87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0293 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0293  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 443 aa  828    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.410279 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2994  putative transport protein  41.73 
 
 		 431 aa  204  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4948  major facilitator superfamily MFS_1  39.55 
 
 		 406 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.910518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03950  arabinose efflux permease family protein  38.19 
 
 		 430 aa  179  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.538402  normal  0.189258 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3029  major facilitator transporter  34.46 
 
 		 376 aa  138  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000550731  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28210  arabinose efflux permease family protein  35.22 
 
 		 394 aa  136  9e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1428  major facilitator superfamily MFS_1  35.29 
 
 		 384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0126102  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1764  major facilitator transporter  37.99 
 
 		 387 aa  119  7.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0115294  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  24.46 
 
 		 391 aa  93.2  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1684  major facilitator superfamily MFS_1  32.77 
 
 		 395 aa  86.7  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.272501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  23.08 
 
 		 399 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  23.41 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  23.23 
 
 		 505 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  22.14 
 
 		 400 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  22.33 
 
 		 447 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  22.83 
 
 		 506 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  23.08 
 
 		 506 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  22.9 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  22.39 
 
 		 381 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  22.77 
 
 		 381 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  22.39 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  22.39 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  22.94 
 
 		 400 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  22.47 
 
 		 381 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 401 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  22.94 
 
 		 400 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  22.52 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  22.39 
 
 		 384 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2181  putative antibiotic transporter  25.31 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  22.75 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  23.39 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  24.09 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  22.45 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  22.47 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  23.9 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  22.64 
 
 		 399 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  23.59 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  23.77 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  23.59 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  23.59 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  23.59 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  23.38 
 
 		 399 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  23.33 
 
 		 399 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  23.38 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  23.64 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2389  major facilitator transporter  23.79 
 
 		 396 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3372  transporter, major facilitator family  24.18 
 
 		 396 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0859  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0779816  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  19.67 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2416  quinolone resistence NorA protein  23.71 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2624  quinolone resistence NorA protein  24.25 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.321756 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2465  quinolone resistence NorA protein  23.43 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.109645 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2520  quinolone resistence NorA protein  24.25 
 
 		 396 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.531616 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2835  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 379 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000987059  normal  0.0366179 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2333  major facilitator transporter  20.75 
 
 		 403 aa  55.1  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00380329  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2291  major facilitator transporter  20.75 
 
 		 403 aa  55.1  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195371  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3885  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 		 403 aa  53.9  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37466  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  24.55 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  22.82 
 
 		 409 aa  52.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0932  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 426 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4610  major facilitator transporter  22.04 
 
 		 395 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000316795  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  26.71 
 
 		 440 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  22.75 
 
 		 396 aa  51.2  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 396 aa  50.1  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  24.46 
 
 		 410 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  28.12 
 
 		 405 aa  47  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  32.45 
 
 		 394 aa  47  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2815  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 		 421 aa  47  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0033693  hitchhiker  0.00275134 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2493  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 420 aa  47  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.995351  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  26.06 
 
 		 429 aa  47  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  27.47 
 
 		 403 aa  46.6  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 		 443 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5204  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  24.07 
 
 		 395 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1837  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0161  major facilitator superfamily permease  25.45 
 
 		 392 aa  44.7  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 408 aa  44.7  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 395 aa  44.3  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 421 aa  43.9  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 		 435 aa  43.9  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0996  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 389 aa  43.9  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.825084  normal  0.507459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  22.54 
 
 		 396 aa  43.5  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0992  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  26.32 
 
 		 429 aa  43.5  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0509881  normal  0.749387 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1304  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.88 
 
 		 485 aa  43.1  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.153867 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  21.97 
 
 		 395 aa  43.1  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0367  quinolone resistence protein major facilitator family transporter  21.46 
 
 		 370 aa  43.1  0.01  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1734  transporter, putative  23.15 
 
 		 400 aa  43.1  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.184297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>