177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3257 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  100 
 
 		 411 aa  778    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  42.75 
 
 		 404 aa  291  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  46.11 
 
 		 369 aa  289  8e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  45.62 
 
 		 387 aa  262  6e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  45.19 
 
 		 426 aa  262  8e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  35 
 
 		 397 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  45.93 
 
 		 387 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  43.6 
 
 		 390 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  44.22 
 
 		 391 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  45.45 
 
 		 387 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  41.64 
 
 		 408 aa  236  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  45.32 
 
 		 387 aa  229  5e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  47.23 
 
 		 386 aa  223  6e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  38.36 
 
 		 399 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  44.88 
 
 		 404 aa  213  7e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  40.23 
 
 		 389 aa  209  6e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  35 
 
 		 402 aa  192  8e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 402 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  37.29 
 
 		 397 aa  189  9e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  34.83 
 
 		 402 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  36.18 
 
 		 410 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  36.18 
 
 		 410 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  34.92 
 
 		 395 aa  171  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  36.13 
 
 		 400 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  32.47 
 
 		 393 aa  153  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 		 408 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  33.89 
 
 		 399 aa  138  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1342  major facilitator superfamily MFS_1  36.69 
 
 		 400 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  32.41 
 
 		 416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2518  major facilitator superfamily transporter  36.41 
 
 		 397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  hitchhiker  0.00753009 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 		 411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 425 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  27.73 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0643  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 400 aa  120  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  30.64 
 
 		 408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1573  major facilitator superfamily MFS_1  31.1 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.120591 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  33.59 
 
 		 405 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  29.6 
 
 		 414 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 442 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  28.81 
 
 		 402 aa  107  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  29.04 
 
 		 415 aa  107  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0642  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 397 aa  106  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 		 416 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  29.36 
 
 		 402 aa  103  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  31.21 
 
 		 403 aa  100  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  33.44 
 
 		 419 aa  97.8  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 		 422 aa  97.1  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 403 aa  93.2  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  28.13 
 
 		 415 aa  89.7  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  35.37 
 
 		 395 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  33.2 
 
 		 416 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  33.2 
 
 		 416 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  33.2 
 
 		 401 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 		 404 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 433 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1547  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 394 aa  77.8  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.197507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6024  major facilitator transporter  32.26 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252453  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 414 aa  67  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2920  major facilitator transporter  35.53 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 		 409 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  31.96 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  25.13 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  28.57 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 406 aa  59.7  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3111  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 408 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 436 aa  55.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  28.16 
 
 		 480 aa  56.2  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3759  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 417 aa  56.2  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  30.17 
 
 		 407 aa  55.8  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2451  major facilitator transporter  32.85 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.367941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 410 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1427  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 417 aa  54.3  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220727 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  39.39 
 
 		 401 aa  53.5  0.000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 427 aa  53.1  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2258  major facilitator superfamily MFS_1  33.12 
 
 		 421 aa  53.1  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 410 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 417 aa  52.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 412 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 417 aa  52.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 400 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 412 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 402 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 436 aa  51.2  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 		 413 aa  51.2  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2999  major facilitator transporter  34.59 
 
 		 408 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.548657  normal  0.0674552 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>