159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_03950 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_03950  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 		 430 aa  808    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.538402  normal  0.189258 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0293  major facilitator superfamily MFS_1  38.82 
 
 		 443 aa  205  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.410279 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4948  major facilitator superfamily MFS_1  39.45 
 
 		 406 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.910518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2994  putative transport protein  42.04 
 
 		 431 aa  191  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3029  major facilitator transporter  36.14 
 
 		 376 aa  160  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000550731  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28210  arabinose efflux permease family protein  36.62 
 
 		 394 aa  153  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1764  major facilitator transporter  39.67 
 
 		 387 aa  123  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0115294  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1428  major facilitator superfamily MFS_1  37.23 
 
 		 384 aa  111  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0126102  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2835  major facilitator superfamily MFS_1  32.17 
 
 		 379 aa  97.8  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000987059  normal  0.0366179 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  22.73 
 
 		 400 aa  93.2  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  23.58 
 
 		 399 aa  91.3  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  23.58 
 
 		 505 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  23.51 
 
 		 400 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  23.83 
 
 		 400 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  23.51 
 
 		 400 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  23.58 
 
 		 400 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  23.58 
 
 		 400 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 401 aa  89.4  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  23.58 
 
 		 506 aa  89  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  23.65 
 
 		 506 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  22.19 
 
 		 391 aa  87.8  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  23.39 
 
 		 447 aa  88.2  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1684  major facilitator superfamily MFS_1  33.05 
 
 		 395 aa  85.9  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.272501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2181  putative antibiotic transporter  26.61 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0859  major facilitator transporter  25.8 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0779816  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3372  transporter, major facilitator family  22.88 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  22.96 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2389  major facilitator transporter  22.88 
 
 		 396 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  21.47 
 
 		 381 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  21.2 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  22.31 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  21.2 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  22.31 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  23.14 
 
 		 381 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  22.31 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  22.31 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  22.05 
 
 		 399 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  21.74 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  22.11 
 
 		 384 aa  66.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  22.45 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  21.8 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  22.58 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  20.92 
 
 		 381 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  20.92 
 
 		 381 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  22.05 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  22.44 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  22.75 
 
 		 399 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  21.74 
 
 		 399 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  21.79 
 
 		 399 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.65 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2465  quinolone resistence NorA protein  25.54 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.109645 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2624  quinolone resistence NorA protein  25.54 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.321756 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2520  quinolone resistence NorA protein  25.54 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.531616 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2416  quinolone resistence NorA protein  25.18 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2718  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  30.23 
 
 		 445 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0133806  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  20.44 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5712  general substrate transporter  29.3 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1841  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.23 
 
 		 418 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  22.75 
 
 		 415 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 		 395 aa  55.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0223  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 		 413 aa  54.3  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.339791  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  26.67 
 
 		 451 aa  52.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4799  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 405 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.896954  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3184  glucarate permease  23.95 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.513823 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3168  glucarate permease  23.95 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.101605 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3121  glucarate permease  23.95 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 		 406 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3103  glucarate permease  23.95 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3283  glucarate permease  23.95 
 
 		 452 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129198  normal  0.747059 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3397  d-galactonate transporter  23.08 
 
 		 450 aa  50.8  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  26.67 
 
 		 440 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0911  major facilitator superfamily MFS_1  22.35 
 
 		 410 aa  50.8  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02634  predicted D-glucarate transporter  26 
 
 		 450 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0899  d-galactonate transporter  26 
 
 		 450 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02596  hypothetical protein  26 
 
 		 450 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2933  glucarate permease  26 
 
 		 450 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3093  glucarate permease  26 
 
 		 450 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.110237  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0923  d-galactonate transporter  26 
 
 		 450 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2927  glucarate permease  26 
 
 		 450 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3084  glucarate permease  26 
 
 		 440 aa  50.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567935  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2559  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 407 aa  49.7  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 425 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.24 
 
 		 416 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  24.4 
 
 		 425 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1015  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 523 aa  48.9  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4050  glucarate permease  26 
 
 		 450 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5034  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 403 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5562  major facilitator transporter  22.92 
 
 		 502 aa  49.3  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.449496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  19.91 
 
 		 411 aa  48.5  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.24 
 
 		 554 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315479  normal  0.0101645 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  27.6 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4735  galactarate transporter  26.4 
 
 		 453 aa  47.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388057  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2291  major facilitator transporter  18.18 
 
 		 403 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2333  major facilitator transporter  18.18 
 
 		 403 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00380329  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  27.24 
 
 		 391 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1153  putative transmembrane efflux transmembrane protein  29.7 
 
 		 400 aa  47.4  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.351745 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  30 
 
 		 454 aa  47.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  27.24 
 
 		 391 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  27.24 
 
 		 391 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>