31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1645 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1645  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 420 aa  828    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2013  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 429 aa  152  8.999999999999999e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2412  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 384 aa  93.2  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1511  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 399 aa  90.5  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  25.21 
 
 		 381 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  23.81 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  24.16 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  23.6 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  24.7 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  24.7 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  24.7 
 
 		 381 aa  67  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  24.7 
 
 		 381 aa  67  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  23.3 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  23.51 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  21.98 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  24.74 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  21.45 
 
 		 390 aa  53.5  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 446 aa  49.7  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  23.8 
 
 		 419 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2837  major facilitator superfamily transporter  30.52 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  23.1 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0202  hypothetical protein  23.98 
 
 		 387 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0349216  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 417 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0241  major facilitator transporter  22.8 
 
 		 387 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  21.24 
 
 		 395 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  21.94 
 
 		 396 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2935  major facilitator superfamily transporter  29.87 
 
 		 397 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2756  major facilitator superfamily transporter  29.87 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4610  major facilitator transporter  20.14 
 
 		 395 aa  44.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000316795  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  23.65 
 
 		 401 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5849  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 390 aa  43.5  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>