96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2646 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_2646  galactoside permease  100 
 
 		 415 aa  835    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0124  galactoside permease  39.02 
 
 		 445 aa  325  9e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000688669  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2083  galactoside permease  40.42 
 
 		 419 aa  283  6.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51800  galactoside permease  39.73 
 
 		 427 aa  264  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0632  galactoside permease  36.39 
 
 		 420 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0846  galactoside permease  36.13 
 
 		 420 aa  251  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2636  oligosaccharide/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  33.25 
 
 		 410 aa  248  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0232716  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3381  galactoside permease  33.69 
 
 		 430 aa  243  6e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3115  galactoside permease  33.42 
 
 		 425 aa  242  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0255021 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4076  galactoside permease  34.4 
 
 		 421 aa  233  6e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.427809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3434  major facilitator superfamily oligosaccharide/H+ symporter  32.5 
 
 		 422 aa  232  9e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2657  galactoside permease  34.49 
 
 		 426 aa  231  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1330  galactoside permease  34.04 
 
 		 426 aa  225  9e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.800996  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2492  galactoside permease  32.89 
 
 		 435 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1680  galactoside permease  32.89 
 
 		 435 aa  218  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000567267  normal  0.141313 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2394  galactoside permease  32.63 
 
 		 435 aa  216  8e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000789855  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1767  galactoside permease  31.93 
 
 		 418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0531388  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51430  Proton/sugar symporter  32.3 
 
 		 437 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1361  galactoside permease  32.19 
 
 		 420 aa  212  7.999999999999999e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.32292  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3102  major facilitator superfamily oligosaccharide/H+ symporter  33.76 
 
 		 418 aa  211  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.186561 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00297  galactoside permease  31.13 
 
 		 417 aa  209  7e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0372048  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3282  galactoside permease  31.13 
 
 		 417 aa  209  7e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00177774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0367  galactoside permease  31.13 
 
 		 417 aa  209  7e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00932691  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3263  oligosaccharide/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  31.13 
 
 		 417 aa  209  7e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0568399  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0374  galactoside permease  31.13 
 
 		 417 aa  209  7e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0407  galactoside permease  31.13 
 
 		 417 aa  209  9e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00583816  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0416  galactoside permease  31.13 
 
 		 417 aa  209  9e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.64566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28670  galactoside permease  29.3 
 
 		 448 aa  187  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1139  major facilitator transporter  22.92 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000165449  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  22.64 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2755  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 		 392 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  23.69 
 
 		 391 aa  54.7  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2709  putative 3-phenylpropionic acid transporter  23.22 
 
 		 379 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2795  putative 3-phenylpropionic acid transporter  23.22 
 
 		 379 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2754  putative 3-phenylpropionic acid transporter  23.22 
 
 		 379 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2929  putative 3-phenylpropionic acid transporter  22.95 
 
 		 379 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2816  putative 3-phenylpropionic acid transporter  22.95 
 
 		 379 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2910  putative 3-phenylpropionic acid transporter  21.27 
 
 		 379 aa  51.6  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0356658  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3634  putative 3-phenylpropionic acid transporter  22.27 
 
 		 383 aa  50.8  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1232  putative 3-phenylpropionic acid transporter  21.43 
 
 		 386 aa  50.4  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1162  putative 3-phenylpropionic acid transporter  22.46 
 
 		 385 aa  49.7  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.92917e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1269  putative 3-phenylpropionic acid transporter  22.46 
 
 		 385 aa  49.7  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000298411  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4111  major facilitator transporter  27.33 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2688  nucleoside:H+ symporter  23.73 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3457  nucleoside permease NupG  23.96 
 
 		 418 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.693342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3288  nucleoside permease NupG  23.64 
 
 		 418 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.407193  normal  0.0115018 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3362  nucleoside permease NupG  23.64 
 
 		 418 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.315721  normal  0.195044 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3354  nucleoside permease NupG  23.64 
 
 		 418 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.650502  normal  0.93107 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5646  major facilitator transporter  20.82 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0381  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 		 407 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000107075  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0442  putative 3-phenylpropionic acid transporter  22.1 
 
 		 385 aa  48.5  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000923694  hitchhiker  0.00000109334 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3277  nucleoside permease NupG  23.64 
 
 		 418 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2503  major facilitator transporter  22.07 
 
 		 397 aa  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527244 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3767  putative 3-phenylpropionic acid transporter  21.18 
 
 		 379 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2953  major facilitator transporter  22.95 
 
 		 417 aa  47  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  26.97 
 
 		 404 aa  47  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2090  transporter, putative  22.74 
 
 		 380 aa  47  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3311  nucleoside transporter  22.74 
 
 		 425 aa  47  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2378  nucleoside transporter  20.9 
 
 		 423 aa  46.6  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2486  nucleoside transporter  20.9 
 
 		 423 aa  46.6  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2329  nucleoside transporter  20.9 
 
 		 423 aa  46.6  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00432  putative nucleoside permease protein  22.52 
 
 		 397 aa  46.6  0.0009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02392  hypothetical protein  20.99 
 
 		 379 aa  46.6  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02428  predicted 3-phenylpropionic transporter  20.99 
 
 		 379 aa  46.6  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  20.99 
 
 		 379 aa  46.6  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117825  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2374  nucleoside transporter  20.37 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  27.81 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3369  nucleoside transporter  22.85 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0464551 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  27.81 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2089  major facilitator transporter  23.1 
 
 		 386 aa  46.2  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2820  putative 3-phenylpropionic acid transporter  21.18 
 
 		 379 aa  46.6  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0314248  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1132  phenyl proprionate permease family protein  21.18 
 
 		 379 aa  46.6  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1141  putative 3-phenylpropionic acid transporter  21.18 
 
 		 379 aa  46.6  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2285  nucleoside transporter  20.37 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3262  major facilitator transporter  21.88 
 
 		 385 aa  45.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.344996 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0999  nucleoside transporter  20.81 
 
 		 425 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.501568  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1823  major facilitator transporter  20.8 
 
 		 419 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0765  nucleoside:H+ symporter  21.77 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3043  putative 3-phenylpropionic acid transporter  21.26 
 
 		 386 aa  44.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3310  nucleoside permease NupG  22.88 
 
 		 418 aa  44.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49971  predicted protein  28.36 
 
 		 957 aa  44.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  21.96 
 
 		 379 aa  44.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3108  nucleoside permease NupG  23.39 
 
 		 418 aa  45.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661547 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0731  nucleoside transporter  23.12 
 
 		 418 aa  44.3  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02794  nucleoside transporter  23.12 
 
 		 418 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.330512  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02757  hypothetical protein  23.12 
 
 		 418 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 449 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3125  nucleoside permease NupG  23.12 
 
 		 418 aa  44.3  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4268  nucleoside permease NupG  23.12 
 
 		 418 aa  44.3  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.218652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0750  nucleoside transporter  23.12 
 
 		 418 aa  44.3  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0641678 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3397  nucleoside permease NupG  23.12 
 
 		 418 aa  44.3  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  25.35 
 
 		 404 aa  43.9  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1748  major facilitator transporter  22.66 
 
 		 397 aa  43.9  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.236817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0134  major facilitator superfamily permease  25.13 
 
 		 332 aa  43.5  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2223  major facilitator transporter  21.47 
 
 		 419 aa  43.5  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2162  hypothetical protein  25.9 
 
 		 393 aa  43.1  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000725543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>