52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2465 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2465  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 417 aa  839    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.18795  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  29.04 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0241  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 387 aa  91.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  23.62 
 
 		 391 aa  66.2  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  24.05 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  22.62 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  23.5 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  21.63 
 
 		 396 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  22.52 
 
 		 400 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  22.85 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  22.43 
 
 		 400 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  22.67 
 
 		 400 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2498  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 435 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.761213  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  22.52 
 
 		 506 aa  50.8  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  22.43 
 
 		 447 aa  50.4  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  22.79 
 
 		 506 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  23.08 
 
 		 399 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  22.61 
 
 		 400 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  23.02 
 
 		 505 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  21.81 
 
 		 400 aa  49.7  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  22.35 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 		 435 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1793  major facilitator family transporter  28.57 
 
 		 438 aa  47.8  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365481 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  23.84 
 
 		 410 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1580  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 438 aa  47.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.177691  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.89 
 
 		 492 aa  47  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  20.63 
 
 		 404 aa  47  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  23.76 
 
 		 381 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3935  major facilitator transporter  27 
 
 		 431 aa  46.6  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  21.58 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4414  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.68 
 
 		 503 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3891  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3694  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  26.01 
 
 		 463 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  26.58 
 
 		 441 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  21.77 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3058  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2514  putative permease  26.11 
 
 		 441 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0562758  normal  0.125545 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3998  major facilitator superfamily transporter  28.57 
 
 		 395 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00916117 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2500  putative permease  26.11 
 
 		 441 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.331934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1133  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 		 397 aa  43.5  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2381  major facilitator transporter  24.84 
 
 		 442 aa  43.1  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.411675  normal  0.855412 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2410  putative permease  26.11 
 
 		 441 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0945591  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2618  putative permease  26.11 
 
 		 441 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.10698  normal  0.142697 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2910  general substrate transporter  28.97 
 
 		 436 aa  43.1  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  21.97 
 
 		 438 aa  43.5  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 404 aa  43.1  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2459  putative permease  26.11 
 
 		 441 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0482459 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 440 aa  43.1  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4532  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 454 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 437 aa  43.1  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2674  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 442 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.758956  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>