66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_28210 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_28210  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 		 394 aa  745    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4948  major facilitator superfamily MFS_1  36.15 
 
 		 406 aa  179  5.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.910518  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0293  major facilitator superfamily MFS_1  35.91 
 
 		 443 aa  162  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.410279 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2994  putative transport protein  35.03 
 
 		 431 aa  161  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03950  arabinose efflux permease family protein  38.13 
 
 		 430 aa  156  7e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.538402  normal  0.189258 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3029  major facilitator transporter  35 
 
 		 376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000550731  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1764  major facilitator transporter  37.8 
 
 		 387 aa  117  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0115294  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1428  major facilitator superfamily MFS_1  36.04 
 
 		 384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0126102  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  25.28 
 
 		 381 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  25.63 
 
 		 381 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  25.28 
 
 		 381 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  25 
 
 		 381 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  25 
 
 		 381 aa  99.8  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2835  major facilitator superfamily MFS_1  34.49 
 
 		 379 aa  99.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000987059  normal  0.0366179 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  24.81 
 
 		 381 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 384 aa  97.4  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  24.29 
 
 		 381 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  24.51 
 
 		 399 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1684  major facilitator superfamily MFS_1  35.17 
 
 		 395 aa  95.9  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.272501  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  25.13 
 
 		 381 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  25.57 
 
 		 399 aa  93.2  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  25.57 
 
 		 505 aa  92.8  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  25.25 
 
 		 400 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2181  putative antibiotic transporter  26.84 
 
 		 402 aa  89  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  24.81 
 
 		 400 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  24.81 
 
 		 400 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  25 
 
 		 506 aa  87.4  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  24.24 
 
 		 400 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  24.24 
 
 		 400 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  23.98 
 
 		 447 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  24.75 
 
 		 506 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0859  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 392 aa  82.8  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0779816  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  23.01 
 
 		 391 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  22.81 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  23.33 
 
 		 396 aa  66.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  22.16 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  20.65 
 
 		 399 aa  62  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2389  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 396 aa  62  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3372  transporter, major facilitator family  24.12 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  26.04 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2252  major facilitator superfamily MFS_1  21.97 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  23.48 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2416  quinolone resistence NorA protein  24.14 
 
 		 396 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2465  quinolone resistence NorA protein  24.14 
 
 		 396 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.109645 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2624  quinolone resistence NorA protein  24.14 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.321756 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2520  quinolone resistence NorA protein  24.14 
 
 		 396 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.531616 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  19.75 
 
 		 411 aa  55.1  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2034  major facilitator transporter  27.04 
 
 		 386 aa  52.8  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  19.4 
 
 		 399 aa  49.7  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  19.4 
 
 		 399 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  19.4 
 
 		 399 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00900  Major Facilitator Superfamily transporter  27.19 
 
 		 353 aa  47.8  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  19.4 
 
 		 399 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  19.75 
 
 		 399 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  19.4 
 
 		 399 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  19.4 
 
 		 399 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0775  major facilitator superfamily MFS_1  24.39 
 
 		 385 aa  46.6  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 		 419 aa  46.6  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  19.4 
 
 		 399 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  19.12 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0421  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 		 381 aa  43.9  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000714938  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0911  major facilitator superfamily MFS_1  23.85 
 
 		 410 aa  43.9  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  19.4 
 
 		 399 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  25 
 
 		 390 aa  43.5  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1814  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 		 522 aa  43.1  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0912576 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>