63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0859 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0859  major facilitator transporter  100 
 
 		 366 aa  702    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2763  major facilitator superfamily MFS_1  44.38 
 
 		 374 aa  273  5.000000000000001e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.640372  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0972  major facilitator transporter  44.67 
 
 		 387 aa  264  2e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.408087 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2162  major facilitator transporter  23.89 
 
 		 370 aa  55.8  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000505649 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1548  major facilitator superfamily MFS_1  23.72 
 
 		 380 aa  53.1  0.000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3694  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 433 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1780  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 379 aa  52.4  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3935  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 431 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3891  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 		 433 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36120  putative MFS transporter  29.59 
 
 		 441 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263423 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  26.06 
 
 		 453 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 		 453 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  26.06 
 
 		 453 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  26.06 
 
 		 453 aa  49.7  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3525  major facilitator transporter  23.28 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.653507  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 453 aa  47  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 453 aa  47  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  25.35 
 
 		 453 aa  47  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 		 449 aa  47  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3079  MFS family transporter  29.71 
 
 		 441 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0239377  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 453 aa  47  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  33.64 
 
 		 479 aa  46.6  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2076  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 		 378 aa  46.6  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.284167  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4063  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 452 aa  46.2  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 		 449 aa  46.2  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 433 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  29.45 
 
 		 435 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4009  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 436 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.636189  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  23.36 
 
 		 451 aa  45.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  23.28 
 
 		 433 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6214  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 		 433 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  22.64 
 
 		 455 aa  45.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  33.96 
 
 		 463 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503182 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  21.83 
 
 		 429 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2498  major facilitator transporter  25.92 
 
 		 435 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.761213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 433 aa  44.3  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 		 442 aa  44.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  22.49 
 
 		 433 aa  44.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3209  major facilitator transporter  23.91 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  33.96 
 
 		 464 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5069  major facilitator transporter  23.91 
 
 		 430 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04960  conserved hypothetical protein  25.66 
 
 		 533 aa  44.3  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.695545  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1490  putative tetracycline resistance protein  25.74 
 
 		 462 aa  43.9  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000919322  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  23.17 
 
 		 436 aa  44.3  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  23.24 
 
 		 429 aa  44.3  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  24.11 
 
 		 452 aa  43.9  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  22.65 
 
 		 428 aa  43.9  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  31.73 
 
 		 461 aa  43.9  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6079  major facilitator transporter  30.7 
 
 		 413 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3395  major facilitator transporter  33.96 
 
 		 463 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6376  major facilitator transporter  30.7 
 
 		 428 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213646  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4772  major facilitator transporter  33.96 
 
 		 463 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  31.73 
 
 		 469 aa  43.5  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6265  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 480 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1565  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 480 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523471  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4949  major facilitator transporter  30.7 
 
 		 428 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3211  major facilitator transporter  30.7 
 
 		 428 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1401  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 		 434 aa  43.1  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270057  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 431 aa  43.1  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5920  major facilitator transporter  23.03 
 
 		 435 aa  42.7  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0977977  normal  0.252353 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3888  major facilitator superfamily transporter  28.89 
 
 		 433 aa  42.7  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4381  major facilitator transporter  24.02 
 
 		 428 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0579635 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0299  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 		 442 aa  42.7  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>