355  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0972  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 387 aa  62.4  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.408087 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2587  major facilitator transporter  23.92 
 
 		 425 aa  60.5  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2535  major facilitator transporter  23.92 
 
 		 425 aa  60.5  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4084  probable glucarate transporter  23.2 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.463281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  25.77 
 
 		 449 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3978  putative glucarate transporter  23.2 
 
 		 436 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.776069 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3916  probable glucarate transporter  23.2 
 
 		 436 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4023  glucarate transporter  23.2 
 
 		 436 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.957782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0299  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 432 aa  58.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  27.74 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3283  glucarate permease  22.7 
 
 		 452 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129198  normal  0.747059 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  24.6 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  22.91 
 
 		 451 aa  57.4  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3731  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 		 444 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 453 aa  57  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3797  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 		 444 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.653013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3900  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 		 444 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.416802  normal  0.649925 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4381  major facilitator transporter  22.37 
 
 		 428 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0579635 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3569  d-galactonate transporter  21.38 
 
 		 444 aa  56.6  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.576776 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3184  glucarate permease  22.7 
 
 		 452 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.513823 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3121  glucarate permease  22.7 
 
 		 452 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  23.24 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3168  glucarate permease  22.7 
 
 		 452 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.101605 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3103  glucarate permease  22.7 
 
 		 452 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2498  major facilitator transporter  22.37 
 
 		 435 aa  56.2  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.761213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1401  major facilitator superfamily MFS_1  25.15 
 
 		 434 aa  56.2  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270057  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  21.87 
 
 		 444 aa  56.2  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  21.87 
 
 		 444 aa  56.2  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  21.87 
 
 		 444 aa  56.2  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  21.87 
 
 		 444 aa  56.2  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  21.87 
 
 		 444 aa  56.2  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  21.87 
 
 		 444 aa  56.2  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  25 
 
 		 445 aa  56.2  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  21.87 
 
 		 444 aa  56.2  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0899  d-galactonate transporter  22.43 
 
 		 450 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3422  galactarate permease GarP  21.62 
 
 		 444 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3839  major facilitator superfamily transporter  25.88 
 
 		 443 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.993033  normal  0.150303 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02634  predicted D-glucarate transporter  22.43 
 
 		 450 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02596  hypothetical protein  22.43 
 
 		 450 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3093  glucarate permease  22.43 
 
 		 450 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.110237  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0923  d-galactonate transporter  22.43 
 
 		 450 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3084  glucarate permease  22.43 
 
 		 440 aa  55.1  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567935  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2933  glucarate permease  22.43 
 
 		 450 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2927  glucarate permease  22.43 
 
 		 450 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2022  major facilitator superfamily MFS_1  24.84 
 
 		 414 aa  54.7  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  22.97 
 
 		 434 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1252  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 424 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.117112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2215  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 		 432 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3557  d-galactonate transporter  21.83 
 
 		 450 aa  53.9  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4050  glucarate permease  22.43 
 
 		 450 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 462 aa  53.5  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4960  major facilitator transporter  23.38 
 
 		 446 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.554381 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  22.59 
 
 		 440 aa  53.5  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0624  regulatory protein UhpC  26.44 
 
 		 436 aa  53.1  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  25.64 
 
 		 428 aa  53.1  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  25.64 
 
 		 428 aa  53.1  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  22.97 
 
 		 434 aa  53.1  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  25.64 
 
 		 428 aa  53.1  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  22.17 
 
 		 445 aa  52.8  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  25.64 
 
 		 428 aa  53.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4176  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 425 aa  52.8  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  26.01 
 
 		 428 aa  53.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4440  major facilitator transporter  23.38 
 
 		 446 aa  52.8  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.827136  hitchhiker  0.000980879 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  24.26 
 
 		 442 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5253  major facilitator transporter  23.04 
 
 		 446 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.841213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 432 aa  52.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0859  major facilitator transporter  24.72 
 
 		 366 aa  52.8  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4602  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 430 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0544774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5135  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 430 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3397  d-galactonate transporter  21.04 
 
 		 450 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1929  major facilitator transporter  21.92 
 
 		 399 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0368409  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  24.74 
 
 		 446 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2429  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 		 405 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00087995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 446 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0189  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 440 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 440 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5031  major facilitator transporter  23.04 
 
 		 446 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.599712  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  20.51 
 
 		 434 aa  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4376  major facilitator transporter  21.85 
 
 		 430 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5057  major facilitator transporter  21.85 
 
 		 430 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5803  major facilitator transporter  21.85 
 
 		 430 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6030  major facilitator transporter  22.27 
 
 		 443 aa  50.8  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.386461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0029  regulatory protein UhpC  22.8 
 
 		 442 aa  50.8  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 450 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  24.7 
 
 		 458 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2092  membrane transport protein  23.6 
 
 		 446 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>