107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1381 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  100 
 
 		 386 aa  709    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  75.2 
 
 		 426 aa  523  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  78.27 
 
 		 391 aa  496  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  79.26 
 
 		 387 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  60.39 
 
 		 408 aa  373  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  68.39 
 
 		 404 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  58.49 
 
 		 387 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  60.91 
 
 		 387 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  60.62 
 
 		 387 aa  354  2e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  48 
 
 		 389 aa  273  4.0000000000000004e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  41.98 
 
 		 404 aa  267  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  46.34 
 
 		 411 aa  265  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  42.98 
 
 		 369 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  46.28 
 
 		 399 aa  248  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  45.43 
 
 		 397 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  42.94 
 
 		 402 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  41.64 
 
 		 402 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  43.8 
 
 		 402 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  39.6 
 
 		 390 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  44.16 
 
 		 395 aa  223  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  41.62 
 
 		 393 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1342  major facilitator superfamily MFS_1  43.65 
 
 		 400 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2518  major facilitator superfamily transporter  43.85 
 
 		 397 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  hitchhiker  0.00753009 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  32.46 
 
 		 397 aa  176  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  37.78 
 
 		 410 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  38.06 
 
 		 410 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  39.5 
 
 		 400 aa  164  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  36.24 
 
 		 416 aa  152  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  34.48 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 417 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  35.03 
 
 		 399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  34.85 
 
 		 425 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  37.11 
 
 		 414 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  34.35 
 
 		 399 aa  143  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0643  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 400 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  32.91 
 
 		 411 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 		 408 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1573  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 		 396 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.120591 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  31.3 
 
 		 414 aa  131  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  37.25 
 
 		 432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0642  major facilitator transporter  32.71 
 
 		 397 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 416 aa  117  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  32.77 
 
 		 401 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 416 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  32.28 
 
 		 416 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  33.04 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  31.02 
 
 		 402 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  31.83 
 
 		 442 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  31.04 
 
 		 408 aa  110  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 403 aa  109  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  35.27 
 
 		 405 aa  107  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  31.02 
 
 		 402 aa  105  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 403 aa  100  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1547  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 394 aa  100  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.197507 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  31.3 
 
 		 395 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  28.96 
 
 		 415 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 414 aa  89.7  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 		 419 aa  88.6  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 415 aa  87  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  35.33 
 
 		 404 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6024  major facilitator transporter  33.74 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252453  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  28.41 
 
 		 433 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 		 422 aa  77.8  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2258  major facilitator superfamily MFS_1  39.35 
 
 		 421 aa  71.2  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  31.4 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  33.52 
 
 		 409 aa  70.1  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 402 aa  57  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  28.02 
 
 		 410 aa  56.2  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  25.73 
 
 		 442 aa  53.5  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  25.25 
 
 		 425 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  23.49 
 
 		 431 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  23.72 
 
 		 430 aa  50.8  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  34.64 
 
 		 405 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 403 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  23.19 
 
 		 431 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  27.83 
 
 		 407 aa  48.9  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 		 402 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5540  major facilitator transporter  35.77 
 
 		 410 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.477353 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0314  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 403 aa  47.4  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 414 aa  47.4  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 		 442 aa  47.4  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 		 433 aa  46.6  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 418 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  28.63 
 
 		 433 aa  46.6  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 405 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2759  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 		 472 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526196 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  23.77 
 
 		 437 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4451  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  28.28 
 
 		 414 aa  44.3  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  26.07 
 
 		 528 aa  44.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 436 aa  44.3  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  24.05 
 
 		 427 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  25.86 
 
 		 404 aa  43.9  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>