58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2013 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2013  major facilitator transporter  100 
 
 		 429 aa  841    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1511  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 399 aa  159  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2412  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 		 384 aa  157  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1645  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  25.84 
 
 		 390 aa  90.5  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  23.71 
 
 		 381 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  22.62 
 
 		 381 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  22.07 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  23.2 
 
 		 381 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  23.2 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  23.2 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  23.2 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  23.2 
 
 		 381 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  21.8 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  22.26 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  21.16 
 
 		 396 aa  72.4  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  23.47 
 
 		 396 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  25.7 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  24.52 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  25.7 
 
 		 506 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  25.39 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 		 404 aa  69.3  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  25.39 
 
 		 506 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  24.53 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  25 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  24.53 
 
 		 447 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  24.53 
 
 		 400 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  20.33 
 
 		 408 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  25.39 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  25.39 
 
 		 505 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4610  major facilitator transporter  20.69 
 
 		 395 aa  64.3  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000316795  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0241  major facilitator transporter  23.21 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  21.56 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  21.64 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  24.04 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  23.41 
 
 		 402 aa  56.2  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0911  major facilitator superfamily MFS_1  22.11 
 
 		 410 aa  55.1  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  22.09 
 
 		 410 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0038  major facilitator superfamily permease  23.78 
 
 		 401 aa  53.5  0.000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2291  major facilitator transporter  22.08 
 
 		 403 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2333  major facilitator transporter  22.08 
 
 		 403 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00380329  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  19.83 
 
 		 411 aa  50.4  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2624  quinolone resistence NorA protein  26.88 
 
 		 405 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.321756 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1880  major facilitator transporter  22.07 
 
 		 391 aa  47.4  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  23.05 
 
 		 406 aa  47  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0161  major facilitator superfamily permease  23.78 
 
 		 392 aa  46.6  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23210  arabinose efflux permease family protein  25.55 
 
 		 410 aa  46.6  0.0009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  22.01 
 
 		 391 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3100  major facilitator family transporter  27.35 
 
 		 402 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2465  quinolone resistence NorA protein  26.8 
 
 		 396 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.109645 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3372  transporter, major facilitator family  22.89 
 
 		 396 aa  45.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2181  putative antibiotic transporter  22.63 
 
 		 402 aa  45.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2520  quinolone resistence NorA protein  26.8 
 
 		 396 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.531616 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2416  quinolone resistence NorA protein  26.8 
 
 		 396 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2815  major facilitator superfamily MFS_1  22.47 
 
 		 421 aa  44.7  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0033693  hitchhiker  0.00275134 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  22.08 
 
 		 412 aa  43.9  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3061  major facilitator family transporter  26.94 
 
 		 402 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.586579 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2389  major facilitator transporter  22.59 
 
 		 396 aa  43.5  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>