131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2412 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2412  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
384 aa  733    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1511  major facilitator transporter  46.63 
 
 
399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2013  major facilitator transporter  32.61 
 
 
429 aa  162  9e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  22.75 
 
 
381 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  21.37 
 
 
381 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1645  major facilitator superfamily MFS_1  24.55 
 
 
420 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  22.69 
 
 
381 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  28.45 
 
 
419 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  21.08 
 
 
381 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  21.08 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  21.08 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  21.08 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  22.69 
 
 
399 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  22.41 
 
 
384 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4610  major facilitator transporter  26.83 
 
 
395 aa  72.4  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000316795  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  21.08 
 
 
381 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  26.74 
 
 
402 aa  70.5  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  27.93 
 
 
409 aa  69.7  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 
395 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 
396 aa  67.4  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  25.38 
 
 
400 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  24.62 
 
 
400 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  24.32 
 
 
400 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  22.97 
 
 
404 aa  64.3  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  25.5 
 
 
506 aa  63.9  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  24.5 
 
 
506 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  25.08 
 
 
447 aa  63.2  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  24.11 
 
 
400 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  24.11 
 
 
400 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0241  major facilitator transporter  23.48 
 
 
387 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  27.02 
 
 
390 aa  60.8  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  24.62 
 
 
399 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  29.94 
 
 
396 aa  60.1  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  24.5 
 
 
505 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0911  major facilitator superfamily MFS_1  24.92 
 
 
410 aa  57.8  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  24.49 
 
 
408 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  24.73 
 
 
400 aa  51.2  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2050  multidrug resistance protein MdtH  32.48 
 
 
401 aa  51.2  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2443  multidrug resistance protein MdtH  32.48 
 
 
401 aa  51.2  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.313716  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2162  multidrug resistance protein MdtH  32.48 
 
 
401 aa  51.2  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.976846  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1661  major facilitator transporter  37.1 
 
 
406 aa  50.8  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171561  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  21.79 
 
 
399 aa  50.8  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  27.15 
 
 
388 aa  50.1  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  27.15 
 
 
388 aa  50.1  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  24.87 
 
 
411 aa  50.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  29.53 
 
 
387 aa  49.7  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2815  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 
421 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0033693  hitchhiker  0.00275134 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4354  hypothetical protein  29.61 
 
 
425 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.780411  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1452  hypothetical protein  27.56 
 
 
604 aa  48.9  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4014  membrane protein  29.61 
 
 
425 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2796  multidrug resistance protein MdtH  30.77 
 
 
401 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4407  hypothetical protein  29.61 
 
 
425 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0534995  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4390  hypothetical protein  29.61 
 
 
425 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0846  hypothetical protein  29.61 
 
 
425 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.170502 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4176  hypothetical protein  29.61 
 
 
425 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.100487  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4024  membrane protein  29.61 
 
 
425 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.543971  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4498  hypothetical protein  29.61 
 
 
425 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3773  major facilitator transporter  25.59 
 
 
416 aa  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4127  major facilitator transporter  29.61 
 
 
425 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.372507  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  23.02 
 
 
415 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4294  hypothetical protein  29.61 
 
 
425 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000525268 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  21.89 
 
 
412 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  22.82 
 
 
411 aa  47.4  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  24.54 
 
 
401 aa  47.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6409  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.36 
 
 
578 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2389  major facilitator transporter  21.04 
 
 
396 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 
395 aa  47.4  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.28 
 
 
521 aa  47.4  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3372  transporter, major facilitator family  20.23 
 
 
396 aa  47  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 
406 aa  47  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0531  major facilitator superfamily transporter  30.07 
 
 
388 aa  46.6  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  27.07 
 
 
386 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3674  major facilitator superfamily MFS_1  32.19 
 
 
452 aa  46.2  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
565 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2847  putative MFS transporter family protein  30.89 
 
 
427 aa  45.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.778144  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3739  major facilitator transporter  29.56 
 
 
403 aa  45.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  24.44 
 
 
417 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 
406 aa  46.2  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  24.28 
 
 
406 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  24.73 
 
 
394 aa  45.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.43 
 
 
539 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2181  multidrug resistance protein MdtH  30.21 
 
 
401 aa  45.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.815188  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 
401 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1880  major facilitator transporter  23.56 
 
 
391 aa  45.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0182  hypothetical protein  29.81 
 
 
415 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0967  major facilitator superfamily transporter  24.86 
 
 
390 aa  45.1  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.955052  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.69 
 
 
607 aa  44.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  30.67 
 
 
412 aa  44.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
504 aa  44.3  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  27.25 
 
 
410 aa  44.3  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2542  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
485 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494815  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1263  multidrug resistance protein MdtH  33.91 
 
 
402 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1278  multidrug resistance protein MdtH  33.91 
 
 
402 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.742422 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1234  multidrug resistance protein MdtH  33.91 
 
 
402 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2022  multidrug resistance protein MdtH  33.91 
 
 
402 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2206  multidrug resistance protein MdtH  33.91 
 
 
402 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.151391 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2276  multidrug resistance protein MdtH  31.63 
 
 
398 aa  43.9  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.35 
 
 
529 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0339  major facilitator transporter  33.05 
 
 
400 aa  44.3  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1015  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 
561 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>