38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0543 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0543  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 383 aa  754    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2283  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 402 aa  161  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.446787  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2755  major facilitator superfamily MFS_1  23.27 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4699  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.54 
 
 		 599 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0062  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 482 aa  49.7  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000690762 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4464  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.88 
 
 		 599 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.737474  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0561  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.88 
 
 		 599 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000151463  hitchhiker  0.00000000000000678179 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4812  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.88 
 
 		 599 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.127812  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0060  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 482 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000451117 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4299  multidrug resistance protein B  24.88 
 
 		 599 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.649426  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4310  multidrug resistance protein B  24.88 
 
 		 599 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4683  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.88 
 
 		 599 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.74665e-44 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4676  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.88 
 
 		 599 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00195609  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4692  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.88 
 
 		 599 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000143582  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0064  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 482 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000292111 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1537  major facilitator transporter  22.17 
 
 		 385 aa  48.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4295  major facilitator transporter  26.06 
 
 		 487 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0064  major facilitator transporter  26.06 
 
 		 487 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31678  hitchhiker  0.00316152 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0059  major facilitator transporter  26.06 
 
 		 487 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0063  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 		 487 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  23.65 
 
 		 388 aa  47.4  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10750  major facilitator superfamily MFS_1  22.7 
 
 		 378 aa  47  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000151203  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.82 
 
 		 579 aa  47  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4399  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.13 
 
 		 597 aa  46.6  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00696651  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0678  major facilitator superfamily MFS_1  20.9 
 
 		 394 aa  46.2  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0414  major facilitator transporter  25.16 
 
 		 473 aa  46.2  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.444257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0091  hypothetical protein  22.82 
 
 		 277 aa  45.1  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2359  multidrug efflux system protein MdtE  23.46 
 
 		 470 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4463  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 449 aa  44.3  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.756392  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2366  multidrug efflux system protein MdtE  23.9 
 
 		 470 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.505181 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0526  major facilitator transporter  21.53 
 
 		 384 aa  43.9  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4826  EmrB/QacA subfamily transporter  20.21 
 
 		 484 aa  43.9  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325422  normal  0.202323 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3040  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  21.43 
 
 		 469 aa  43.5  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.071182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2676  major facilitator transporter  20.79 
 
 		 387 aa  43.5  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2475  multidrug efflux system protein MdtE  23.9 
 
 		 470 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.829897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3357  major facilitator superfamily MFS_1  21.6 
 
 		 396 aa  43.1  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2259  multidrug efflux system protein MdtE  23.9 
 
 		 470 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.716187  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2315  multidrug efflux system protein MdtE  23.9 
 
 		 470 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>