96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3759 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3759  major facilitator transporter  100 
 
 		 417 aa  812    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1791  major facilitator transporter  60.2 
 
 		 432 aa  459  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0460445 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0990  major facilitator transporter  43.46 
 
 		 445 aa  327  3e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.592641  normal  0.72949 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2251  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 441 aa  116  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000681216  hitchhiker  4.26317e-17 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5313  MFS permease  25.12 
 
 		 440 aa  80.5  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143469  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5529  major facilitator superfamily MFS_1  24.18 
 
 		 441 aa  79.7  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0196316  hitchhiker  0.00000603603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 435 aa  78.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  29.11 
 
 		 425 aa  73.6  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1220  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 		 429 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.409801 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 436 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  28.33 
 
 		 435 aa  69.7  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  26.24 
 
 		 434 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  24.72 
 
 		 430 aa  65.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  34.59 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  23 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 427 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  24.22 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  22.48 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 431 aa  60.1  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  22.48 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  22.22 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  22.22 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  21.82 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  21.71 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  21.71 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  25.67 
 
 		 429 aa  57.8  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 438 aa  58.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  25.3 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  27.29 
 
 		 442 aa  56.6  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  21.3 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 399 aa  55.8  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  21.96 
 
 		 402 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 422 aa  55.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 434 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 405 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  25.83 
 
 		 457 aa  53.5  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3053  sugar phosphate permease-like  24.6 
 
 		 435 aa  53.1  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  23.83 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 411 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 411 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 410 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2300  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 432 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 409 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1902  major facilitator transporter  25.92 
 
 		 427 aa  50.4  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743695 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  21.77 
 
 		 412 aa  50.4  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  31.37 
 
 		 442 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 418 aa  50.1  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  24.83 
 
 		 433 aa  49.3  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1858  major facilitator transporter  21.43 
 
 		 402 aa  48.9  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.633531  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2533  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 418 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  30.21 
 
 		 432 aa  49.3  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0351  major facilitator superfamily permease  26.13 
 
 		 415 aa  48.1  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.642789  hitchhiker  0.00154369 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  29.28 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3096  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 		 431 aa  48.5  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556654 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 419 aa  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1234  major facilitator transporter  24.49 
 
 		 433 aa  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  27.14 
 
 		 436 aa  47.8  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5287  major facilitator superfamily MFS_1  27.61 
 
 		 405 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0508736  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 411 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 442 aa  46.6  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2073  major facilitator superfamily MFS_1  24.2 
 
 		 430 aa  46.6  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.621  normal  0.521626 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 410 aa  46.6  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  25.83 
 
 		 414 aa  46.6  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0305  major facilitator superfamily MFS_1  29.58 
 
 		 432 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382232  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7416  Permeases of the major facilitator superfamily  25.6 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0651373  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2623  major facilitator transporter  21.38 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 		 405 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  24.65 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 413 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4386  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3517  major facilitator transporter  24.72 
 
 		 428 aa  45.1  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4678  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 404 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 411 aa  44.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  23.02 
 
 		 486 aa  44.3  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0872  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 		 453 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0593371  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  20.1 
 
 		 407 aa  43.9  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0698  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 412 aa  43.9  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.733103  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 408 aa  43.5  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0868  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 		 453 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 400 aa  43.5  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0177  oxalate/formate antiporter  22.62 
 
 		 400 aa  43.5  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 427 aa  43.5  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0820  major facilitator transporter  29.7 
 
 		 453 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  21.05 
 
 		 442 aa  43.1  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>